EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01222 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9331036-9331905 
TF binding sites/motifs
Number: 68             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9331738-9331748TATCTATCTC-3.44
blmp-1MA0537.1chrI:9331718-9331728CTTCATTCTT-3.68
blmp-1MA0537.1chrI:9331409-9331419TATCTCTCTT-3.83
blmp-1MA0537.1chrI:9331234-9331244TTTCAATTTT-3.91
blmp-1MA0537.1chrI:9331268-9331278TATCTTTTTT-4.01
blmp-1MA0537.1chrI:9331411-9331421TCTCTCTTTC-4.12
ceh-22MA0264.1chrI:9331073-9331083TAGAAGTGCA-3.28
ceh-48MA0921.1chrI:9331059-9331067CATTGATT-3.03
ces-2MA0922.1chrI:9331276-9331284TTTGTAAT-3.45
ces-2MA0922.1chrI:9331419-9331427TCTGTAAT-3.55
ces-2MA0922.1chrI:9331674-9331682TAATGCAA+4
daf-12MA0538.1chrI:9331809-9331823TGTGTGTGTGCCTG+3.78
daf-12MA0538.1chrI:9331813-9331827TGTGTGCCTGCTCA+4.54
dsc-1MA0919.1chrI:9331694-9331703TTAATGAGC+3.23
dsc-1MA0919.1chrI:9331694-9331703TTAATGAGC-3.23
dsc-1MA0919.1chrI:9331212-9331221CTAATTAGC+5.95
dsc-1MA0919.1chrI:9331212-9331221CTAATTAGC-5.95
efl-1MA0541.1chrI:9331160-9331174AACCGCGCGATTAA+3.09
efl-1MA0541.1chrI:9331868-9331882ATTTTCCGTCTTCT-3.43
elt-3MA0542.1chrI:9331578-9331585TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:9331291-9331298TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:9331407-9331414CTTATCT+3.31
elt-3MA0542.1chrI:9331877-9331884CTTCTCA+3.35
elt-3MA0542.1chrI:9331387-9331394GTTATCA+3.89
elt-3MA0542.1chrI:9331305-9331312GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:9331363-9331370GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:9331516-9331523TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrI:9331537-9331551CTCTCTGTCTGAGA-3.02
eor-1MA0543.1chrI:9331573-9331587GTTTTTTTCTCAAA-3.25
eor-1MA0543.1chrI:9331731-9331745TTCTCTCTATCTAT-3.32
eor-1MA0543.1chrI:9331412-9331426CTCTCTTTCTGTAA-3.47
eor-1MA0543.1chrI:9331710-9331724CTGTGTCTCTTCAT-3.51
eor-1MA0543.1chrI:9331179-9331193CGGAGAAACAAAAA+3.67
eor-1MA0543.1chrI:9331410-9331424ATCTCTCTTTCTGT-3.87
eor-1MA0543.1chrI:9331733-9331747CTCTCTATCTATCT-3.89
eor-1MA0543.1chrI:9331725-9331739CTTTAATTCTCTCT-3.98
eor-1MA0543.1chrI:9331181-9331195GAGAAACAAAAAAA+3.99
eor-1MA0543.1chrI:9331735-9331749CTCTATCTATCTCT-4.3
eor-1MA0543.1chrI:9331708-9331722TTCTGTGTCTCTTC-5.32
fkh-2MA0920.1chrI:9331525-9331532TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9331366-9331373AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9331295-9331302TCAACAA+3.76
fkh-2MA0920.1chrI:9331264-9331271TGTTTAT-3.81
hlh-1MA0545.1chrI:9331258-9331268GACAAATGTT+3.38
hlh-1MA0545.1chrI:9331259-9331269ACAAATGTTT-3.38
lim-4MA0923.1chrI:9331695-9331703TAATGAGC-3.58
lim-4MA0923.1chrI:9331212-9331220CTAATTAG+4.96
lim-4MA0923.1chrI:9331213-9331221TAATTAGC-4.96
lin-14MA0261.1chrI:9331550-9331555AACAG+3.01
mab-3MA0262.1chrI:9331215-9331227ATTAGCAAAATT-3.53
mab-3MA0262.1chrI:9331858-9331870CAAGGCACCAAT-3.58
pal-1MA0924.1chrI:9331517-9331524TTATCAC-3.1
pha-4MA0546.1chrI:9331776-9331785AAGCAAACT+3.14
pha-4MA0546.1chrI:9331676-9331685ATGCAAAAA+3.15
pha-4MA0546.1chrI:9331451-9331460ATTGACAAA-3.36
pha-4MA0546.1chrI:9331292-9331301TTGTCAACA+3.41
pha-4MA0546.1chrI:9331265-9331274GTTTATCTT-3.62
skn-1MA0547.1chrI:9331342-9331356AAATAATGAAATAT+3.04
skn-1MA0547.1chrI:9331291-9331305TTTGTCAACAAATT-4.31
sma-4MA0925.1chrI:9331541-9331551CTGTCTGAGA+3.2
unc-62MA0918.1chrI:9331853-9331864CGTGACAAGGC-3.23
vab-7MA0927.1chrI:9331345-9331352TAATGAA+3.35
vab-7MA0927.1chrI:9331213-9331220TAATTAG+3.51
vab-7MA0927.1chrI:9331213-9331220TAATTAG-3.51
vab-7MA0927.1chrI:9331695-9331702TAATGAG-3.88
zfh-2MA0928.1chrI:9331557-9331567AAAATTAATG-3.13
zfh-2MA0928.1chrI:9331211-9331221GCTAATTAGC+4.26
zfh-2MA0928.1chrI:9331212-9331222CTAATTAGCA-4.26
Enhancer Sequence
AGGAAATTAT ATTGCTTAGA GATCATTGAT TCTTTAGTAG AAGTGCACAT TGAAAATGGC 60
AATCACTATC AGGAAAACTG GAGATTGGAA TTTAGAAAAA ATCTTATACT TTTCTGCAAA 120
AAAAAACCGC GCGATTAAGA ACTCGGAGAA ACAAAAAAAA ACATTTTCGT TGCTTGCTAA 180
TTAGCAAAAT TTTCCAAGTT TCAATTTTGT TTCAAGGACG TCGACAAATG TTTATCTTTT 240
TTTGTAATTT TTGGTTTTGT CAACAAATTG AAAAAAAATC TGTTGCAAAA CTTTCCAAAA 300
ATTAAAAAAT AATGAAATAT GGACTTTGAA AAAACAAAAG ATATTTTTGT CGTTATCATA 360
TTCTCATACC TCTTATCTCT CTTTCTGTAA TATTCTCTCA ATAGATTCTG TCTCTATTGA 420
CAAATGAGCT GCTCGGCGAG CAGCAGTGAG TTGGCTTGTT CTTCGTGACT CCACTTATCT 480
TTTATCACTT CAACAACACT TCTCTCTGTC TGAGAACAGA AAAAATTAAT GAAAAATGTT 540
TTTTTCTCAA ATCGAGTTTT CTTAAAGTTT AAACGGACTA ACAAAATGAA TGTCAGTATT 600
CAAGTAACTT CCCACTAATA AAATGAAATT CCCAAACATA ATGCAAAAAG TCAGAATGTT 660
AATGAGCATC TATTCTGTGT CTCTTCATTC TTTAATTCTC TCTATCTATC TCTTCGTCCC 720
GCCCGTCTTC TCCGAAACAA AAGCAAACTG TGCTCCGATG CGGCGCGGAG CCCTGTGTGT 780
GTGCCTGCTC ATTTCAAAAA TGAGCACACT CAAATGTCGT GACAAGGCAC CAATTTTCCG 840
TCTTCTCAAC CACATTTTTC TTAGTTTTC 869