EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01249 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9554927-9555742 
TF binding sites/motifs
Number: 55             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9555436-9555446AGATGGATGA+3.02
blmp-1MA0537.1chrI:9555250-9555260TCTCTCTCAC-3.13
blmp-1MA0537.1chrI:9555430-9555440AGAACGAGAT+3.28
blmp-1MA0537.1chrI:9555226-9555236GAAAGGAAGA+3.42
blmp-1MA0537.1chrI:9555588-9555598AAAGTGAAGT+3.69
blmp-1MA0537.1chrI:9555248-9555258TCTCTCTCTC-4.43
blmp-1MA0537.1chrI:9555533-9555543AAAATGAGAA+4.88
ceh-22MA0264.1chrI:9555163-9555173GTACTCCACA+3.37
ceh-22MA0264.1chrI:9555662-9555672TTTAAGTAGA-3.38
ceh-22MA0264.1chrI:9555344-9555354ATCAAGTGCT-3.74
ceh-22MA0264.1chrI:9555063-9555073GCACTTAACA+3.99
ceh-22MA0264.1chrI:9555393-9555403GCACTTGAGA+4.54
ceh-48MA0921.1chrI:9554944-9554952TTCAATAT+3.27
ces-2MA0922.1chrI:9555211-9555219TTACACAG+3.15
ces-2MA0922.1chrI:9555545-9555553CTATGTAA+3.27
che-1MA0260.1chrI:9555617-9555622GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:9555235-9555240AAGCC+3.7
daf-12MA0538.1chrI:9555687-9555701AAACAATCCCATTC-3.09
dsc-1MA0919.1chrI:9555481-9555490GCAATTAGG+3.15
dsc-1MA0919.1chrI:9555481-9555490GCAATTAGG-3.15
efl-1MA0541.1chrI:9555267-9555281ATTGTGCGCGAGAA-3.44
efl-1MA0541.1chrI:9555268-9555282TTGTGCGCGAGAAA+3.45
efl-1MA0541.1chrI:9555721-9555735AAAAGCGCGAAAAG+4
elt-3MA0542.1chrI:9555538-9555545GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:9555054-9555061TTTATCA+3.21
elt-3MA0542.1chrI:9555444-9555451GATACGA-3.45
eor-1MA0543.1chrI:9555247-9555261CTCTCTCTCTCACT-4.21
eor-1MA0543.1chrI:9555249-9555263CTCTCTCTCACTGT-4.79
eor-1MA0543.1chrI:9555224-9555238CAGAAAGGAAGAAG+4
fkh-2MA0920.1chrI:9554930-9554937TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrI:9555531-9555538TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9555052-9555059TGTTTAT-3.81
hlh-1MA0545.1chrI:9555345-9555355TCAAGTGCTG-3.35
hlh-1MA0545.1chrI:9555169-9555179CACAATTGAC+3.66
lim-4MA0923.1chrI:9555208-9555216TGATTACA-3.12
lim-4MA0923.1chrI:9555336-9555344TAATTGTG-3.32
lim-4MA0923.1chrI:9555481-9555489GCAATTAG+3.7
lin-14MA0261.1chrI:9555496-9555501AACAG+3.01
pal-1MA0924.1chrI:9555208-9555215TGATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrI:9555336-9555343TAATTGT-3.42
pha-4MA0546.1chrI:9555209-9555218GATTACACA-3.01
pha-4MA0546.1chrI:9555053-9555062GTTTATCAT-3.28
pha-4MA0546.1chrI:9555325-9555334ATTTGTCTG-3.35
pha-4MA0546.1chrI:9555479-9555488GAGCAATTA+3
skn-1MA0547.1chrI:9554956-9554970ATCATCATCCTGTG-3.97
skn-1MA0547.1chrI:9555380-9555394TAATGATGATGATG+4.44
skn-1MA0547.1chrI:9554953-9554967ATTATCATCATCCT-5.53
sma-4MA0925.1chrI:9555621-9555631CCTAGACCTT-3.06
snpc-4MA0544.1chrI:9555237-9555248GCCGCCGATGC-3.18
unc-86MA0926.1chrI:9555262-9555269TATTCAT+3.68
vab-7MA0927.1chrI:9555380-9555387TAATGAT+3.12
vab-7MA0927.1chrI:9555336-9555343TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrI:9555332-9555339TGATTAA+3.27
vab-7MA0927.1chrI:9555482-9555489CAATTAG-3.38
zfh-2MA0928.1chrI:9555334-9555344ATTAATTGTG+3.2
Enhancer Sequence
ATATGTTTTC GATGCCATTC AATATCATTA TCATCATCCT GTGGGGGGTT TTTCAATGTT 60
ATAGGTGGGT GGACTACTGG GATTACGGTA GCTTCTTCTA CACACTCAAC ACCGACTCGA 120
TGCGATGTTT ATCATAGCAC TTAACAAGTG CGAGAATCGT TGAATCTCTT AGTACTCAAG 180
TGACGACTAT CATCAGGCAC TACGGTAGTT TTTAGATTGG TGTGAATCGT GTATAGGTAC 240
TCCACAATTG ACGTGATATC TAACCATCGA AGACACCGAC TTGATTACAC AGATTAACAG 300
AAAGGAAGAA GCCGCCGATG CTCTCTCTCT CACTGTATTC ATTGTGCGCG AGAAAAGAGT 360
TCGCCATTTT GCAGTGTGAA TCGAAGAGAG ACTCGTTTAT TTGTCTGATT AATTGTGATC 420
AAGTGCTGAT TATCGCGCTC AACTCGCAGA ATCTAATGAT GATGATGCAC TTGAGAAGTT 480
GTATTGCACG GGTGTGGAAC CGAAGAACGA GATGGATGAT ACGATTTATA TTAGTGATCA 540
CAGGAAATGG GAGAGCAATT AGGAAATTGA ACAGTGTCAA GGGACGTTTT CGAGACATTT 600
TAAATAAAAA TGAGAAAACT ATGTAAGGAT AATCGTGTCA AATACAAAAA TCTTAATGGA 660
AAAAGTGAAG TTTTCATTGA GACTGTAACG GTTTCCTAGA CCTTTTCCAG CATTCTAAGT 720
ACTTTCTCAA AGTAGTTTAA GTAGACGAAG GCAAACTATC AAACAATCCC ATTCGAAAGT 780
AGTTGAAATT GGGAAAAAGC GCGAAAAGCC GGATG 815