EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01247 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9542866-9543703 
TF binding sites/motifs
Number: 51             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9543554-9543564GAATTGATGA+3.04
blmp-1MA0537.1chrI:9543615-9543625AGAGGGAGAA+4.25
blmp-1MA0537.1chrI:9543114-9543124AAAATGAAAA+5.09
blmp-1MA0537.1chrI:9542937-9542947TTTCCCTTTT-5.25
ceh-22MA0264.1chrI:9543142-9543152CTACTTGAAT+4
ceh-48MA0921.1chrI:9543360-9543368CATCGATC-3.05
ceh-48MA0921.1chrI:9543131-9543139TATTGAAT-3.27
ces-2MA0922.1chrI:9543475-9543483TATATAAT-3.35
ces-2MA0922.1chrI:9543492-9543500TATGTCAT-3.55
ces-2MA0922.1chrI:9543257-9543265TAATATAA+4.08
daf-12MA0538.1chrI:9543266-9543280TACGAGAGTGTTTT+3.17
daf-12MA0538.1chrI:9543270-9543284AGAGTGTTTTTGAA+3.61
daf-12MA0538.1chrI:9542919-9542933ATCCAAACACGCAA-3.91
dpy-27MA0540.1chrI:9543646-9543661TTGCGCAAAGGAACA-3.97
efl-1MA0541.1chrI:9543643-9543657TTTTTGCGCAAAGG-3.49
efl-1MA0541.1chrI:9543000-9543014CTTTGCCGCCGTTG-4.09
elt-3MA0542.1chrI:9543564-9543571GATAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrI:9543559-9543566GATGAGA-3.35
eor-1MA0543.1chrI:9543612-9543626ACGAGAGGGAGAAC+3.86
fkh-2MA0920.1chrI:9543390-9543397TCTACAA+3.02
fkh-2MA0920.1chrI:9543607-9543614TATTTAC-3.03
fkh-2MA0920.1chrI:9543012-9543019TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9543641-9543648TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9543015-9543022TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:9543106-9543113TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:9543215-9543222TATACAA+3.45
hlh-1MA0545.1chrI:9542972-9542982AACATTTGGT+3.11
hlh-1MA0545.1chrI:9543522-9543532CCAACTGTTA-3.56
hlh-1MA0545.1chrI:9543320-9543330ACAGCTGGTA-3.61
hlh-1MA0545.1chrI:9543319-9543329AACAGCTGGT+4.35
lim-4MA0923.1chrI:9543300-9543308TAATTACA-3.22
lin-14MA0261.1chrI:9543513-9543518AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:9543657-9543662AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrI:9543230-9543242AAGTTGCAATAA+3.57
pal-1MA0924.1chrI:9543085-9543092TCATAAA+3.29
pal-1MA0924.1chrI:9543300-9543307TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrI:9543139-9543146TTACTAC-3
pha-4MA0546.1chrI:9543187-9543196GAGCAGATA+3.01
skn-1MA0547.1chrI:9543555-9543569AATTGATGAGATAA+4.6
sma-4MA0925.1chrI:9543387-9543397GTGTCTACAA+3.04
sma-4MA0925.1chrI:9543204-9543214TTGTCTGCCA+3.25
sma-4MA0925.1chrI:9543056-9543066TCCAGAAAAA-3.46
unc-62MA0918.1chrI:9543379-9543390CATGACACGTG-3.24
unc-62MA0918.1chrI:9543301-9543312AATTACAGTTC-3.41
unc-86MA0926.1chrI:9543551-9543558TAGGAAT+3.42
unc-86MA0926.1chrI:9543593-9543600TTCATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrI:9543591-9543598TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:9543300-9543307TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrI:9543300-9543307TAATTAC+3.6
zfh-2MA0928.1chrI:9543298-9543308TATAATTACA+3.23
zfh-2MA0928.1chrI:9543299-9543309ATAATTACAG-3.23
Enhancer Sequence
GTGGTTTTCC TAACTCATAA ATGGGGTATT TTTCAACGAA GAAACTTGAA ATGATCCAAA 60
CACGCAAGGC TTTTCCCTTT TAAAAGTTTA AAAGCTTCAA GCTAAAAACA TTTGGTATAA 120
TTTTTAGGGA TTTTCTTTGC CGCCGTTGTT TTTTATAGCT TTGTCACTAA AAAAATTTAA 180
AGACCGTTAA TCCAGAAAAA TCAAGAGCAA AACCTGCTAT CATAAACTTT TCATCGCGTT 240
TTTTTATGAA AATGAAAAGT TTCTATATTG AATTTACTAC TTGAATACCG AGCATTCGGA 300
TTATTACTTT GTTTTAACCA AGAGCAGATA TAGAAAAATT GTCTGCCAGT ATACAACTCT 360
ATTAAAGTTG CAATAATCTC TATGATACCC ATAATATAAG TACGAGAGTG TTTTTGAATA 420
CATTGCCATA TCTATAATTA CAGTTCTTAT TCTAACAGCT GGTAGAGACA CCTTCTTGCC 480
ATTGTACCAA AACACATCGA TCAACTCATA CATCATGACA CGTGTCTACA AAAAGGGGCA 540
TGAACTGGAA GAACTTTAGC AGGTGGGATA TTTCAGATGG TACAACAATA TATCTTAATC 600
TGATCTTGCT ATATAATATG GAAATTTATG TCATGTTATA TACGTGGAAC AGTAACCCAA 660
CTGTTAACAT CGTCAATACC TGTAGTAGGA ATTGATGAGA TAAGACTGAT ACGCGGGACG 720
ATATATATTC ATAAAAGTTG GTATTTACGA GAGGGAGAAC AATCTAATAT CACATTGTTT 780
TTGCGCAAAG GAACATGAAT TGCCGTTGTC GAAAAACGAT GTATGGAGCC GAGGGGC 837