EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01118 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8496945-8497749 
TF binding sites/motifs
Number: 62             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8497208-8497218TTTCACCTTT-4.3
blmp-1MA0537.1chrI:8497225-8497235TTTCATTTTC-5.09
ceh-48MA0921.1chrI:8497100-8497108AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrI:8497392-8497400GATTGATT-3.07
ceh-48MA0921.1chrI:8497722-8497730TATCGGAT-3.82
ces-2MA0922.1chrI:8497286-8497294TGTCTAAT-3.08
ces-2MA0922.1chrI:8497111-8497119TGCGTAAC-3.23
ces-2MA0922.1chrI:8497619-8497627TATGAAAT-3.43
daf-12MA0538.1chrI:8497060-8497074ATGCAAACCCCCTT-3.01
daf-12MA0538.1chrI:8496982-8496996AAAGTGTGTGCTGA+4.17
dsc-1MA0919.1chrI:8497289-8497298CTAATGAGT+3.02
dsc-1MA0919.1chrI:8497289-8497298CTAATGAGT-3.02
dsc-1MA0919.1chrI:8497024-8497033CTAATTAAT+4.77
dsc-1MA0919.1chrI:8497024-8497033CTAATTAAT-4.77
efl-1MA0541.1chrI:8497177-8497191GCGTGCGCCACAAG+3.28
efl-1MA0541.1chrI:8497343-8497357GAACACGGGAAGAC+3.31
efl-1MA0541.1chrI:8497330-8497344CAGAACGGGAAATG+3.3
efl-1MA0541.1chrI:8497170-8497184TTCGCGCGCGTGCG-3.45
efl-1MA0541.1chrI:8497648-8497662TTGTGCGGGAATTC+3.93
efl-1MA0541.1chrI:8497168-8497182ATTTCGCGCGCGTG-6.88
elt-3MA0542.1chrI:8496974-8496981TTGATCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:8497720-8497727TTTATCG+3.07
elt-3MA0542.1chrI:8496976-8496983GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:8497739-8497746GTTATCA+4.15
eor-1MA0543.1chrI:8497281-8497295GTCTTTGTCTAATG-3.08
eor-1MA0543.1chrI:8497040-8497054TTCTTCTTATTTAA-3.11
eor-1MA0543.1chrI:8497147-8497161CTCCTCGTCTCGCA-3.53
eor-1MA0543.1chrI:8497034-8497048GTCTTTTTCTTCTT-3.5
fkh-2MA0920.1chrI:8497615-8497622TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:8497570-8497577TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:8496946-8496953TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrI:8497009-8497016TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrI:8497321-8497328TGTTGAT-3.51
hlh-1MA0545.1chrI:8496969-8496979AACATTTGAT+3.27
hlh-1MA0545.1chrI:8497360-8497370AGCAGGTGTG+3.44
lim-4MA0923.1chrI:8497290-8497298TAATGAGT-3.35
lim-4MA0923.1chrI:8497025-8497033TAATTAAT-3.67
lim-4MA0923.1chrI:8497024-8497032CTAATTAA+5.22
lin-14MA0261.1chrI:8496969-8496974AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:8497253-8497258TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:8497344-8497349AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrI:8497385-8497390TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:8497196-8497208TTGTTGCAACTT+3.85
mab-3MA0262.1chrI:8497252-8497264ATGTTCCGGATT+4.06
mab-3MA0262.1chrI:8497154-8497166TCTCGCAACGTT-4.24
mab-3MA0262.1chrI:8497107-8497119TTGTTGCGTAAC+4.45
mab-3MA0262.1chrI:8497450-8497462CACTGCAACATT-4.66
pal-1MA0924.1chrI:8497573-8497580TTATGAT-3.29
pha-4MA0546.1chrI:8497010-8497019TTTTACTTA-3.15
pha-4MA0546.1chrI:8497516-8497525AAGTAAACT+3.19
pha-4MA0546.1chrI:8497590-8497599ATTTGCAAA-3.45
skn-1MA0547.1chrI:8497037-8497051TTTTTCTTCTTATT-3.75
skn-1MA0547.1chrI:8497206-8497220TTTTTCACCTTTTT-4
unc-62MA0918.1chrI:8497351-8497362GAAGACAGGAG-3.09
unc-62MA0918.1chrI:8497370-8497381AAATGTCACTT+4.16
unc-86MA0926.1chrI:8497055-8497062TATCCAT+3.14
unc-86MA0926.1chrI:8497585-8497592TTCCTAT-3.51
vab-7MA0927.1chrI:8497290-8497297TAATGAG-3.02
vab-7MA0927.1chrI:8497141-8497148TCATTAC+3.54
vab-7MA0927.1chrI:8497025-8497032TAATTAA+4.57
zfh-2MA0928.1chrI:8497023-8497033GCTAATTAAT+3.78
zfh-2MA0928.1chrI:8497024-8497034CTAATTAATA-4.75
Enhancer Sequence
GTAAAAAATC GCTCGAAAGC CTGGAACATT TGATCAAAAA GTGTGTGCTG ATCCATGTGT 60
GTATTTTTTA CTTAGCATGC TAATTAATAG TCTTTTTCTT CTTATTTAAA TATCCATGCA 120
AACCCCCTTA AACCCAAAGA GTTTTTCCAA AGAAAAATTG ATTTGTTGCG TAACCACAAT 180
ACCTCCTCAA TTCGCCTCAT TACTCCTCGT CTCGCAACGT TTGATTTCGC GCGCGTGCGC 240
CACAAGAAAA ATTGTTGCAA CTTTTTCACC TTTTTGTCCT TTTCATTTTC CCCAGCTTCA 300
CAGGAAAATG TTCCGGATTT TTCATGGATC ATGGATGTCT TTGTCTAATG AGTGATGGCA 360
TAAGGGAGCA GATGTATGTT GATATCAGAA CGGGAAATGA ACACGGGAAG ACAGGAGCAG 420
GTGTGAAATG TCACTTCCTG TGTTCATGAT TGATTTTTGA AATATGGAAT GAAGAATGTG 480
AGGAACCGAG GAGCTGACCT ACATTCACTG CAACATTGGA TTTTCGTGTC AAGACCCATT 540
CCGGGAGAAG AACTTTGCCT TTAAATATTC AAAGTAAACT GTTATAGCTT AATAAAATTT 600
TTAAAATTTT TAGAATTGTT CTAATTTTTT ATGATTATTA TTCCTATTTG CAAAAAATTC 660
AAATTTCTAA TTTTTATGAA ATTCCCACAA CTAGGTCATT CATTTGTGCG GGAATTCAAA 720
ACTACCGTAG TTGTTCTAGT AGATTTTCCC CCAACGGCTC GGCGACTTAT AGACTTTTAT 780
CGGATGTCTT AACTGTTATC AAAA 804