EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01097 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8280774-8281661 
TF binding sites/motifs
Number: 51             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8281273-8281283TAAACGAAAA+3.14
blmp-1MA0537.1chrI:8281216-8281226CATCACCTTT-3.18
blmp-1MA0537.1chrI:8281439-8281449AAATTGAAGA+3.97
ceh-22MA0264.1chrI:8281138-8281148CCACTTGTCG+3.84
ceh-48MA0921.1chrI:8281253-8281261ACCAATAA+3.2
ceh-48MA0921.1chrI:8281182-8281190GTCAATAT+3.31
ceh-48MA0921.1chrI:8281064-8281072CTCGATAT+3.41
ces-2MA0922.1chrI:8280880-8280888TTTTATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:8281620-8281628TTACATAG+3.78
che-1MA0260.1chrI:8281556-8281561AAACC+3.36
daf-12MA0538.1chrI:8281239-8281253ACACACACGGGTAC-3.54
daf-12MA0538.1chrI:8281235-8281249ACACACACACACGG-3.76
daf-12MA0538.1chrI:8281229-8281243TACCACACACACAC-4.81
daf-12MA0538.1chrI:8281231-8281245CCACACACACACAC-6.76
daf-12MA0538.1chrI:8281233-8281247ACACACACACACAC-8.26
dsc-1MA0919.1chrI:8280964-8280973CTAATTGAA+3
dsc-1MA0919.1chrI:8280964-8280973CTAATTGAA-3
elt-3MA0542.1chrI:8280999-8281006GATAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:8280883-8280890TATAAGA-3.29
elt-3MA0542.1chrI:8280849-8280856GATAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:8281527-8281534GATAAGT-3.75
elt-3MA0542.1chrI:8281364-8281371TTTTTCA+3
fkh-2MA0920.1chrI:8281359-8281366TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8281001-8281008TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:8280783-8280790TGTTGAC-3.63
hlh-1MA0545.1chrI:8281138-8281148CCACTTGTCG-3.23
hlh-1MA0545.1chrI:8281458-8281468AACAGCCGGG+3.31
hlh-1MA0545.1chrI:8281137-8281147ACCACTTGTC+3.33
hlh-1MA0545.1chrI:8281297-8281307ACATTTGGTG-3.37
lim-4MA0923.1chrI:8280775-8280783TGATTGGG-3.17
lim-4MA0923.1chrI:8280965-8280973TAATTGAA-3.22
lin-14MA0261.1chrI:8281458-8281463AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:8281191-8281196AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrI:8280867-8280874AAATTAA+3.07
pal-1MA0924.1chrI:8280828-8280835TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrI:8280921-8280928TTATGAC-3.79
pal-1MA0924.1chrI:8281225-8281232TTATTAC-4.57
pha-4MA0546.1chrI:8280939-8280948ATTTACTGT-3.19
pha-4MA0546.1chrI:8281180-8281189TAGTCAATA+3.42
pha-4MA0546.1chrI:8281017-8281026ATTTGTCCA-3.45
pha-4MA0546.1chrI:8280784-8280793GTTGACATA-4.06
skn-1MA0547.1chrI:8281440-8281454AATTGAAGAAATCT+3.62
unc-62MA0918.1chrI:8281293-8281304GCTGACATTTG-3.54
unc-86MA0926.1chrI:8280934-8280941TGGATAT-3.14
unc-86MA0926.1chrI:8280815-8280822TAGTCAT+3.37
unc-86MA0926.1chrI:8281518-8281525TGAATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrI:8281163-8281170CAATTAT-3.15
vab-7MA0927.1chrI:8281012-8281019TCATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrI:8281515-8281522TCATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrI:8280965-8280972TAATTGA+3.6
zfh-2MA0928.1chrI:8280866-8280876GAAATTAAGC-3.17
Enhancer Sequence
TTGATTGGGT GTTGACATAC AGTTTGAGAG GTCTCTTGCA TTAGTCATTG GTCTTTATGA 60
TTTACCGAAT CGTCGGATAA GAATCAGTAT GCGAAATTAA GCATAATTTT ATAAGAACGT 120
TTTTCATGAA AATACTTCGT AAAGCTTTTA TGACACGGTA TGGATATTTA CTGTAAAGTA 180
CCGTATTCCT CTAATTGAAT TTACAGTATT CCCCTCGGTT GACCGGATAA AAAACAGCTC 240
ATTATTTGTC CACAGGATCC TTTATTCGAT GCCAAGTGTA TTCTGTGGTA CTCGATATGA 300
CGGATGAATT ACCACCAAAT TTGAACCATA TGTCGTCGAC AATTCCGATG CTTGTCTTCT 360
CCCACCACTT GTCGTCGTCA TCTTCTGCTC AATTATCTTC GCACCATAGT CAATATGAAC 420
ACTATCCAGA GAAAAGAGTC ACCATCACCT TTTATTACCA CACACACACA CACGGGTACA 480
CCAATAAAAG GGCAAGTCGT AAACGAAAAG CGCCTGCCTG CTGACATTTG GTGATGCCCA 540
CCCTTTCACA TCTGGCATCC TTGACCACTA TTACAGGAAG ACGTTTGTTT TTTTTCAATG 600
CCCGTTTGAA TCACTTTAGA GCATTCTCTA TAATTTGGAG CTTTCGTAAA ATCACTTTGA 660
AGGGAAAATT GAAGAAATCT AGGGAACAGC CGGGTGCAAT CGAGAACGGG GGCGAGTGGA 720
GCTGCACAAT TTAACAGAAC CTCATGAATA TATGATAAGT TCGTGAATGC AATCTCCATC 780
AGAAACCTTA GCATGACGTT GAGATTTTAG GAGCAAAGTT TTGCTTGAGC TCAGATGATA 840
ATGATATTAC ATAGATCTTC ACATAGATAA GCTCAACTTC GTCCTTG 887