EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01262 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9700504-9701467 
TF binding sites/motifs
Number: 60             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9701414-9701424TAAGTGAGGG+3.09
blmp-1MA0537.1chrI:9700839-9700849TTTCTCCCTT-3.28
blmp-1MA0537.1chrI:9700890-9700900GAGGAGAAGG+3.2
blmp-1MA0537.1chrI:9700914-9700924GAAGTGAATG+3.32
blmp-1MA0537.1chrI:9701021-9701031AAGAAGAGGA+3.3
blmp-1MA0537.1chrI:9701035-9701045AGAGAGAATG+3.4
blmp-1MA0537.1chrI:9701013-9701023AGGGTGAGAA+3.67
blmp-1MA0537.1chrI:9701456-9701466TTTCCATTTT-3.67
blmp-1MA0537.1chrI:9700957-9700967GGAGTGAGAG+3.81
blmp-1MA0537.1chrI:9701291-9701301AAATTGATAA+3.86
blmp-1MA0537.1chrI:9700509-9700519TTTCATTTTT-4.02
blmp-1MA0537.1chrI:9700760-9700770GAAAAGAAAG+4.05
blmp-1MA0537.1chrI:9700841-9700851TCTCCCTTTC-4.95
ceh-22MA0264.1chrI:9700752-9700762TTCAAGTGGA-4.79
ces-2MA0922.1chrI:9701170-9701178TATAAAAT-3.12
ces-2MA0922.1chrI:9701215-9701223TACAAAAT-3.19
ces-2MA0922.1chrI:9701214-9701222TTACAAAA+3.45
che-1MA0260.1chrI:9700973-9700978GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:9700732-9700737AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:9701137-9701142AAACC+3.36
dsc-1MA0919.1chrI:9701427-9701436TTAATTATA+3.05
dsc-1MA0919.1chrI:9701427-9701436TTAATTATA-3.05
elt-3MA0542.1chrI:9701296-9701303GATAAAT-3.23
elt-3MA0542.1chrI:9701018-9701025GAGAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:9701372-9701379TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrI:9700755-9700769AAGTGGAAAAGAAA+3.28
eor-1MA0543.1chrI:9700838-9700852GTTTCTCCCTTTCC-3.55
eor-1MA0543.1chrI:9700832-9700846CCCTTTGTTTCTCC-3.74
eor-1MA0543.1chrI:9700834-9700848CTTTGTTTCTCCCT-4.27
eor-1MA0543.1chrI:9700840-9700854TTCTCCCTTTCCTT-4.56
eor-1MA0543.1chrI:9701016-9701030GTGAGAAGAAGAGG+4.8
fkh-2MA0920.1chrI:9700536-9700543TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9700588-9700595TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9700664-9700671TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9700532-9700539TAAATAA+3.21
fkh-2MA0920.1chrI:9701274-9701281TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:9701160-9701167TGTTTAC-4.05
hlh-1MA0545.1chrI:9700817-9700827TCACCTGGTT-3.16
lim-4MA0923.1chrI:9701428-9701436TAATTATA-3.37
lim-4MA0923.1chrI:9701427-9701435TTAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrI:9701302-9701307TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:9700947-9700952CGTTC-3.36
pal-1MA0924.1chrI:9701277-9701284TTATTTC-3.12
pal-1MA0924.1chrI:9700661-9700668GAATAAA+3.15
pal-1MA0924.1chrI:9701428-9701435TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:9701455-9701464ATTTCCATT-3.09
pha-4MA0546.1chrI:9700529-9700538AAGTAAATA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:9700767-9700776AAGTAAAGA+3.25
pha-4MA0546.1chrI:9701161-9701170GTTTACAGT-3.25
pha-4MA0546.1chrI:9700867-9700876ATTTGCTCA-4.39
skn-1MA0547.1chrI:9700642-9700656ATAAGCTGAAAAAT+4.23
sma-4MA0925.1chrI:9701048-9701058ATGACTAGAT+3.21
sma-4MA0925.1chrI:9701251-9701261TCCAGAAATC-3.63
unc-86MA0926.1chrI:9700739-9700746TCCATAT-3.14
unc-86MA0926.1chrI:9701043-9701050TGCAGAT-3.18
unc-86MA0926.1chrI:9700626-9700633TATGAAT+3.58
vab-7MA0927.1chrI:9700524-9700531CAATGAA+3.08
vab-7MA0927.1chrI:9701428-9701435TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:9701427-9701437TTAATTATAA-3.29
zfh-2MA0928.1chrI:9701426-9701436TTTAATTATA+3.72
Enhancer Sequence
AACGATTTCA TTTTTTGACC CAATGAAGTA AATAAAAATT CTAAAAACTT CAAAATTTAA 60
ACGCTCAAAA CAATTTTGAC TATTTCAACA AGTTCACCAA ACCTCCAAAA TTATCAAAAT 120
TTTATGAATC TGTGAAAAAT AAGCTGAAAA ATTTTTGGAA TAAAAATTGT AATCCCCAAA 180
AGAGTTTCTC TAGAAGAATC TAGACTATCT TCAGAGAATG TACCTAAGAA ACCTATCCAT 240
ATCACTTATT CAAGTGGAAA AGAAAGTAAA GATTTGTGTG TCAAACGGTA GTTGGCAACC 300
CAAACATTGA TCATCACCTG GTTCTCGACC CTTTGTTTCT CCCTTTCCTT GACTTTTCCT 360
AATATTTGCT CACAAAGAAC TAGTGGGAGG AGAAGGTGAC TTGTTTGTTG GAAGTGAATG 420
ACGTGGCGAA AGGAGGAACA ATGCGTTCCT GTGGGAGTGA GAGGGTATCG TTTCAGCCAA 480
AACGATACGA TTAAAAAGTA AAAGTTCAGA GGGTGAGAAG AAGAGGAATC AAGAGAGAAT 540
GCAGATGACT AGATATAGAA GTTCTCAGTT TTCTCGCTTT AAATCACCTG AAGCTTATGG 600
AACTTCAGAG TTAGCTTTGT GACGGTGTGA GTGAAACCAT TTTCAAAGTT GTGAGATGTT 660
TACAGTTATA AAATTGTGCG AAAAACTTTA CGTTTTAGTT TCCGAAAATA TTACAAAATT 720
TCAGAAATCG GCGAGTGCCA AAATGCTTCC AGAAATCAAT CTGCAGAAAT TTTTTATTTC 780
AAGTTGGAAA TTGATAAATG TTCAGTTTTG GCGAAATTCC CATTTGAATG CCCAATTGCA 840
TTGCCTTTCT TAGTAAATTA TTTCTAGTTT TATCATTGAC TTATGTTTTT CTTATATTTT 900
CTGATCTGTA TAAGTGAGGG AATTTAATTA TAATTTTCCA AAAATTTAGT TATTTCCATT 960
TTT 963