EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01159 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8851466-8852343 
TF binding sites/motifs
Number: 50             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8851785-8851795AGAACGAGAG+3.83
blmp-1MA0537.1chrI:8851559-8851569CTTCATTTAC-3
blmp-1MA0537.1chrI:8852030-8852040AAATAGAAAA+4.67
blmp-1MA0537.1chrI:8851844-8851854TTTCAATTTC-4.74
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:8851978-8851991TTAGAATATTTAT+3.37
ceh-22MA0264.1chrI:8851478-8851488CCAATTGAGG+3.32
ceh-22MA0264.1chrI:8851581-8851591TTGGAGTGTG-3.35
ceh-22MA0264.1chrI:8852120-8852130TTTAAGAGGA-3.46
ces-2MA0922.1chrI:8852152-8852160TATCTTAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:8852264-8852272TATGTTAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:8852214-8852222TTATATAA+3.3
ces-2MA0922.1chrI:8852215-8852223TATATAAA-3.3
ces-2MA0922.1chrI:8852056-8852064TATGAAAT-3.43
che-1MA0260.1chrI:8851729-8851734AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:8851468-8851473AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrI:8852311-8852316AAACC+3.36
dsc-1MA0919.1chrI:8852271-8852280TTAATAAGC+3.16
dsc-1MA0919.1chrI:8852271-8852280TTAATAAGC-3.16
eor-1MA0543.1chrI:8852025-8852039ATGAAAAATAGAAA+3.3
eor-1MA0543.1chrI:8851605-8851619CGGAGACATAGATG+3.42
eor-1MA0543.1chrI:8851782-8851796TGAAGAACGAGAGA+3.77
eor-1MA0543.1chrI:8851790-8851804GAGAGACGTAGGCA+4.73
fkh-2MA0920.1chrI:8852282-8852289TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:8851988-8851995TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrI:8852233-8852240AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8851744-8851751TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrI:8851922-8851929TGTTTAA-3.37
fkh-2MA0920.1chrI:8851805-8851812TCAACAC+3.63
lin-14MA0261.1chrI:8851523-8851528AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:8851640-8851645AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:8851837-8851842AACAT+3.14
pal-1MA0924.1chrI:8852256-8852263TAATAAA+3.63
pha-4MA0546.1chrI:8851876-8851885GTTTGATTT-3.11
pha-4MA0546.1chrI:8851985-8851994ATTTATTTA-3.67
pha-4MA0546.1chrI:8852234-8852243AAACAAATA+3.73
skn-1MA0547.1chrI:8852060-8852074AAATCCTGACAAAC+4.55
sma-4MA0925.1chrI:8851715-8851725GTTTCTGTCT+3.07
unc-62MA0918.1chrI:8851553-8851564GCCTGTCTTCA+3.03
unc-62MA0918.1chrI:8852081-8852092AAAGACAACTA-3.34
unc-86MA0926.1chrI:8851972-8851979TACATAT-3.06
unc-86MA0926.1chrI:8852275-8852282TAAGCAT+3.17
unc-86MA0926.1chrI:8851776-8851783GATGCAT+3.18
unc-86MA0926.1chrI:8852269-8852276TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrI:8852271-8852278TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrI:8851992-8851999TATGAAT+3.58
unc-86MA0926.1chrI:8852223-8852230TTCATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrI:8851724-8851731TAATGAA+3.82
zfh-2MA0928.1chrI:8852088-8852098ACTAATTCAA+3.16
zfh-2MA0928.1chrI:8852114-8852124ATTAATTTTA+3.16
zfh-2MA0928.1chrI:8852111-8852121AAAATTAATT-3.16
Enhancer Sequence
AGAAGCGACA GACCAATTGA GGTGAGACGA TTGACTTTTT GGAACGAAAG GAGGATGAAC 60
AGAAGGAGGT GACCACTTTC CAATTGTGCC TGTCTTCATT TACATCCTTG CCACCTTGGA 120
GTGTGACCTT CAGAAATCGC GGAGACATAG ATGGACACCG TTAAGTTTCG TTTGAACATA 180
AAAGCTGTGG ATAGAGTGTT GAATAATTTA AAATTATTCT AACAGAATTC AAAGGTGTTT 240
TTGAAAACAG TTTCTGTCTA ATGAAACGCA TTCTAGAATT TTTACTATTA GTATAAAGTC 300
TAAAACAAAA GATGCATGAA GAACGAGAGA CGTAGGCAGT CAACACAACA CGATGACTCA 360
TAAGCAAGAG GAACATATTT TCAATTTCAC GATGACCACA TCTCTGATCT GTTTGATTTT 420
AGATGTGTCA GAAATGTGTA GGAAACATGG AAGGAGTGTT TAATATATTT AGTGAGTTTC 480
AGAAAAAATT GGAAGAGGCT TGAAGATACA TATTAGAATA TTTATTTATG AATTTTGATT 540
TGAGCAAAAC ATTAGACGGA TGAAAAATAG AAAAAAATCT TTGAATAAGT TATGAAATCC 600
TGACAAACAG CTGCAAAAGA CAACTAATTC AAATGAAACA AAATTAAAAT TAATTTTAAG 660
AGGACTTTCA AACTTGCGGA GAAGTTTATC TTATGGAAAA GTTATTTTTA GGAAATCTTT 720
TACATTAAGC TATTAATCTA AATTTGGTTT ATATAAATTC ATATTTAAAA ACAAATATAA 780
ACTTTCGTCA TAATAAAATA TGTTATTAAT AAGCATTCAA CAAAAAACTC CGCCTATAAA 840
TTCAGAAACC GTGCCCACGG AAGATAAATC GCAATGT 877