EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01009 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:7550008-7550783 
TF binding sites/motifs
Number: 54             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:7550441-7550451AGGAAGAGGA+3.08
blmp-1MA0537.1chrI:7550331-7550341TGAGTGAGAA+3.16
blmp-1MA0537.1chrI:7550420-7550430AAATGGATGG+3.24
blmp-1MA0537.1chrI:7550434-7550444GAGGAGAAGG+3.2
blmp-1MA0537.1chrI:7550429-7550439GAAAGGAGGA+3.32
blmp-1MA0537.1chrI:7550432-7550442AGGAGGAGAA+3.34
blmp-1MA0537.1chrI:7550728-7550738AAGAAGAAGA+3.39
blmp-1MA0537.1chrI:7550438-7550448AGAAGGAAGA+3.51
blmp-1MA0537.1chrI:7550414-7550424AGAGCGAAAT+3.57
blmp-1MA0537.1chrI:7550337-7550347AGAATGAGAG+4.16
ceh-48MA0921.1chrI:7550525-7550533TCCAATAA+3.18
ceh-48MA0921.1chrI:7550141-7550149CCCGATAA+3.47
ces-2MA0922.1chrI:7550534-7550542ATACATAA+3.43
daf-12MA0538.1chrI:7550364-7550378TTTGTGTGTGTGTG+3.12
daf-12MA0538.1chrI:7550339-7550353AATGAGAGTGTATC+3.2
daf-12MA0538.1chrI:7550664-7550678AGTGTGCATGTATG+3.31
daf-12MA0538.1chrI:7550386-7550400TGTGTGTGTGAGCG+3.86
daf-12MA0538.1chrI:7550378-7550392TGTGTTTGTGTGTG+3.89
daf-12MA0538.1chrI:7550380-7550394TGTTTGTGTGTGTG+3.89
daf-12MA0538.1chrI:7550382-7550396TTTGTGTGTGTGTG+3.93
daf-12MA0538.1chrI:7550384-7550398TGTGTGTGTGTGAG+4.37
daf-12MA0538.1chrI:7550388-7550402TGTGTGTGAGCGGG+4.67
daf-12MA0538.1chrI:7550374-7550388TGTGTGTGTTTGTG+4.79
daf-12MA0538.1chrI:7550366-7550380TGTGTGTGTGTGTG+4.9
daf-12MA0538.1chrI:7550376-7550390TGTGTGTTTGTGTG+7.14
daf-12MA0538.1chrI:7550372-7550386TGTGTGTGTGTTTG+7.3
daf-12MA0538.1chrI:7550370-7550384TGTGTGTGTGTGTT+7.66
daf-12MA0538.1chrI:7550368-7550382TGTGTGTGTGTGTG+8.26
dsc-1MA0919.1chrI:7550754-7550763CTAATTAGT+4.42
dsc-1MA0919.1chrI:7550754-7550763CTAATTAGT-4.42
elt-3MA0542.1chrI:7550407-7550414AATAAGA-3.25
elt-3MA0542.1chrI:7550024-7550031CATAAGA-3.27
elt-3MA0542.1chrI:7550640-7550647GATAACA-4.15
eor-1MA0543.1chrI:7550025-7550039ATAAGAAGCACAGA+3.32
eor-1MA0543.1chrI:7550427-7550441TGGAAAGGAGGAGA+3.38
eor-1MA0543.1chrI:7550726-7550740TGAAGAAGAAGATA+3.41
eor-1MA0543.1chrI:7550432-7550446AGGAGGAGAAGGAA+3.43
eor-1MA0543.1chrI:7550027-7550041AAGAAGCACAGAAG+3.62
eor-1MA0543.1chrI:7550334-7550348GTGAGAATGAGAGT+3.83
eor-1MA0543.1chrI:7550429-7550443GAAAGGAGGAGAAG+3.85
eor-1MA0543.1chrI:7550447-7550461AGGAGGCGGAGAAA+4.86
lim-4MA0923.1chrI:7550754-7550762CTAATTAG+3.93
lim-4MA0923.1chrI:7550755-7550763TAATTAGT-4.28
lin-14MA0261.1chrI:7550594-7550599AACAT+3.14
pal-1MA0924.1chrI:7550260-7550267CAATGAA+3
skn-1MA0547.1chrI:7550723-7550737ACATGAAGAAGAAG+3.73
skn-1MA0547.1chrI:7550729-7550743AGAAGAAGATATTG+3.95
sma-4MA0925.1chrI:7550165-7550175GGCAGACAGT-3.35
unc-62MA0918.1chrI:7550166-7550177GCAGACAGTTG-3.32
vab-7MA0927.1chrI:7550279-7550286TAATTGA+3.15
vab-7MA0927.1chrI:7550755-7550762TAATTAG+3.51
vab-7MA0927.1chrI:7550755-7550762TAATTAG-3.51
zfh-2MA0928.1chrI:7550753-7550763TCTAATTAGT+4.04
zfh-2MA0928.1chrI:7550754-7550764CTAATTAGTA-4.4
Enhancer Sequence
ACTAGATTAC CAGTATCATA AGAAGCACAG AAGATTACCT ATAAGTTATT TCAAAATGGG 60
GAGCAAGTGG GCGGAGCTTC AAACATGAAG AAAGTGTCTT CTGGTTTTCG AAATTATTTT 120
TTTTGGAGTT TCACCCGATA AACGTTAGAA ATATTTTGGC AGACAGTTGC AGTGTTAGTT 180
GATGCTCAAA TCATAGAAAT TGGTCAAAAA CTACAAATTT CTCAAAATGA ACCTAAAATC 240
CTGAAACTGG AGCAATGAAC TAAAACCTGG ATAATTGAAT GATGAGGCGA ATTTCGAACG 300
AGTAAAGGAG ATTGGAAGTG ATGTGAGTGA GAATGAGAGT GTATCTTTGT GAGCGTTTTG 360
TGTGTGTGTG TGTGTTTGTG TGTGTGTGAG CGGGGACATA ATAAGAAGAG CGAAATGGAT 420
GGAAAGGAGG AGAAGGAAGA GGAGGCGGAG AAAGTAAGTG GTGGAATGAG CGAGGATGGA 480
ATGATTTGAA GGCTGTTGCT GTGTGGTCAT GGAGTAGTCC AATAAAATAC ATAAAGAATC 540
TCCAACTCTT AAATTATGGG TAGGTCGAGG TATAGGGTGT AGTCCGAACA TTTACAGATC 600
GTATCGGAAC CGTATCGTAG AATCTATAAT GTGATAACAA TTTACTTGAA AATCGCAGTG 660
TGCATGTATG GGATTAAATA TAAATTTGAT AGACTACAAT TGGAGAATTC ATCAAACATG 720
AAGAAGAAGA TATTGCACAT GAATTTCTAA TTAGTAGATA ATGCCAAATA ATTTT 775