EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01251 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9560530-9561340 
TF binding sites/motifs
Number: 65             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9560571-9560581TATCTTCCTT-3.11
blmp-1MA0537.1chrI:9561117-9561127GGAAAGATAA+3.19
blmp-1MA0537.1chrI:9561110-9561120AAGGCGAGGA+3.33
blmp-1MA0537.1chrI:9560617-9560627AGAAAGAAAT+3.56
blmp-1MA0537.1chrI:9561321-9561331TTTCTTTTTC-4.91
ceh-48MA0921.1chrI:9561028-9561036TTCAATAC+3.13
ceh-48MA0921.1chrI:9560666-9560674ATCAATAC+3.21
ces-2MA0922.1chrI:9560735-9560743TGTTTAAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:9561014-9561022TAATACAA+3.97
che-1MA0260.1chrI:9560530-9560535AAACG+3.06
dsc-1MA0919.1chrI:9560899-9560908ATAATTAAA+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:9560899-9560908ATAATTAAA-3.33
dsc-1MA0919.1chrI:9561195-9561204TTAATTGAT+3.46
dsc-1MA0919.1chrI:9561195-9561204TTAATTGAT-3.46
dsc-1MA0919.1chrI:9560649-9560658TTAATTATT+3.67
dsc-1MA0919.1chrI:9560649-9560658TTAATTATT-3.67
dsc-1MA0919.1chrI:9561202-9561211ATAATTGAC+3
dsc-1MA0919.1chrI:9561202-9561211ATAATTGAC-3
elt-3MA0542.1chrI:9560638-9560645TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:9560569-9560576TTTATCT+3
elt-3MA0542.1chrI:9561122-9561129GATAAAA-3
fkh-2MA0920.1chrI:9560763-9560770TATTTAC-3.03
fkh-2MA0920.1chrI:9560581-9560588TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9560697-9560704TAAACAA+3.48
fkh-2MA0920.1chrI:9560735-9560742TGTTTAA-3.48
fkh-2MA0920.1chrI:9560793-9560800TCAACAA+3.76
fkh-2MA0920.1chrI:9560861-9560868TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrI:9560785-9560795AGCATTTGTC+3.32
lim-4MA0923.1chrI:9561203-9561211TAATTGAC-3.03
lim-4MA0923.1chrI:9560649-9560657TTAATTAT+3.24
lim-4MA0923.1chrI:9560899-9560907ATAATTAA+3.57
lim-4MA0923.1chrI:9560650-9560658TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrI:9561196-9561204TAATTGAT-3.5
lim-4MA0923.1chrI:9560900-9560908TAATTAAA-3
lin-14MA0261.1chrI:9560631-9560636AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:9561026-9561031TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:9561309-9561314TGTTC-3.14
mab-3MA0262.1chrI:9561308-9561320ATGTTCCAAACG+3.51
pal-1MA0924.1chrI:9560900-9560907TAATTAA+3.54
pal-1MA0924.1chrI:9560650-9560657TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:9561147-9561156GAGAAAATA+3.19
pha-4MA0546.1chrI:9560862-9560871GTTTATAAA-3.31
pha-4MA0546.1chrI:9560790-9560799TTGTCAACA+3.41
pha-4MA0546.1chrI:9560664-9560673GTATCAATA+3.51
pha-4MA0546.1chrI:9561043-9561052GTTGGTACA-3.51
pha-4MA0546.1chrI:9560732-9560741GTTTGTTTA-3.76
pha-4MA0546.1chrI:9560764-9560773ATTTACTCG-4.02
pha-4MA0546.1chrI:9561076-9561085ATTTGCACA-4.3
pha-4MA0546.1chrI:9560993-9561002GTTTGCACA-4.54
skn-1MA0547.1chrI:9560800-9560814ATTGTCAACTATTC-4.14
skn-1MA0547.1chrI:9560569-9560583TTTATCTTCCTTTG-4.35
skn-1MA0547.1chrI:9560789-9560803TTTGTCAACAAATT-4.44
snpc-4MA0544.1chrI:9561226-9561237TCAGCCGACAG-3.12
unc-62MA0918.1chrI:9560532-9560543ACGGACAGTTT-3.07
unc-62MA0918.1chrI:9560799-9560810AATTGTCAACT+3.1
unc-62MA0918.1chrI:9560825-9560836GCTGACAGCCG-3.76
unc-86MA0926.1chrI:9560896-9560903TGAATAA-3.58
vab-7MA0927.1chrI:9561203-9561210TAATTGA+3.15
vab-7MA0927.1chrI:9560900-9560907TAATTAA+4.09
vab-7MA0927.1chrI:9560650-9560657TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:9561194-9561204GTTAATTGAT+3.24
zfh-2MA0928.1chrI:9560649-9560659TTAATTATTG-3.47
zfh-2MA0928.1chrI:9560898-9560908AATAATTAAA+3.5
zfh-2MA0928.1chrI:9560899-9560909ATAATTAAAA-3.64
zfh-2MA0928.1chrI:9560648-9560658GTTAATTATT+3.93
Enhancer Sequence
AAACGGACAG TTTGTTATAA TCGTTGTAAT TCTTCATGTT TTATCTTCCT TTGTTGAAGA 60
ATTTCTTGCT TCTCGACTAC AAATTGAAGA AAGAAATCTA GAACATATTT TGTCACTGGT 120
TAATTATTGG AAAAGTATCA ATACAACCTG GGTAATAGTT TTCAAGTTAA ACAATCTGCC 180
GAAATTTTAA TGGAGAAAAT ATGTTTGTTT AATAAAAGCT TTTGAAATTT TCGTATTTAC 240
TCGCAAATAC ACCTCAGCAT TTGTCAACAA ATTGTCAACT ATTCCACTAC TAGTTGCTGA 300
CAGCCGAGGC AGTTTTTCCG AGTCTGAAAA TTGTTTATAA ATGTTTTTAA AAGAATCAAC 360
TATCCATGAA TAATTAAAAA CTAACATATT AAGTTACCAA CTACAGTAAT CTATCAAAAA 420
TTTCGAATTT TTTAAAAATT AGATTGTAAT CCAGATTAAA GTTGTTTGCA CAAGTCTTCT 480
AAAATAATAC AATGGATGTT CAATACGTGT TATGTTGGTA CATCGGATTT GTTTCCGGAC 540
TATACTATTT GCACAATATT ATTACAGGAA TTCAATTTGA AAGGCGAGGA AAGATAAAAT 600
CACATCAATT GGAATTAGAG AAAATAAACC TTTTCCAGTA TACTTGTATG AAAATTTGAT 660
ATATGTTAAT TGATAATTGA CTTTCAGATT TTAAGATCAG CCGACAGAAA ATTACATTTT 720
TCAACGAAAT ATTGAAGGCT CTTTAAAATT CAGTATTACG GGATTTGGTC ATTTTAAAAT 780
GTTCCAAACG TTTTCTTTTT CTACACTTTA 810