EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01218 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9298630-9299535 
TF binding sites/motifs
Number: 58             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9299437-9299447AAATTGAATT+3.04
blmp-1MA0537.1chrI:9299333-9299343AAAAGGAATC+3.06
blmp-1MA0537.1chrI:9298954-9298964TAGGTGAAAA+3.07
blmp-1MA0537.1chrI:9299348-9299358AGGAAGAGGA+3.08
blmp-1MA0537.1chrI:9299351-9299361AAGAGGAGAT+3.17
blmp-1MA0537.1chrI:9299164-9299174AGGTGGAAAA+3.31
blmp-1MA0537.1chrI:9299371-9299381TCTCTTCTTT-3.3
blmp-1MA0537.1chrI:9298682-9298692AAAAGGAATA+3.42
blmp-1MA0537.1chrI:9298961-9298971AAAATGAGTA+3.48
blmp-1MA0537.1chrI:9299383-9299393ATTCTTTTTC-3.5
blmp-1MA0537.1chrI:9299378-9299388TTTCCATTCT-3.75
blmp-1MA0537.1chrI:9299345-9299355AAAAGGAAGA+3.88
blmp-1MA0537.1chrI:9299475-9299485AGATGGAAAA+3.89
blmp-1MA0537.1chrI:9299170-9299180AAAAAGATAA+3.99
che-1MA0260.1chrI:9299203-9299208AAACG+3.06
dpy-27MA0540.1chrI:9299456-9299471TCTCGCGAATAGACA-3.48
elt-3MA0542.1chrI:9299064-9299071TTTATCC+3.02
elt-3MA0542.1chrI:9299175-9299182GATAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrI:9299035-9299042TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrI:9299472-9299486GGGAGATGGAAAAG+3.62
fkh-2MA0920.1chrI:9298993-9299000TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9299090-9299097TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9299213-9299220TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9298896-9298903TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:9298989-9298996TAAATAA+3.21
fkh-2MA0920.1chrI:9298875-9298882TAAACAC+3.95
fkh-2MA0920.1chrI:9298642-9298649TATACAG+3
hlh-1MA0545.1chrI:9299093-9299103ACAAATGTTG-3.32
hlh-1MA0545.1chrI:9299399-9299409ACATCTGTGA-3.37
hlh-1MA0545.1chrI:9298691-9298701AGCAGGTGTC+3.53
hlh-1MA0545.1chrI:9298692-9298702GCAGGTGTCC-3.56
hlh-1MA0545.1chrI:9299092-9299102AACAAATGTT+3.74
hlh-1MA0545.1chrI:9298654-9298664CGCAGCTGAC+3.92
lin-14MA0261.1chrI:9298919-9298924AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrI:9299503-9299508AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrI:9299036-9299043TTATCAC-3.1
pal-1MA0924.1chrI:9299083-9299090TTATTAT-3.63
pal-1MA0924.1chrI:9299216-9299223TTATTAT-3.63
pal-1MA0924.1chrI:9298736-9298743TTGTTAC-3
pal-1MA0924.1chrI:9298847-9298854TTATTGC-4.12
pha-4MA0546.1chrI:9298856-9298865TTTTGCATA-3.03
pha-4MA0546.1chrI:9298986-9298995CTGTAAATA+3.11
pha-4MA0546.1chrI:9299327-9299336ATGCAAAAA+3.15
pha-4MA0546.1chrI:9298791-9298800TTTTGCATT-3.15
pha-4MA0546.1chrI:9299487-9299496GTTTCCATT-3.24
skn-1MA0547.1chrI:9298631-9298645AGACGCTGACATAT+4.17
skn-1MA0547.1chrI:9299053-9299067ATTTTCAGCATTTT-5.63
sma-4MA0925.1chrI:9299262-9299272ATTTCTAGAA+3.21
sma-4MA0925.1chrI:9299463-9299473AATAGACAGG-3.2
sma-4MA0925.1chrI:9299519-9299529TCCAGAAATT-3.71
snpc-4MA0544.1chrI:9298655-9298666GCAGCTGACAC-4.97
unc-62MA0918.1chrI:9299464-9299475ATAGACAGGGG-3.08
unc-62MA0918.1chrI:9299366-9299377AATTGTCTCTT+3.09
unc-62MA0918.1chrI:9298635-9298646GCTGACATATA-3.14
unc-62MA0918.1chrI:9299395-9299406AGAGACATCTG-3.51
unc-86MA0926.1chrI:9298859-9298866TGCATAT-3.11
unc-86MA0926.1chrI:9298836-9298843TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrI:9298838-9298845TTAATAA-3.32
Enhancer Sequence
TAGACGCTGA CATATACAGA AATACGCAGC TGACACTTTG AAATGAATTG GAAAAAGGAA 60
TAGCAGGTGT CCTTAACCAA AATGTACGGG TGACTTATTA TAAGGTTTGT TACAACAGTC 120
ATTCTAAAAT GCTTTGGAAC TTTCAAAATC TCAGTTAAAG TTTTTGCATT TTCAAAATTT 180
CAAAATCTTG GAACTTTTAG AAACTTTATT AATAAATTTA TTGCGTTTTT GCATATTTCA 240
AGCTATAAAC ACAAAGAACT AAAACATAAA TAAAACCTAA CTCTTGGTGA ACACAATTTT 300
AGTCTCAATA AACCTAAACT ATGATAGGTG AAAAATGAGT AACTACTAGT TCTTGACTGT 360
AAATAAAAAT ATTTAAAATT TTTTCGAAAA GATTTACAAT GCCATTTTAT CACCAAATGA 420
GTTATTTTCA GCATTTTATC CACTGGTGCT ACTTTATTAT TCAACAAATG TTGTCCAAAA 480
TAAAAGGCTG AATTCAAACG TTTTGAGAAA TCTTAAGTGA ATCGAGACAT GAAAAGGTGG 540
AAAAAGATAA GAATCAACGA CTTATTTTAG ATGAAACGGT ACATTTTTAT TATGTCGGGA 600
CAAAATTAGG ATGATGGCCT ATATAGTTTA AAATTTCTAG AATCATCGTG TTTTAGAACT 660
TTAAATCTAA ATATCAAAAA TTGTAATACT GAATGAAATG CAAAAAAGGA ATCAGAAAAG 720
GAAGAGGAGA TGTTAGAATT GTCTCTTCTT TCCATTCTTT TTCGTAGAGA CATCTGTGAT 780
GAGTCTTCAC ACATGAGACG ACATAGAAAA TTGAATTTCA GGCGATTCTC GCGAATAGAC 840
AGGGGAGATG GAAAAGTGTT TCCATTCACA AGGAACACGG CTTTTTAGAT CCAGAAATTA 900
TTACG 905