EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01101 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8310963-8311788 
TF binding sites/motifs
Number: 56             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8311772-8311782AAGTTGAATA+3.02
blmp-1MA0537.1chrI:8311353-8311363CCTCATTTCT-3.05
blmp-1MA0537.1chrI:8311292-8311302AAGTTGAAGA+3.33
blmp-1MA0537.1chrI:8311364-8311374AAGGTGAGAT+3.48
ceh-22MA0264.1chrI:8311219-8311229TTGAAGTATT-3.16
ceh-22MA0264.1chrI:8311449-8311459TTGGAGTACA-3.27
ceh-22MA0264.1chrI:8311171-8311181TAGGAGTGGC-3.41
che-1MA0260.1chrI:8311653-8311658AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrI:8311179-8311184GCTTC-3.7
dsc-1MA0919.1chrI:8311337-8311346GTAATTATT+3.06
dsc-1MA0919.1chrI:8311337-8311346GTAATTATT-3.06
dsc-1MA0919.1chrI:8311440-8311449CTAATTAGT+5.26
dsc-1MA0919.1chrI:8311440-8311449CTAATTAGT-5.26
elt-3MA0542.1chrI:8311551-8311558GGTAAAA-3.02
fkh-2MA0920.1chrI:8311566-8311573AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrI:8310997-8311004TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8311667-8311674TATACAT+3.24
fkh-2MA0920.1chrI:8311103-8311110TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrI:8311665-8311672TGTATAC-3.45
fkh-2MA0920.1chrI:8311159-8311166TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrI:8311553-8311560TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrI:8311607-8311614TAAACAA+4.31
hlh-1MA0545.1chrI:8311269-8311279AACATCTGCT+3.14
hlh-1MA0545.1chrI:8311196-8311206GACAGTCGTC+3.27
hlh-1MA0545.1chrI:8311270-8311280ACATCTGCTC-3.88
lim-4MA0923.1chrI:8311590-8311598TTCATTAA+3.07
lim-4MA0923.1chrI:8311374-8311382TGATTGGG-3.17
lim-4MA0923.1chrI:8311337-8311345GTAATTAT+3.22
lim-4MA0923.1chrI:8311440-8311448CTAATTAG+4.28
lim-4MA0923.1chrI:8311441-8311449TAATTAGT-4.28
lin-14MA0261.1chrI:8311330-8311335AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrI:8311304-8311316ATTGGCAAAATG-3.55
mab-3MA0262.1chrI:8311078-8311090CTGTTGCAAATT+4.06
pal-1MA0924.1chrI:8311338-8311345TAATTAT-3.33
pal-1MA0924.1chrI:8311506-8311513TCATTGC-3
pha-4MA0546.1chrI:8310984-8310993GTCCAAACA+3.05
pha-4MA0546.1chrI:8311604-8311613AGATAAACA+3.62
pha-4MA0546.1chrI:8310975-8310984ATTTATACA-3.65
pha-4MA0546.1chrI:8311282-8311291ATTTGTTCA-3.66
pha-4MA0546.1chrI:8311110-8311119ATACAAATA+3.67
pha-4MA0546.1chrI:8311612-8311621AAGCCAACA+3.83
pha-4MA0546.1chrI:8310994-8311003GTTTGTTTT-3.85
pha-4MA0546.1chrI:8311313-8311322ATGCCAATA+3.97
skn-1MA0547.1chrI:8311293-8311307AGTTGAAGAAAATT+4.17
sma-4MA0925.1chrI:8311404-8311414GTGTCTGAGA+3.28
sma-4MA0925.1chrI:8311617-8311627AACAGACATT-3.58
unc-62MA0918.1chrI:8311346-8311357TGTGACACCTC-3.35
vab-7MA0927.1chrI:8311338-8311345TAATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrI:8311441-8311448TAATTAG+3.51
vab-7MA0927.1chrI:8311441-8311448TAATTAG-3.51
vab-7MA0927.1chrI:8311338-8311345TAATTAT-3.6
zfh-2MA0928.1chrI:8311540-8311550AAAATTAATG-3.13
zfh-2MA0928.1chrI:8311336-8311346TGTAATTATT+3.21
zfh-2MA0928.1chrI:8311337-8311347GTAATTATTT-3.43
zfh-2MA0928.1chrI:8311439-8311449ACTAATTAGT+4.62
zfh-2MA0928.1chrI:8311440-8311450CTAATTAGTT-4.62
Enhancer Sequence
ACAAAATACG GTATTTATAC AGTCCAAACA TGTTTGTTTT TCAAAAATTT CAGTCATGTT 60
TTGGCAAATT GCCAATTTCT ACGATAAATT TGGTCTTTTT GAGAATTTAA AAGCACTGTT 120
GCAAATTCAA GCTCCTACAA TGTTTAAATA CAAATAATCA AAAAACTAGT TGTAAAATAA 180
GAAAAAAAAT CTTTCGTAAA AAAATCCGTA GGAGTGGCTT CAATCATATT TCCGACAGTC 240
GTCACCCAAC TTTTCATTGA AGTATTAAAA CTCACAGCAA GTTTTTCACT TGGCAATGTG 300
GTATTTAACA TCTGCTCTTA TTTGTTCAAA AGTTGAAGAA AATTGGCAAA ATGCCAATAT 360
TGTTGAGAAC ATTTGTAATT ATTTGTGACA CCTCATTTCT AAAGGTGAGA TTGATTGGGG 420
GTCAGTGTAA CATGATTTGA TGTGTCTGAG AGGTAGAATA AGTTTACAAC TGAGCAACTA 480
ATTAGTTTGG AGTACATTTA AAAGCAGTCT GTTTGACGGA TTCCATTATT CCAGCCATTT 540
CCTTCATTGC CATTAGACTT TCTTTTGTAT GTCACAAAAA ATTAATGTGG TAAAAAACCC 600
AAGAAAACAT TTGAAAATAG TAAATCATTC ATTAAAAACT AAGATAAACA AGCCAACAGA 660
CATTCGTAAT ATGTTGTTCC AAAGTAAAGG AAGCCGAAAT ATTGTATACA TAAGAACCGA 720
CTGGTACATA TCTCCACATG GAACAACACC AGAACGGGGC TGAGTCATTC TTTAACACGA 780
AAGAAAAGGC AAAATGGGTT AACCTTCAAA AGTTGAATAA CATGG 825