EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01261 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9683412-9683921 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9683717-9683727AGGGTGAGAC+3.21
blmp-1MA0537.1chrI:9683497-9683507AAAACGATAT+3.2
blmp-1MA0537.1chrI:9683908-9683918TTTCCCTTAT-3.39
blmp-1MA0537.1chrI:9683828-9683838CTTCTCCTTT-3.61
blmp-1MA0537.1chrI:9683638-9683648AAAGTGATAA+4.38
blmp-1MA0537.1chrI:9683830-9683840TCTCCTTTTT-4.56
ceh-22MA0264.1chrI:9683630-9683640ACACTCGAAA+3.86
dsc-1MA0919.1chrI:9683759-9683768TTAATTATA+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:9683759-9683768TTAATTATA-3.33
elt-3MA0542.1chrI:9683492-9683499GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:9683512-9683519GTTAAAA-3.14
eor-1MA0543.1chrI:9683826-9683840TTCTTCTCCTTTTT-3.51
eor-1MA0543.1chrI:9683714-9683728AAGAGGGTGAGACG+4.06
fkh-2MA0920.1chrI:9683627-9683634TATACAC+3.16
fkh-2MA0920.1chrI:9683674-9683681TAAAAAA+3.4
lim-4MA0923.1chrI:9683759-9683767TTAATTAT+3.12
lim-4MA0923.1chrI:9683760-9683768TAATTATA-3.37
pal-1MA0924.1chrI:9683760-9683767TAATTAT-3.54
unc-62MA0918.1chrI:9683817-9683828GACGACAGCTT-3.37
vab-7MA0927.1chrI:9683645-9683652TAATGAA+3.35
vab-7MA0927.1chrI:9683760-9683767TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:9683865-9683875TAAATTAAAT-3.14
zfh-2MA0928.1chrI:9683759-9683769TTAATTATAT-3.37
zfh-2MA0928.1chrI:9683758-9683768ATTAATTATA+3.87
Enhancer Sequence
AAGAATGTTT TTTGGCAAAA CTCCAAAGTT TCAAAAACTT TGTCCAGTTG AAATATTGTC 60
TCTAAATAGA CCTGAAATGT GATTAAAAAC GATATATTTT GTTAAAACAT TCCAAAATTT 120
TTCAGATTTT TCAAAACTTT CAGTTAAAAT TTTGGTAGAA TACCAAAATT CCAAATCCTT 180
AACCTACTTC ATCTGTAACA TTTTTGGTGC TGGAATATAC ACTCGAAAAG TGATAATGAA 240
ATGGCATAGG CACAAAAAAT AGTAAAAAAA GGGACAACAA TTGTACACAA AGATTTGGTG 300
GAAAGAGGGT GAGACGAGGA TTTGAGGCGA CGACCCCCTC GTACCTATTA ATTATATTTC 360
AGGAGAACTA ACGGAACGAG AGCGATCCTA AGTCAATGCT TGAGGGACGA CAGCTTCTTC 420
TCCTTTTTAT ATTTTACCCA AACTTTCCTG GCTTAAATTA AATCAAACTC GGGCAAGACT 480
TGGTTAAAGA TCATTCTTTC CCTTATCTA 509