EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01092 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8240964-8241879 
TF binding sites/motifs
Number: 62             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8241705-8241715AAGATGAATG+3.09
blmp-1MA0537.1chrI:8241307-8241317TATCTTTTTT-3.44
blmp-1MA0537.1chrI:8241088-8241098AAAAAGATGA+3.47
blmp-1MA0537.1chrI:8241245-8241255AAGTGGAAAA+3.61
blmp-1MA0537.1chrI:8241098-8241108AAAGAGAGTG+3.64
blmp-1MA0537.1chrI:8241091-8241101AAGATGAAAA+3.98
blmp-1MA0537.1chrI:8241636-8241646AAGATGAAAA+3.98
blmp-1MA0537.1chrI:8241108-8241118AAAAAGAGAG+4.69
blmp-1MA0537.1chrI:8241102-8241112AGAGTGAAAA+4.73
ceh-22MA0264.1chrI:8241193-8241203GCTCTTGACA+3.82
ceh-22MA0264.1chrI:8241242-8241252TTGAAGTGGA-4.71
ceh-48MA0921.1chrI:8241221-8241229ATCAATAT+3.21
ceh-48MA0921.1chrI:8241236-8241244GATCGGTT-3.29
ceh-48MA0921.1chrI:8240979-8240987GTCAATAA+3.56
ces-2MA0922.1chrI:8241520-8241528TAAGATAA+3.04
ces-2MA0922.1chrI:8241181-8241189TATGTTAG-3.1
che-1MA0260.1chrI:8241544-8241549GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:8241559-8241573TTAGTGTGTGCTGA+3.27
efl-1MA0541.1chrI:8241168-8241182TTTGGCGGCGATTT+3.13
efl-1MA0541.1chrI:8241613-8241627AACTGGCGCCAATC-3.48
efl-1MA0541.1chrI:8241614-8241628ACTGGCGCCAATCT+4.55
elt-3MA0542.1chrI:8241058-8241065GTTATCA+3.2
elt-3MA0542.1chrI:8241096-8241103GAAAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrI:8241571-8241578GATGAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:8241017-8241024GACAAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrI:8241518-8241525GATAAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrI:8241312-8241319TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:8241813-8241820GATAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:8241218-8241225TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrI:8241105-8241119GTGAAAAAGAGAGC+3.34
eor-1MA0543.1chrI:8241109-8241123AAAAGAGAGCAAGA+3.47
eor-1MA0543.1chrI:8241113-8241127GAGAGCAAGAGGCA+3.66
eor-1MA0543.1chrI:8241091-8241105AAGATGAAAAGAGA+3.68
eor-1MA0543.1chrI:8241101-8241115GAGAGTGAAAAAGA+3.72
eor-1MA0543.1chrI:8241089-8241103AAAAGATGAAAAGA+3.88
eor-1MA0543.1chrI:8241099-8241113AAGAGAGTGAAAAA+4.2
eor-1MA0543.1chrI:8241119-8241133AAGAGGCATAGAGA+4.61
eor-1MA0543.1chrI:8241111-8241125AAGAGAGCAAGAGG+4.79
eor-1MA0543.1chrI:8241103-8241117GAGTGAAAAAGAGA+4.86
fkh-2MA0920.1chrI:8241328-8241335TATTTAC-3.03
fkh-2MA0920.1chrI:8241391-8241398TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:8241434-8241441TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:8241460-8241467TAAACAT+3.81
hlh-1MA0545.1chrI:8241062-8241072TCAGTTGCCA-3.21
hlh-1MA0545.1chrI:8241061-8241071ATCAGTTGCC+3.23
lim-4MA0923.1chrI:8241161-8241169TGATTGGT-3.15
lim-4MA0923.1chrI:8241051-8241059GTAATCAG+3.3
mab-3MA0262.1chrI:8241755-8241767TTTTGGAACAAT-3.63
mab-3MA0262.1chrI:8241740-8241752GTCTGCAACAAT-4.67
pal-1MA0924.1chrI:8241232-8241239TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrI:8241146-8241153TAACAAA+3
pha-4MA0546.1chrI:8241329-8241338ATTTACAAA-3.47
pha-4MA0546.1chrI:8241457-8241466GTATAAACA+3.75
pha-4MA0546.1chrI:8240977-8240986AAGTCAATA+4.11
skn-1MA0547.1chrI:8241634-8241648TAAAGATGAAAATG+3.88
skn-1MA0547.1chrI:8241502-8241516AGTAGATGACATTC+3.93
skn-1MA0547.1chrI:8241089-8241103AAAAGATGAAAAGA+4.82
unc-62MA0918.1chrI:8241506-8241517GATGACATTCA-3.01
unc-62MA0918.1chrI:8241867-8241878AAATGTCATCA+3.8
unc-86MA0926.1chrI:8241424-8241431TACATAT-3.06
unc-86MA0926.1chrI:8241154-8241161TGTGCAT+3.18
zfh-2MA0928.1chrI:8241791-8241801AAAATTAGTT-3
Enhancer Sequence
CATTCTTCAC AAAAAGTCAA TAACCTCCGG AAAAATATTG CTATAAAAGA GTTGACAAGA 60
AGCAAGAGGA ATCTAAAAAC TGTCCAGGTA ATCAGTTATC AGTTGCCACA CCCTAAACTC 120
CCCAAAAAAG ATGAAAAGAG AGTGAAAAAG AGAGCAAGAG GCATAGAGAC AAGGCGGTCG 180
AGTAACAAAA TGTGCATTGA TTGGTTTGGC GGCGATTTAT GTTAGCTAAG CTCTTGACAC 240
ACTTATCTGG CTGTTTTATC AATATGTTTT ATGATCGGTT GAAGTGGAAA AGCATGCAGT 300
ACGTATCTCT TGGTGACGAG TTATTTTTCA AAACTAAAAA ATGTATCTTT TTTCAGAAAA 360
AGGGTATTTA CAAATTATAA TAATCAGGTA ATAGTTTATT AAACTCGAAA TCTTGATTTT 420
CAGAGTTTCA ACAACGCAAA TTTTGTTGTA ACCATTCCAA TACATATTAT TTTTTATTTT 480
CCCACAAAAA ACTGTATAAA CATCCTAACA ACGCCCGACC CACCCTAAAT ATAAAATCAG 540
TAGATGACAT TCACGATAAG ATAACGCGTT GAAATTTGTG GTTTCTCCGA ATTTGTTAGT 600
GTGTGCTGAT GAGAAATAAC TTTGATACTT TGCCCAAAAT CTGCCGAATA ACTGGCGCCA 660
ATCTAAAGTT TAAAGATGAA AATGATTTCA TGATGTTGGG GAAGGTCTGA AAAACTACTT 720
TCAAAACTTT GTCTTCTACA AAAGATGAAT GTTTCACGCC GTTTGAATCA TCAAAAGTCT 780
GCAACAATGG ATTTTGGAAC AATTTTAGGA CCTCTGAAAG CAGTCAAAAA ATTAGTTGAG 840
AATATTTCAG ATAAAAAGTT AACCTGTTGA AATTGTAAAT TCGTCACTCA ACATTCTGCA 900
GTGAAATGTC ATCAG 915