EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01119 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8506145-8506900 
TF binding sites/motifs
Number: 61             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8506622-8506632TATCCCCTTT-3.04
blmp-1MA0537.1chrI:8506304-8506314AAGGAGAGGT+3.08
blmp-1MA0537.1chrI:8506851-8506861TAAACGAAAA+3.15
blmp-1MA0537.1chrI:8506411-8506421GAAATGAAAA+4.17
blmp-1MA0537.1chrI:8506236-8506246TCTCTCTCTC-4.43
blmp-1MA0537.1chrI:8506145-8506155AAATTGAAAA+4.82
ceh-22MA0264.1chrI:8506349-8506359TTGAAGAGCC-3.5
ceh-22MA0264.1chrI:8506262-8506272GTGAAGTGGT-5.32
ceh-48MA0921.1chrI:8506163-8506171GTCAATAT+3.31
ceh-48MA0921.1chrI:8506360-8506368TATCGAGT-3.41
ces-2MA0922.1chrI:8506397-8506405TGTGGAAT-3.01
ces-2MA0922.1chrI:8506689-8506697TTATGAAA+3.25
ces-2MA0922.1chrI:8506630-8506638TTCATAAT-3.25
che-1MA0260.1chrI:8506665-8506670GTTTC-3.06
dsc-1MA0919.1chrI:8506313-8506322TCAATTACG+3.02
dsc-1MA0919.1chrI:8506313-8506322TCAATTACG-3.02
dsc-1MA0919.1chrI:8506685-8506694TTAATTATG+3.21
dsc-1MA0919.1chrI:8506685-8506694TTAATTATG-3.21
efl-1MA0541.1chrI:8506286-8506300TAGGGCGGCGAATG+3.48
elt-3MA0542.1chrI:8506798-8506805GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:8506875-8506882TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:8506416-8506423GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:8506538-8506545GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:8506237-8506251CTCTCTCTCTACAA-3.36
eor-1MA0543.1chrI:8506409-8506423GAGAAATGAAAAAA+3.53
eor-1MA0543.1chrI:8506235-8506249CTCTCTCTCTCTAC-4.8
fkh-2MA0920.1chrI:8506762-8506769AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8506869-8506876TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8506590-8506597TGTTTAC-4.66
lim-4MA0923.1chrI:8506498-8506506TAATTGTT-3.28
lim-4MA0923.1chrI:8506892-8506900ACAATTAG+3.2
lim-4MA0923.1chrI:8506686-8506694TAATTATG-3.6
lim-4MA0923.1chrI:8506685-8506693TTAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrI:8506511-8506516AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrI:8506885-8506897ATAGCCAACAAT-3.63
pal-1MA0924.1chrI:8506401-8506408GAATTAA+3.14
pal-1MA0924.1chrI:8506498-8506505TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrI:8506686-8506693TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:8506557-8506566AAGTAAAGA+3.25
pha-4MA0546.1chrI:8506591-8506600GTTTACAGT-3.25
pha-4MA0546.1chrI:8506886-8506895TAGCCAACA+3.45
skn-1MA0547.1chrI:8506531-8506545TAGTGCTGAAAAAA+3.87
skn-1MA0547.1chrI:8506644-8506658ACTCGATGAAAAAT+4.25
sma-4MA0925.1chrI:8506175-8506185TTTTCTAGAA+3.09
unc-62MA0918.1chrI:8506549-8506560AAATGTCAAAG+3.22
unc-62MA0918.1chrI:8506739-8506750TATGACATTTA-3.43
unc-62MA0918.1chrI:8506188-8506199CGTGACATTTT-3.55
unc-62MA0918.1chrI:8506715-8506726CATTACAGCTG-3.7
unc-62MA0918.1chrI:8506218-8506229AACTGTAAGAG+3
unc-62MA0918.1chrI:8506591-8506602GTTTACAGTTC-3
unc-86MA0926.1chrI:8506208-8506215TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrI:8506495-8506502TATTAAT+3.47
vab-7MA0927.1chrI:8506314-8506321CAATTAC-3.09
vab-7MA0927.1chrI:8506498-8506505TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrI:8506686-8506693TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:8506778-8506788ACTAATTTTG+3.03
zfh-2MA0928.1chrI:8506484-8506494TAAATTAAAA-3.11
zfh-2MA0928.1chrI:8506496-8506506ATTAATTGTT+3.12
zfh-2MA0928.1chrI:8506400-8506410GGAATTAAGG-3.17
zfh-2MA0928.1chrI:8506685-8506695TTAATTATGA-3.43
zfh-2MA0928.1chrI:8506684-8506694TTTAATTATG+3.68
Enhancer Sequence
AAATTGAAAA ATTTTGAAGT CAATATAGTC TTTTCTAGAA TACCGTGACA TTTTTGTGAG 60
GGATTAATAA AGAAACTGTA AGAGGATGTG CTCTCTCTCT CTACAACCAG CCGGCTTGTG 120
AAGTGGTCTC ACATTTAACT ATAGGGCGGC GAATGTTTGA AGGAGAGGTC AATTACGGAT 180
TTGATTCCGA TGGATTTAAA GGTGTTGAAG AGCCATATCG AGTATGAAGG ATATATCAGA 240
TTTTGAAAAT ATTGTGGAAT TAAGGAGAAA TGAAAAAAGG AGTTATGGTC TTTTTAGGTT 300
CAAAAAACTT GCACTGAATA TCACGAGTCT ATTAGTTCCT AAATTAAAAA TATTAATTGT 360
TCGTAGAACA CATAAATCTG CTACTATAGT GCTGAAAAAA ACCAAAATGT CAAAGTAAAG 420
ATTTTCAAAA TTTTCAAAAT GTTTTTGTTT ACAGTTCAAA ATTGGCAATT TCTCAAATAT 480
CCCCTTTCAT AATTCTGGAA CTCGATGAAA AATGTTAATC GTTTCTACAA GGTTTATTTT 540
TTAATTATGA AAATTTTGAG AAAGCTAAAA CATTACAGCT GATAGATTTG ATATTATGAC 600
ATTTAGCTTT TTCAAAAAAA ACAATAGTTT TAAACTAATT TTGAGTATAT TTTGCTAAAA 660
TCATCACTGG AACTTCTCCG ACTAATCTAA AAAGTGATTT TGAAGATAAA CGAAAAGTCC 720
GAATTGTTTT TTTTTCAAAA ATAGCCAACA ATTAG 755