EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01128 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8569116-8570200 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8570190-8570200AAGGCGAGAG+3.77
ceh-22MA0264.1chrI:8569687-8569697GCACTCGAAA+4.44
ceh-22MA0264.1chrI:8570083-8570093GTGAAGTGGG-4.57
ceh-48MA0921.1chrI:8569902-8569910TCCGATAA+3.06
ces-2MA0922.1chrI:8569392-8569400TTGCACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:8569161-8569169TGTGCAAT-3.01
ces-2MA0922.1chrI:8569288-8569296TTATATAA+3.3
ces-2MA0922.1chrI:8569289-8569297TATATAAA-3.3
dsc-1MA0919.1chrI:8570063-8570072GTAATTAGA+3.76
dsc-1MA0919.1chrI:8570063-8570072GTAATTAGA-3.76
elt-3MA0542.1chrI:8569905-8569912GATAAGA-3.45
fkh-2MA0920.1chrI:8569270-8569277TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrI:8569544-8569551TGTTTAA-3.37
lim-4MA0923.1chrI:8570064-8570072TAATTAGA-3.15
lim-4MA0923.1chrI:8570063-8570071GTAATTAG+4.08
lin-14MA0261.1chrI:8569733-8569738AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:8569835-8569840AACAG+3.01
mab-3MA0262.1chrI:8569277-8569289AAATGCAAAATT-3.49
pal-1MA0924.1chrI:8569323-8569330TTATTTC-3.12
sma-4MA0925.1chrI:8569835-8569845AACAGACAAA-3.5
sma-4MA0925.1chrI:8569870-8569880TCCAGAAATC-3.63
unc-62MA0918.1chrI:8569883-8569894AAAGACATGTT-3.57
unc-62MA0918.1chrI:8570010-8570021AGCTGTCTTCC+3.83
vab-7MA0927.1chrI:8570064-8570071TAATTAG+3.02
vab-7MA0927.1chrI:8570064-8570071TAATTAG-4.31
zfh-2MA0928.1chrI:8570119-8570129AAAATTAATG-3.09
zfh-2MA0928.1chrI:8570063-8570073GTAATTAGAC-3.53
zfh-2MA0928.1chrI:8570062-8570072AGTAATTAGA+4.02
Enhancer Sequence
TCTCTAACCG GGCTGCTCGA GATTGGCTTA CTAGGGAGTA TTTTTTGTGC AATGTAGAAA 60
TATGAGTTGA AAAACTACTT TTTGGGTATT TGAACTGCTT TTCTACACTA TTCTGAAACA 120
AAATCTTGCC CGTTTGACTT TAAGTATAAA ATTTTGTTTT CAAATGCAAA ATTTATATAA 180
ATTTATAAAG TCAAAACGGG CAAGATTTTA TTTCAGAATA GTGTAGAAAA ACAGGTCAAA 240
TACCCAAAAA GTAGTTTTTC AACTCATATT TCTACATTGC ACAAAAAATA CTCCCTAGTT 300
AGCAGGTCGT TATAAAGTAT CTAGAGACGC AACTTTTGCT CTAAACAGCA ACACCAAGCG 360
CCTCAGTCTT CCGCATCCGG TCCCTGCATC GGAAGAGGCC ATCTAATCTC GTCACCTGGA 420
ATGGGCAGTG TTTAACAACG TAGACCAGAT CGAATGCCCA AAACTTCGTG CCGAACTATT 480
CGATGCAACC GTCCCACCTG CATCAACTTA TGGCTCAGAA ACTTGAACTT TTACAAAAGC 540
CCTTGCTGAA AGAGTCCGAG TTACGCACGC AGCACTCGAA AGAAAATTGA TCGTTCTTAC 600
ACTTACGGAA CAACGCGAAC AGAGCCTCCA TCGGGATGAT GATAGTAAAT TATCCAGTTA 660
GAGATCCACT GATCCACATC GAAAAGATAG CTCTTATGGG ATGGACACGT CACAATGAGA 720
ACAGACAAAA TATGGACAAC ACTGATGGCG GTATTCCAGA AATCGGAAAA GACATGTTGG 780
AAGGCCTCCG ATAAGATGGT CCAAACTCTC TGTCGAAGGA AATCACCACG ACGGATATGT 840
GCGATGCTTC ATCACCCCAT GGTCCACACA AGCAAAGGGC CGAAAAGCTT GGAAAGCTGT 900
CTTCCGTGCC GTAAGCGAAG AACGAATCGA CCAAGTATCC TAAGTAAGTA ATTAGACGAC 960
TTAAATGGTG AAGTGGGAGC AAACGAGAGG AATGAATGAA ATGAAAATTA ATGCTTGGGG 1020
GCGTGGCACG AAAAGGACGG TTGAGGGCTT TTGGGCGCTG GACATGGAGC TGTGAAGGCG 1080
AGAG 1084