EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01309 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:10038637-10039523 
TF binding sites/motifs
Number: 66             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:10038931-10038941AAAAGGAATT+3.01
blmp-1MA0537.1chrI:10039493-10039503AAGAAGATGA+3.02
blmp-1MA0537.1chrI:10039496-10039506AAGATGAGGA+3.34
blmp-1MA0537.1chrI:10039227-10039237AAGAAGAAAC+3.39
blmp-1MA0537.1chrI:10039490-10039500AAGAAGAAGA+3.39
blmp-1MA0537.1chrI:10039007-10039017AAAAGGAATG+3.42
blmp-1MA0537.1chrI:10038912-10038922AAAAAGAATG+3.5
blmp-1MA0537.1chrI:10039152-10039162TTTCATCTTC-3.95
blmp-1MA0537.1chrI:10039224-10039234AAAAAGAAGA+4.05
blmp-1MA0537.1chrI:10039130-10039140TTTCTTTTCT-4.09
blmp-1MA0537.1chrI:10038903-10038913AAAATGAAGA+4.15
blmp-1MA0537.1chrI:10039257-10039267AAAATGAAAG+5.03
ceh-22MA0264.1chrI:10038924-10038934CCTATTGAAA+3.06
ceh-22MA0264.1chrI:10038665-10038675CTAAAGTGCC-3.39
ceh-48MA0921.1chrI:10039469-10039477TATCGGTT-4.8
ces-2MA0922.1chrI:10039464-10039472TACTTTAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:10039171-10039179TATGTAGT-3.46
che-1MA0260.1chrI:10039233-10039238AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:10038844-10038849AAGCC+3.7
dsc-1MA0919.1chrI:10039276-10039285ATAATTGGT+3.09
dsc-1MA0919.1chrI:10039276-10039285ATAATTGGT-3.09
dsc-1MA0919.1chrI:10038687-10038696CTAATTATT+3.51
dsc-1MA0919.1chrI:10038687-10038696CTAATTATT-3.51
efl-1MA0541.1chrI:10038787-10038801AATTTCCGCCAGTC-3.75
elt-3MA0542.1chrI:10039092-10039099GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:10039416-10039423GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:10038963-10038970GATAAGC-3.71
elt-3MA0542.1chrI:10038952-10038959ATTATCA+3.81
elt-3MA0542.1chrI:10038900-10038907GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:10039219-10039233CGAAGAAAAAGAAG+3.35
eor-1MA0543.1chrI:10039222-10039236AGAAAAAGAAGAAA+3.49
eor-1MA0543.1chrI:10038901-10038915AAAAAATGAAGAAA+3.62
eor-1MA0543.1chrI:10039136-10039150TTCTACATCTTCCC-3.64
eor-1MA0543.1chrI:10039128-10039142GTTTTCTTTTCTAC-3.71
eor-1MA0543.1chrI:10039254-10039268GAGAAAATGAAAGA+3.8
fkh-2MA0920.1chrI:10038839-10038846TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:10038993-10039000TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:10039127-10039134TGTTTTC-3.08
fkh-2MA0920.1chrI:10038747-10038754TCAACAA+3.66
hlh-1MA0545.1chrI:10039370-10039380GACAGTTGCG+3.24
hlh-1MA0545.1chrI:10038834-10038844ACGATTGTTG-3.26
hlh-1MA0545.1chrI:10039371-10039381ACAGTTGCGG-3.79
lim-4MA0923.1chrI:10039277-10039285TAATTGGT-3.25
lim-4MA0923.1chrI:10038687-10038695CTAATTAT+3.33
lim-4MA0923.1chrI:10038688-10038696TAATTATT-3.46
lin-14MA0261.1chrI:10038726-10038731AACAT+3.14
pal-1MA0924.1chrI:10038990-10038997GAATAAA+3.15
pal-1MA0924.1chrI:10038653-10038660TTATTAC-4.57
pha-4MA0546.1chrI:10038966-10038975AAGCAACCA+3.02
pha-4MA0546.1chrI:10039128-10039137GTTTTCTTT-3.27
skn-1MA0547.1chrI:10039150-10039164ATTTTCATCTTCGT-3.96
skn-1MA0547.1chrI:10039494-10039508AGAAGATGAGGAAC+4.04
skn-1MA0547.1chrI:10038726-10038740AACATCATCATCTC-4.38
skn-1MA0547.1chrI:10038904-10038918AAATGAAGAAAAAG+5.07
sma-4MA0925.1chrI:10038711-10038721TGGTCTAGAC+3.13
sma-4MA0925.1chrI:10038714-10038724TCTAGACCTT-3.26
sma-4MA0925.1chrI:10038794-10038804GCCAGTCACT-3.91
unc-62MA0918.1chrI:10039367-10039378CGTGACAGTTG-4.24
unc-86MA0926.1chrI:10039103-10039110TAGTCAT+3.37
vab-7MA0927.1chrI:10039277-10039284TAATTGG-3.03
vab-7MA0927.1chrI:10038688-10038695TAATTAT-3.06
vab-7MA0927.1chrI:10038688-10038695TAATTAT+3.75
zfh-2MA0928.1chrI:10039275-10039285AATAATTGGT+3.06
zfh-2MA0928.1chrI:10038889-10038899TAAATTAAGT-3.25
zfh-2MA0928.1chrI:10038686-10038696TCTAATTATT+3.44
zfh-2MA0928.1chrI:10038687-10038697CTAATTATTT-3.89
Enhancer Sequence
AAACCTTATC TAGGTTTTAT TACAACGTCT AAAGTGCCAA ACAGATTTTT CTAATTATTT 60
TTTCTGTATG CTCCTGGTCT AGACCTTCGA ACATCATCAT CTCGTCACCA TCAACAAGTT 120
GATCCCTTGT GGAAGAAAGC ACTCTAATCC AATTTCCGCC AGTCACTAGA TCGACGAGTT 180
TTTTTTTGGC GTTTTCGACG ATTGTTGAAG CCTCCGTGTA GTTTTCACAC GAACTTTGTA 240
TTTCTCATAA TTTAAATTAA GTTGAAAAAA TGAAGAAAAA GAATGGACCT ATTGAAAAGG 300
AATTTTTGCC AAGATATTAT CAAGCTGATA AGCAACCATT GTGTGACGAA CGGGAATAAA 360
TAAATCAAAA AAAAGGAATG ATCTTCAAAA TCTTTGCGAA GATCAATTTG TATTTCTTGG 420
TGACACCAAA ACACCTGGAT TTCTGATCTA CAGGTGATCA AAGGATTAGT CATACTAAGG 480
AATTTTCACG TGTTTTCTTT TCTACATCTT CCCATTTTCA TCTTCGTAAC GTCTTATGTA 540
GTAGAACCAA AAAGTTCGAT GGTCTTGAAG CAGGGACCAC GACGAAGAAA AAGAAGAAAC 600
GATGGGAACG GATCATAGAG AAAATGAAAG ATTATGCTAA TAATTGGTAT AAATTATACC 660
AAAACGAGCT ACGTTTGTGA CGTTCATAAA ATACCAAAAA GGTTTAAAAG TTTCAAACTT 720
CACATCATGA CGTGACAGTT GCGGTTATAG TTAACTGAGA ACTCAACTTC TAATAGCTTG 780
ATTAAAAAGT TAGTTCACCT GTTATGTTGT TTCTTGATTT TCGGCATTAC TTTATCGGTT 840
TTCACCTGAC TTGAAGAAGA AGATGAGGAA CTTATATGAG TTGAGA 886