EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01007 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:7546244-7547070 
TF binding sites/motifs
Number: 56             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:7547003-7547013GAATCGAAAA+3.66
blmp-1MA0537.1chrI:7546315-7546325TTTCACTCTT-3.85
blmp-1MA0537.1chrI:7546398-7546408TTTCAATTTT-3.85
blmp-1MA0537.1chrI:7546631-7546641AAAATGAAAC+4.09
blmp-1MA0537.1chrI:7546688-7546698AAAATGAAAG+5.11
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:7546662-7546675TAATTTCAGTTAA+4.05
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:7546580-7546593TTGTCTAAATTAA+4.34
ceh-22MA0264.1chrI:7546526-7546536CCAATCCAAA+3.19
ceh-22MA0264.1chrI:7546962-7546972TAGAAGTGTT-3.33
ceh-22MA0264.1chrI:7546616-7546626TTGAATTGGT-3.34
ceh-48MA0921.1chrI:7546838-7546846TTCAATAT+3.27
ces-2MA0922.1chrI:7546995-7547003TTAAGCAA+3.08
ces-2MA0922.1chrI:7546897-7546905TTAGGCAA+3.14
dsc-1MA0919.1chrI:7546589-7546598TTAATTAAC+4.37
dsc-1MA0919.1chrI:7546589-7546598TTAATTAAC-4.37
elt-3MA0542.1chrI:7546714-7546721GATACGA-3.45
eor-1MA0543.1chrI:7546546-7546560TAGAAAAACAAAAA+3.38
eor-1MA0543.1chrI:7546679-7546693AAGAGACTAAAAAT+3.44
eor-1MA0543.1chrI:7546772-7546786GTAAGAGACAGGAA+3.45
eor-1MA0543.1chrI:7546671-7546685TTAAGATGAAGAGA+3.69
eor-1MA0543.1chrI:7546758-7546772AGGAATAGCAGAGA+3.71
eor-1MA0543.1chrI:7546768-7546782GAGAGTAAGAGACA+4.54
eor-1MA0543.1chrI:7546766-7546780CAGAGAGTAAGAGA+5.22
fkh-2MA0920.1chrI:7547020-7547027AAAACAC+3.08
fkh-2MA0920.1chrI:7546266-7546273AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:7546550-7546557AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:7546475-7546482AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:7546888-7546895TGTTTAA-3.48
fkh-2MA0920.1chrI:7546457-7546464TAAAAAA+3.4
lim-4MA0923.1chrI:7546870-7546878TAATGGGA-3.04
lim-4MA0923.1chrI:7546589-7546597TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrI:7546590-7546598TAATTAAC-3.96
lin-14MA0261.1chrI:7546735-7546740TGTTC-3.14
pal-1MA0924.1chrI:7546446-7546453GAATTAA+3.14
pal-1MA0924.1chrI:7546605-7546612TCATAAA+3.79
pha-4MA0546.1chrI:7546648-7546657TTTTGCTTT-3.23
pha-4MA0546.1chrI:7546454-7546463ATGTAAAAA+3.2
pha-4MA0546.1chrI:7546907-7546916ATTTGTTTT-3.73
pha-4MA0546.1chrI:7546899-7546908AGGCAAATA+3.9
pha-4MA0546.1chrI:7546564-7546573GAGCAAATA+4.64
skn-1MA0547.1chrI:7546289-7546303AAAAGTTGACGAAC+3.83
skn-1MA0547.1chrI:7546798-7546812AATACATGACAAAC+4.12
sma-4MA0925.1chrI:7547013-7547023TTGTCTGAAA+3.26
unc-62MA0918.1chrI:7546463-7546474ACATGTCCTTG+3.12
unc-62MA0918.1chrI:7546775-7546786AGAGACAGGAA-3.17
unc-86MA0926.1chrI:7547032-7547039TTCATAA-3.58
vab-7MA0927.1chrI:7546870-7546877TAATGGG-3.16
vab-7MA0927.1chrI:7546590-7546597TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:7546590-7546597TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrI:7547036-7547043TAATGAC+3
vab-7MA0927.1chrI:7546484-7546491TCATTAT-3
zfh-2MA0928.1chrI:7546445-7546455GGAATTAAAA-3.02
zfh-2MA0928.1chrI:7546991-7547001AAAATTAAGC-3.08
zfh-2MA0928.1chrI:7546585-7546595TAAATTAATT-3.31
zfh-2MA0928.1chrI:7546589-7546599TTAATTAACA-4.19
zfh-2MA0928.1chrI:7546588-7546598ATTAATTAAC+4.29
Enhancer Sequence
TATCAAAGTC AGACTTCACC AAAAAACAAA ATACTAAAAT TTGTGAAAAG TTGACGAACT 60
CTAGATTTGT ATTTCACTCT TCCTATAAAC TTTTTTCCAT TAACGGATTT TTCAACTGAT 120
TTCGACCTAT TTTAGGCGTA CTTCGAAAAA ATTATTTCAA TTTTTTTCTT CAGATTTTGA 180
TATTAAAATT TCTAAAACCA TGGAATTAAA ATGTAAAAAA CATGTCCTTG GAAAACAACG 240
TCATTATATT TTTGGACTAC ATATATTTAA AATTTACTAG CACCAATCCA AAGTTTCAGA 300
TTTAGAAAAA CAAAAAATAA GAGCAAATAT TTCGAATTGT CTAAATTAAT TAACATATTT 360
GTCATAAAAT AGTTGAATTG GTTTTCAAAA ATGAAACTTT CAGTTTTTGC TTTGAAAATA 420
ATTTCAGTTA AGATGAAGAG ACTAAAAATG AAAGAAACAG ATCATCACAT GATACGAAAG 480
GTTGTGAGAA ATGTTCAGAG TGCATTTGAT TGAGAGGAAT AGCAGAGAGT AAGAGACAGG 540
AAGTTGCAGC ATAAAATACA TGACAAACGA CTATTTTGAC AATTTTTCCA AAAATTCAAT 600
ATTATAAATT TAAAAATAAA ACTTTTTAAT GGGAAAAATG CAATTGTTTA AAATTAGGCA 660
AATATTTGTT TTAGTAAACT AGTAAACTTA GTCCCTTCAC AGAGATTCTA AAATTGTTTA 720
GAAGTGTTTT ATGTTTGACG AGTCGTTAAA ATTAAGCAAG AATCGAAAAT TGTCTGAAAA 780
CACCGAAATT CATAATGACT TCTTAAAAAA TTATCAAAAA AGTTAT 826