EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01205 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9219450-9220067 
TF binding sites/motifs
Number: 58             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9219530-9219540AGGAAGAGAC+3.06
blmp-1MA0537.1chrI:9219894-9219904TTTCCACTTT-3.16
blmp-1MA0537.1chrI:9219517-9219527TTTCACTTTT-6.34
ceh-22MA0264.1chrI:9219774-9219784ACACTCCAAC+3.43
ceh-48MA0921.1chrI:9219848-9219856TATTGGTG-3.01
ceh-48MA0921.1chrI:9220014-9220022TATTGGCC-3.02
ceh-48MA0921.1chrI:9219489-9219497TATCGAAA-3.07
ceh-48MA0921.1chrI:9219957-9219965AATTGGTT-3.09
ceh-48MA0921.1chrI:9219880-9219888TATTGGTA-3.29
ces-2MA0922.1chrI:9220002-9220010TTGTATAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:9219592-9219600TTATGAAA+3.25
ces-2MA0922.1chrI:9219593-9219601TATGAAAT-3.43
che-1MA0260.1chrI:9219807-9219812GCTTC-3.2
che-1MA0260.1chrI:9219962-9219967GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:9219766-9219780CTACAAATACACTC-3.32
daf-12MA0538.1chrI:9219634-9219648ATTCACACACACTT-3.55
daf-12MA0538.1chrI:9219636-9219650TCACACACACTTCC-4.2
dsc-1MA0919.1chrI:9219682-9219691TTGATTAGG+3.08
dsc-1MA0919.1chrI:9219682-9219691TTGATTAGG-3.08
dsc-1MA0919.1chrI:9219797-9219806ATAATTAAA+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:9219797-9219806ATAATTAAA-3.33
dsc-1MA0919.1chrI:9219955-9219964TTAATTGGT+3.6
dsc-1MA0919.1chrI:9219955-9219964TTAATTGGT-3.6
efl-1MA0541.1chrI:9219867-9219881TTTGACGGAAATTT+3.13
elt-3MA0542.1chrI:9219581-9219588GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:9219884-9219891GGTAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:9219943-9219950TTTAGCA+3.07
eor-1MA0543.1chrI:9219629-9219643CAGAGATTCACACA+3.29
eor-1MA0543.1chrI:9219573-9219587AAGATAATGAGAAA+3.55
eor-1MA0543.1chrI:9219621-9219635GAGAGACTCAGAGA+6.24
fkh-2MA0920.1chrI:9219915-9219922TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9219934-9219941TTTTTAC-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9219886-9219893TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrI:9219510-9219517TGTTTAT-3.81
hlh-1MA0545.1chrI:9219667-9219677TCAATTGATC-3.12
lim-4MA0923.1chrI:9219683-9219691TGATTAGG-3.41
lim-4MA0923.1chrI:9219797-9219805ATAATTAA+3.57
lim-4MA0923.1chrI:9219956-9219964TAATTGGT-3.99
lim-4MA0923.1chrI:9219798-9219806TAATTAAA-3
lin-14MA0261.1chrI:9220051-9220056AACAT+3.14
pal-1MA0924.1chrI:9219798-9219805TAATTAA+3.54
pha-4MA0546.1chrI:9219581-9219590GAGAAAATA+3.06
pha-4MA0546.1chrI:9219908-9219917CTGCAAATA+3.06
pha-4MA0546.1chrI:9219515-9219524ATTTTCACT-3.11
pha-4MA0546.1chrI:9219935-9219944TTTTACATT-3.2
pha-4MA0546.1chrI:9220035-9220044GAACAAATA+3.74
pha-4MA0546.1chrI:9219511-9219520GTTTATTTT-3.87
sma-4MA0925.1chrI:9219835-9219845ATTTCTGTCA+3
unc-62MA0918.1chrI:9219564-9219575AATGACAACAA-3.16
vab-7MA0927.1chrI:9219683-9219690TGATTAG-3.13
vab-7MA0927.1chrI:9219577-9219584TAATGAG-3.19
vab-7MA0927.1chrI:9219956-9219963TAATTGG-3.7
vab-7MA0927.1chrI:9219563-9219570TAATGAC+3
vab-7MA0927.1chrI:9219798-9219805TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:9219796-9219806AATAATTAAA+3.54
zfh-2MA0928.1chrI:9219797-9219807ATAATTAAAC-3.69
zfh-2MA0928.1chrI:9219954-9219964ATTAATTGGT+3.6
zfh-2MA0928.1chrI:9219951-9219961CGAATTAATT-3.6
Enhancer Sequence
CTATTAAAGG AAAGCCAGGG TGTGGTCACT TCATGATCAT ATCGAAAATT GCCAATTTTA 60
TGTTTATTTT CACTTTTTGA AGGAAGAGAC GATTGGATTA TGAAGATAGT GGATAATGAC 120
AACAAGATAA TGAGAAAATA TATTATGAAA TGAGAAATAT CATTTGGATT TGAGAGACTC 180
AGAGATTCAC ACACACTTCC CGAATATGGC ATATATATCA ATTGATCTTC AATTGATTAG 240
GTACTCTATT TGTGTTGCAT AGTTATATAT CGAGAAATAT AAATTGTGTA CCCCAAAAAG 300
TACTCCGGGA TATGTGCTAC AAATACACTC CAACATGACT TTAAAAAATA ATTAAACGCT 360
TCAAAAAACT TTAGGTCGTT CAAAAATTTC TGTCAAAGTA TTGGTGAATC GCTAAATTTT 420
GACGGAAATT TATTGGTAAA AAAATTTCCA CTTTTCGACT GCAAATAAAA ATATCTTTCA 480
AAGCTTTTTA CATTTTAGCA ACGAATTAAT TGGTTTCAAA CAATTTTCTT ATAGGCGACG 540
TTCCACATTA AATTGTATAA ATGATATTGG CCAGTCGATT TGAAAGAACA AATAAGTCTC 600
GAACATCTTC TTCCGGA 617