EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01089 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8229901-8230689 
TF binding sites/motifs
Number: 52             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8230179-8230189TTTCCTCCCT-3.07
blmp-1MA0537.1chrI:8230166-8230176CCTCTCCTCT-3.14
blmp-1MA0537.1chrI:8230168-8230178TCTCCTCTCC-3.22
blmp-1MA0537.1chrI:8230171-8230181CCTCTCCCTT-3.22
blmp-1MA0537.1chrI:8230360-8230370TTTCTACTCC-3.29
blmp-1MA0537.1chrI:8230416-8230426GGAGAGAGAC+3.3
blmp-1MA0537.1chrI:8229981-8229991AAATGGAGAT+3.58
blmp-1MA0537.1chrI:8229916-8229926TATCTCTTTT-3.64
blmp-1MA0537.1chrI:8230378-8230388TTTCTTTTTT-4.04
blmp-1MA0537.1chrI:8230173-8230183TCTCCCTTTC-4.93
ceh-22MA0264.1chrI:8230008-8230018TTCAAGAAGC-3.26
ceh-22MA0264.1chrI:8230031-8230041TAGAAGTGCC-3.63
ceh-48MA0921.1chrI:8230542-8230550ATCAATAC+3.21
ces-2MA0922.1chrI:8230157-8230165TATGCAAT-3.46
ces-2MA0922.1chrI:8230145-8230153TTATGCAA+4.22
che-1MA0260.1chrI:8230254-8230259AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrI:8230104-8230109GCTTC-3.2
che-1MA0260.1chrI:8230377-8230382GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:8230285-8230299AATTTGTGTGTGTT+3.27
daf-12MA0538.1chrI:8230287-8230301TTTGTGTGTGTTTC+3.44
efl-1MA0541.1chrI:8230384-8230398TTTTCCCGCAAAGA-3.91
elt-3MA0542.1chrI:8230319-8230326TTTATCC+3.02
elt-3MA0542.1chrI:8230493-8230500TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrI:8229978-8229992AAAAAATGGAGATA+3.25
eor-1MA0543.1chrI:8230223-8230237CTCTGTCCTTTTTC-3.44
eor-1MA0543.1chrI:8230290-8230304GTGTGTGTTTCCCA-3.57
eor-1MA0543.1chrI:8230324-8230338CCCTCCGTTTTTAC-3.86
eor-1MA0543.1chrI:8230419-8230433GAGAGACAAAAACC+3.91
eor-1MA0543.1chrI:8230415-8230429AGGAGAGAGACAAA+4.03
eor-1MA0543.1chrI:8230172-8230186CTCTCCCTTTCCTC-4.61
eor-1MA0543.1chrI:8230417-8230431GAGAGAGACAAAAA+5.06
fkh-2MA0920.1chrI:8229928-8229935AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8230137-8230144TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8230617-8230624TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8230139-8230146TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrI:8230463-8230470TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrI:8230331-8230338TTTTTAC-3.26
fkh-2MA0920.1chrI:8230664-8230671TGTTTAA-3.37
lin-14MA0261.1chrI:8230486-8230491AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:8230095-8230100TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:8230145-8230157TTATGCAACATT-5.64
pal-1MA0924.1chrI:8230349-8230356TCATAAC+3.09
pal-1MA0924.1chrI:8230142-8230149TTATTAT-3.63
pha-4MA0546.1chrI:8230574-8230583GTTTGCACT-3.09
pha-4MA0546.1chrI:8230332-8230341TTTTACTTT-3.25
pha-4MA0546.1chrI:8230540-8230549ATATCAATA+3.35
pha-4MA0546.1chrI:8230036-8230045GTGCCAACA+4.19
skn-1MA0547.1chrI:8230342-8230356GATGTCATCATAAC-3.79
unc-62MA0918.1chrI:8230341-8230352GGATGTCATCA+3.33
unc-86MA0926.1chrI:8230641-8230648TGAATAA-3.58
zfh-2MA0928.1chrI:8230559-8230569CTTAATTTTT+3.05
zfh-2MA0928.1chrI:8229938-8229948TCTAATTTGG+3.22
Enhancer Sequence
CCTATTATTA TGAGGTATCT CTTTTTAAAA ACAAAAGTCT AATTTGGAAG TCCAGGAAAA 60
AGGTCAAACA TTTTCTAAAA AAATGGAGAT AGCTATCTAA TTTTGAATTC AAGAAGCTCT 120
TTCTTTGTAT TAGAAGTGCC AACATTATTG TGGTTCACAA GTTCCCATGT GCTTATCCTT 180
CCGGTCTTTC TCTGTGTTCT TCCGCTTCAG AAGACAACAA CATTCGTATG CAATATTGTT 240
TTTATTATGC AACATTTATG CAATCCCTCT CCTCTCCCTT TCCTCCCTAA TTTCTTCCCA 300
ATAACTTTCC AATGCTTAGG ACCTCTGTCC TTTTTCCCAA AGAATATCAA ATGAAGCGTG 360
AAAAGGGGTC CCAAGGAACC GACCAATTTG TGTGTGTTTC CCAAAACGTA GACGGAGTTT 420
TATCCCTCCG TTTTTACTTT GGATGTCATC ATAACAAACT TTCTACTCCC CCTCCGGTTT 480
CTTTTTTCCC GCAAAGAATA TGGGTTTGTG AGCGAGGAGA GAGACAAAAA CCCAAAAGAT 540
GGGCATCATC AAAAACATCG CATTTTTACG GAAAAATAAG GCTGGAACAT TTTTTTTCAA 600
TAGAAAATTA TTATTTTACT GAACCTCTGC TTGCATACCA TATCAATACG TAGGTATTCT 660
TAATTTTTTC GCGGTTTGCA CTACATTCGA GAACTGTACA ATTTTTAAAA CAAATTTGTT 720
TTTTGTAGGA AAATTCTGAA TGAATAAGGC AATTTCTGAA AAGTGTTTAA AATTTTCAGC 780
CCAATTCG 788