EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01248 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9553087-9553588 
TF binding sites/motifs
Number: 35             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:9553280-9553293TTACTGTACCAAT-3.62
ceh-48MA0921.1chrI:9553332-9553340ATCGATCT+3.09
ceh-48MA0921.1chrI:9553331-9553339GATCGATC-3.31
ces-2MA0922.1chrI:9553463-9553471AATATAAT-3.12
ces-2MA0922.1chrI:9553226-9553234ATATGTAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:9553215-9553223TTACGTCA+3.59
ces-2MA0922.1chrI:9553292-9553300TTGCGTAA+3.59
ces-2MA0922.1chrI:9553216-9553224TACGTCAT-3.7
ces-2MA0922.1chrI:9553293-9553301TGCGTAAT-4.46
che-1MA0260.1chrI:9553440-9553445AAGCG+3.2
dsc-1MA0919.1chrI:9553211-9553220TTAATTACG+3.71
dsc-1MA0919.1chrI:9553211-9553220TTAATTACG-3.71
elt-3MA0542.1chrI:9553148-9553155GAGAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:9553521-9553528GTTAAGA-3.58
elt-3MA0542.1chrI:9553566-9553573GATATGA-3.58
elt-3MA0542.1chrI:9553514-9553521GATAAGT-3.75
fkh-2MA0920.1chrI:9553300-9553307TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:9553200-9553207TAAACAT+3.81
fkh-2MA0920.1chrI:9553231-9553238TAAACAG+3.89
hlh-1MA0545.1chrI:9553160-9553170CACAATTGTT+3.46
hlh-1MA0545.1chrI:9553161-9553171ACAATTGTTT-3.52
lim-4MA0923.1chrI:9553212-9553220TAATTACG-4.33
pal-1MA0924.1chrI:9553197-9553204CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrI:9553252-9553259CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrI:9553220-9553227TCATAAA+3.79
pal-1MA0924.1chrI:9553212-9553219TAATTAC-4.27
pal-1MA0924.1chrI:9553297-9553304TAATAAA+4.57
pha-4MA0546.1chrI:9553411-9553420ATCTAAACA+3.08
pha-4MA0546.1chrI:9553344-9553353CTTTACATT-3.2
pha-4MA0546.1chrI:9553228-9553237ATGTAAACA+4.61
pha-4MA0546.1chrI:9553550-9553559GAGCAAATA+4.64
pha-4MA0546.1chrI:9553454-9553463ATTTACTTT-4.73
vab-7MA0927.1chrI:9553212-9553219TAATTAC-3.88
zfh-2MA0928.1chrI:9553211-9553221TTAATTACGT-3.54
zfh-2MA0928.1chrI:9553210-9553220ATTAATTACG+4.17
Enhancer Sequence
TACAATGATT GACAAATTGA ATAGGGACCT TCATAATTTC AGTCTGAACG AAGTTAGTTT 60
TGAGAAGATT TACCACAATT GTTTTAATAA CATCATAATC TACATTGTCA CAATAAACAT 120
GAGATTAATT ACGTCATAAA TATGTAAACA GAGATCTCAA TCTGACAATA AAGTTCCCCT 180
GAGGATGACA CGATTACTGT ACCAATTGCG TAATAAATAA GGTACTCAAC TCTCGTTTGA 240
TCTTGATCGA TCTATCTCTT TACATTTTCT CTGTGAGCTG AAATACGGTA CAGTACCACA 300
TACAAAGAAA AGTATAAGTA TCAAATCTAA ACAGTGGCTC TTTGACACGC CAGAAGCGAT 360
TTCTAATATT TACTTTAATA TAATTCAATT CAAGGTGCGG GTAGTTAGAA AGTCAATTTA 420
TGTGTGTGAT AAGTGTTAAG AGATGCCCAT CACAAGAGTG GTAGAGCAAA TAAAATTTTG 480
ATATGATTTG TCGATTAGCG A 501