EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01073 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:8099828-8100715 
TF binding sites/motifs
Number: 52             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8100084-8100094TATCCACTTT-3.17
blmp-1MA0537.1chrI:8100330-8100340AGAATGAGTG+3.19
blmp-1MA0537.1chrI:8100220-8100230TCTCTATTCT-3.8
blmp-1MA0537.1chrI:8099966-8099976TTTCAATTTC-4.74
ceh-48MA0921.1chrI:8099944-8099952TATTGAAC-3.34
ces-2MA0922.1chrI:8100409-8100417TGTTTAAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:8100433-8100441TTGTATAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:8100627-8100635TTATATAA+3.35
ces-2MA0922.1chrI:8100628-8100636TATATAAG-3.35
ces-2MA0922.1chrI:8099898-8099906TATGTCAT-3.55
ces-2MA0922.1chrI:8100434-8100442TGTATAAT-4.13
daf-12MA0538.1chrI:8100342-8100356TGTATGTGAGTGTC+3.03
daf-12MA0538.1chrI:8100330-8100344AGAATGAGTGTGTG+3.09
daf-12MA0538.1chrI:8100348-8100362TGAGTGTCTATGAG+3.17
daf-12MA0538.1chrI:8100344-8100358TATGTGAGTGTCTA+3.2
daf-12MA0538.1chrI:8100332-8100346AATGAGTGTGTGTA+3.52
daf-12MA0538.1chrI:8100338-8100352TGTGTGTATGTGAG+3.7
daf-12MA0538.1chrI:8100336-8100350AGTGTGTGTATGTG+3.9
daf-12MA0538.1chrI:8100334-8100348TGAGTGTGTGTATG+5.2
elt-3MA0542.1chrI:8099860-8099867GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:8099831-8099838GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:8100151-8100158GATAAAC-3.21
eor-1MA0543.1chrI:8100577-8100591CTCTGCCGTTCTCC-3.53
eor-1MA0543.1chrI:8099975-8099989CTCTGATTTTTTGT-3.68
fkh-2MA0920.1chrI:8100409-8100416TGTTTAA-3.48
hlh-1MA0545.1chrI:8100404-8100414TCATTTGTTT-3.21
hlh-1MA0545.1chrI:8099854-8099864ACAATTGCTA-3.3
hlh-1MA0545.1chrI:8099902-8099912TCATTTGTCG-3.56
hlh-1MA0545.1chrI:8099853-8099863AACAATTGCT+4
lim-4MA0923.1chrI:8100593-8100601TAATGAAT-3.07
lim-4MA0923.1chrI:8100654-8100662TAATTGTA-3.14
lin-14MA0261.1chrI:8099991-8099996TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:8100217-8100222CGTTC-3.36
lin-14MA0261.1chrI:8100245-8100250TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrI:8100654-8100661TAATTGT-3.42
pha-4MA0546.1chrI:8100410-8100419GTTTAATCT-3.17
pha-4MA0546.1chrI:8100046-8100055GTTTACTCT-3.21
pha-4MA0546.1chrI:8100398-8100407GTTTCCTCA-3.23
pha-4MA0546.1chrI:8100012-8100021ATTTGTAAA-3.28
pha-4MA0546.1chrI:8100445-8100454ATGCAAATA+3.9
pha-4MA0546.1chrI:8100617-8100626GTGCAAATA+4.3
skn-1MA0547.1chrI:8100209-8100223TTTGTCTGCGTTCT-4.07
sma-4MA0925.1chrI:8100210-8100220TTGTCTGCGT+3.17
sma-4MA0925.1chrI:8100184-8100194GATAGACAAT-3.18
sma-4MA0925.1chrI:8100351-8100361GTGTCTATGA+3.37
sma-4MA0925.1chrI:8100315-8100325GCCAGACTTT-3.61
sma-4MA0925.1chrI:8100425-8100435ACTAGAAATT-3
unc-62MA0918.1chrI:8099956-8099967AGTTGTAATTT+3.13
unc-86MA0926.1chrI:8100446-8100453TGCAAAT-3.09
vab-7MA0927.1chrI:8100654-8100661TAATTGT-3.22
zfh-2MA0928.1chrI:8100652-8100662ATTAATTGTA+3.19
zfh-2MA0928.1chrI:8100649-8100659TGAATTAATT-3.36
Enhancer Sequence
AGTGTTAAAA TTCGAATTTC CATCGAACAA TTGCTAAAAT AGATCCTTTT CAGACGTTGG 60
TGTTGGTCGT TATGTCATTT GTCGAAATCC ACATGAATGG TGATTCTAGT TCGATTTATT 120
GAACGACTAG TTGTAATTTT TCAATTTCTC TGATTTTTTG TTATGTTCCA CTTTCTCATA 180
TGCTATTTGT AAATTGATAA TCTTCCAGTT TTCCATGAGT TTACTCTAAA ATTCGTCGAT 240
TTCTAAAAAA ATGCACTATC CACTTTTTCT TCGAGTATTC CCAGGTATTC TAGCTAATGT 300
AACAGTCCCC ATAATTTCCC GATGATAAAC GATCCCATCT TAAAATTCCG TACCCTGATA 360
GACAATAGGC TCCACCCCTT TTTTGTCTGC GTTCTCTATT CTCTCCACAA TTCGCGGTGT 420
TCCATTCTCG CACTTTCGCC GCCTCACGCC CTCCGCGACG AAAGACAAGA AGAGAACAAC 480
CCGTAGGGCC AGACTTTGAT GAAGAATGAG TGTGTGTATG TGAGTGTCTA TGAGATGTGT 540
CTTCGGATTG TAGGATCGTT ACTTATTTCT GTTTCCTCAT TTGTTTAATC TGAAATTACT 600
AGAAATTGTA TAATACCATG CAAATAAGGA GGCCACGTGT AGTTCGCTCT CAGGTTTTGT 660
ATGTACCACC GTCAAGAAAG TTTCCGACCA CCAAATCACT AGATTTTTCA TAGTTCTCAG 720
TTGGATCCTT GTGTCTCAGA ATTCAACGAC TCTGCCGTTC TCCGTTAATG AATTTACCAA 780
CAGTTTCATG TGCAAATAGT TATATAAGCT GGGGTTGAAG CTGAATTAAT TGTACTGAAA 840
CAGTTTCGTA AACTCATTCT CGAAATTTCC AAAAGGTTTT GAGCTAT 887