EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01178 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9058069-9058610 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9058317-9058327TAAGAGAAGG+3.13
blmp-1MA0537.1chrI:9058140-9058150GAAGTGAAAG+4.54
ceh-48MA0921.1chrI:9058191-9058199TATTGATG-3.16
ces-2MA0922.1chrI:9058308-9058316TATATAAT-3.3
ces-2MA0922.1chrI:9058443-9058451TTAGGTAA+3.73
ces-2MA0922.1chrI:9058312-9058320TAATATAA+4.08
che-1MA0260.1chrI:9058463-9058468GCTTC-3.2
dsc-1MA0919.1chrI:9058511-9058520CTAATTGCT+3.01
dsc-1MA0919.1chrI:9058511-9058520CTAATTGCT-3.01
elt-3MA0542.1chrI:9058233-9058240TTTATCC+3.02
elt-3MA0542.1chrI:9058198-9058205GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:9058195-9058202GATGAGA-3.35
eor-1MA0543.1chrI:9058222-9058236CACTTTATCTTTTT-3.08
fkh-2MA0920.1chrI:9058295-9058302TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:9058070-9058077TGTTTAA-3.37
fkh-2MA0920.1chrI:9058299-9058306TAAAAAA+3.3
lim-4MA0923.1chrI:9058344-9058352TAATTGCC-3.26
lim-4MA0923.1chrI:9058512-9058520TAATTGCT-3.7
lin-14MA0261.1chrI:9058360-9058365TGTTC-3.01
pha-4MA0546.1chrI:9058292-9058301AGATAAATA+3.46
skn-1MA0547.1chrI:9058191-9058205TATTGATGAGAAAA+4.59
unc-62MA0918.1chrI:9058532-9058543GGCTGTCAATG+3.98
unc-86MA0926.1chrI:9058500-9058507TGCCTAC-3.83
vab-7MA0927.1chrI:9058512-9058519TAATTGC+3.38
Enhancer Sequence
GTGTTTAAAA GGGGCGGTGC TGGCAAAAGA GACGGCAGGC AGTGAGTCAT TTTCAGTTCT 60
GGTTCTTTAG AGAAGTGAAA GTTAAATTTT TTTGTAGTCG ACGACTCTAA GTTTAGGTAG 120
CATATTGATG AGAAAAAAAC TAAAGCAAGA GGTCACTTTA TCTTTTTATC CCAAGATCAT 180
TTTATATCGT ATTTCTCTTT GATTTGATTA TACCTTTACA ACTAGATAAA TAAAAAATAT 240
ATATAATATA AGAGAAGGTA AAGATGAGTC CCTAATAATT GCCATATTTC CTGTTCGCCA 300
GCTGTATCAC AGCAGCTTCA TCAACTCCCC TAAATATCAT ACTACTGCGT AGTATATACT 360
ACTTATATCT AGAATTAGGT AAGAGATATC TCACGCTTCC GTGCCTACCT CAACCTTCTG 420
TCTACGAGCC ATGCCTACAT ATCTAATTGC TAGTCTCGTG CAGGGCTGTC AATGTGCCTT 480
AAGCCTACCT GCATAACTGT GCCTGCTCCA CATGCCTGTC TACCAATTTA CCTTCCTGAT 540
A 541