EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01171 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:9014042-9014774 
TF binding sites/motifs
Number: 59             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9014178-9014188GAGAAGATAG+3.02
blmp-1MA0537.1chrI:9014288-9014298GAGAAGAAGA+3.07
blmp-1MA0537.1chrI:9014291-9014301AAGAAGAGAC+3.28
blmp-1MA0537.1chrI:9014265-9014275AAAAGGAAAT+3.78
blmp-1MA0537.1chrI:9014182-9014192AGATAGAGAA+3.96
blmp-1MA0537.1chrI:9014728-9014738TTTCAATCTC-4.11
ceh-22MA0264.1chrI:9014598-9014608CTTCTTGAAA+3.43
ceh-48MA0921.1chrI:9014573-9014581ATCAATAA+4.21
ceh-48MA0921.1chrI:9014389-9014397ATCGATAA+4.96
che-1MA0260.1chrI:9014535-9014540GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:9014347-9014361ATACAAACACAGCG-3.03
daf-12MA0538.1chrI:9014099-9014113GCACCGTCACGCAC-3.11
daf-12MA0538.1chrI:9014109-9014123GCACAAATGCACAG-3.14
daf-12MA0538.1chrI:9014397-9014411AAACAAACAAGCAG-3.16
daf-12MA0538.1chrI:9014080-9014094ACGCAAACACGCCA-3.93
dsc-1MA0919.1chrI:9014577-9014586ATAATTAAA+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:9014577-9014586ATAATTAAA-3.33
elt-3MA0542.1chrI:9014392-9014399GATAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:9014671-9014678GAAAAGA-3.31
eor-1MA0543.1chrI:9014294-9014308AAGAGACGAATAGA+3.04
eor-1MA0543.1chrI:9014329-9014343AAGAAATAGACAAA+3.22
eor-1MA0543.1chrI:9014288-9014302GAGAAGAAGAGACG+3.73
eor-1MA0543.1chrI:9014187-9014201GAGAAAATCAAAGA+3.88
eor-1MA0543.1chrI:9014179-9014193AGAAGATAGAGAAA+3.95
eor-1MA0543.1chrI:9014327-9014341CAAAGAAATAGACA+4.09
eor-1MA0543.1chrI:9014286-9014300CAGAGAAGAAGAGA+5.68
fkh-2MA0920.1chrI:9014396-9014403AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9014394-9014401TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrI:9014474-9014481TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrI:9014470-9014477TAAATAA+3.21
fkh-2MA0920.1chrI:9014419-9014426TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:9014130-9014137TAAACAA+4.66
lim-4MA0923.1chrI:9014562-9014570GTAATGAA+3.04
lim-4MA0923.1chrI:9014570-9014578CCAATCAA+3.15
lim-4MA0923.1chrI:9014577-9014585ATAATTAA+3.57
lim-4MA0923.1chrI:9014578-9014586TAATTAAA-3
mab-3MA0262.1chrI:9014433-9014445TTGTTGCATTTA+4.5
pal-1MA0924.1chrI:9014563-9014570TAATGAA+3.17
pal-1MA0924.1chrI:9014442-9014449TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrI:9014578-9014585TAATTAA+3.54
pha-4MA0546.1chrI:9014267-9014276AAGGAAATA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:9014080-9014089ACGCAAACA+3.18
pha-4MA0546.1chrI:9014127-9014136GTGTAAACA+3.25
pha-4MA0546.1chrI:9014347-9014356ATACAAACA+3.52
pha-4MA0546.1chrI:9014587-9014596ATTTACAAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:9014397-9014406AAACAAACA+3.85
sma-4MA0925.1chrI:9014683-9014693AAGTCTAGAC+3.11
sma-4MA0925.1chrI:9014686-9014696TCTAGACTTA-3.11
sma-4MA0925.1chrI:9014302-9014312AATAGACACA-3.22
sma-4MA0925.1chrI:9014315-9014325TCTAGTCACA-3.24
sma-4MA0925.1chrI:9014372-9014382GTGACTGGGT+3.85
unc-86MA0926.1chrI:9014274-9014281TATGCAC+3.18
unc-86MA0926.1chrI:9014415-9014422TTAATAA-3.32
vab-7MA0927.1chrI:9014563-9014570TAATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrI:9014578-9014585TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:9014714-9014724GGTAATTTGG+3.08
zfh-2MA0928.1chrI:9014411-9014421AGAATTAATA-3.09
zfh-2MA0928.1chrI:9014576-9014586AATAATTAAA+3.5
zfh-2MA0928.1chrI:9014577-9014587ATAATTAAAT-3.72
Enhancer Sequence
AACGAGTTTT TTCGAATTGT CCACGAAATG ACGAATATAC GCAAACACGC CACTGACGCA 60
CCGTCACGCA CAAATGCACA GAATGGTGTA AACAACTTAT CCAATGAGTT CAGCTGACCA 120
AACCTGAGAG TTTGGGGAGA AGATAGAGAA AATCAAAGAA AAATTGGAGA AGATACATAA 180
ATTTCCTATA AAATACTGTG CATACAACAT CTAAGCAACA ACGAAAAGGA AATATGCACC 240
AGGTCAGAGA AGAAGAGACG AATAGACACA GCATCTAGTC ACATGCAAAG AAATAGACAA 300
AAAACATACA AACACAGCGG TGTGTTTGAA GTGACTGGGT ACACCGGATC GATAAAAACA 360
AACAAGCAGA GAATTAATAA AAAAACATTC ATTGTTGCAT TTATTGTGAA TTCAAAGAAT 420
TACCTCGGTA AATAAAAACT TGGAGAATTT AGAATGATTT CGAATTTTAA ATTTACTTCT 480
GAAAACTACG GGGGTTTCCT GAAAACCAAA TGAACCAAAC GTAATGAACC AATCAATAAT 540
TAAATATTTA CAATTTCTTC TTGAAAATAA GAACTTCGAA TATAATGGCA AGAATTATTC 600
GAATGGGGAA TCATGATTCC CCATCGGATG AAAAGAAACT TAAGTCTAGA CTTACTATTA 660
GGTAGCTTTT TTGGTAATTT GGTAATTTTC AATCTCGTTG CTTCTGATAG TTTTACGAAC 720
TCAGTTTTGA AG 732