EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00938 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:7001563-7002389 
TF binding sites/motifs
Number: 60             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:7001583-7001593AAAACGAGTA+3.25
blmp-1MA0537.1chrI:7001826-7001836GAAGAGAAAT+3.63
blmp-1MA0537.1chrI:7002022-7002032TCTCTTTCTC-4.1
blmp-1MA0537.1chrI:7002020-7002030TTTCTCTTTC-4.23
blmp-1MA0537.1chrI:7001577-7001587AAAATGAAAA+5.14
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:7001839-7001852TAATGAAAACAAG-3.44
ceh-22MA0264.1chrI:7001942-7001952TTAAAGTGCA-3.38
daf-12MA0538.1chrI:7002170-7002184ACCCACACAAACTC-3.48
dsc-1MA0919.1chrI:7001594-7001603ACAATTAGC+3.19
dsc-1MA0919.1chrI:7001594-7001603ACAATTAGC-3.19
dsc-1MA0919.1chrI:7002250-7002259TTAATTAAT+4.29
dsc-1MA0919.1chrI:7002250-7002259TTAATTAAT-4.29
elt-3MA0542.1chrI:7001564-7001571TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrI:7001920-7001927TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrI:7001969-7001976CTTATAA+3.29
elt-3MA0542.1chrI:7001971-7001978TATAAGA-3.29
eor-1MA0543.1chrI:7002314-7002328GGCTTTTTCTCTAA-3.25
eor-1MA0543.1chrI:7002021-7002035TTCTCTTTCTCGCC-5.09
fkh-2MA0920.1chrI:7001914-7001921AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrI:7001695-7001702TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:7002378-7002385TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:7002207-7002214TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrI:7001793-7001800AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:7001844-7001851AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:7001893-7001900TGTTGAT-3.43
hlh-1MA0545.1chrI:7001757-7001767ACAAATGTTT-3.17
hlh-1MA0545.1chrI:7001756-7001766AACAAATGTT+3.52
lim-4MA0923.1chrI:7001594-7001602ACAATTAG+3.33
lim-4MA0923.1chrI:7002290-7002298TAATTGAA-3.3
lim-4MA0923.1chrI:7002250-7002258TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrI:7002251-7002259TAATTAAT-3.75
lin-14MA0261.1chrI:7002296-7002301AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrI:7002344-7002356CACCGAAACATT-3.98
mab-3MA0262.1chrI:7001636-7001648ATTTGCAACATT-5.19
pal-1MA0924.1chrI:7002017-7002024TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrI:7002255-7002262TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrI:7002375-7002382CAATAAA+3.46
pha-4MA0546.1chrI:7001947-7001956GTGCAAAGA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:7001841-7001850ATGAAAACA+3.24
pha-4MA0546.1chrI:7001790-7001799AAGAAAACA+3.27
pha-4MA0546.1chrI:7001894-7001903GTTGATCTT-3.43
pha-4MA0546.1chrI:7002305-7002314ATTTATCTT-3.53
pha-4MA0546.1chrI:7001794-7001803AAACAAATA+3.73
pha-4MA0546.1chrI:7002077-7002086ATTTATTTT-3.76
pha-4MA0546.1chrI:7001751-7001760GAACAAACA+3.86
sma-4MA0925.1chrI:7001873-7001883TCTAGTCATA-3.17
unc-62MA0918.1chrI:7002272-7002283GCTTGTCAGCG+3.13
unc-86MA0926.1chrI:7002354-7002361TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrI:7002122-7002129TATGAAT+3.58
unc-86MA0926.1chrI:7001631-7001638TGAATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrI:7002118-7002125TCATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrI:7002251-7002258TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:7002251-7002258TAATTAA-3.22
zfh-2MA0928.1chrI:7001743-7001753AAAATTAAGA-3.05
zfh-2MA0928.1chrI:7002288-7002298TTTAATTGAA+3.11
zfh-2MA0928.1chrI:7002015-7002025CTTAATTTCT+3.16
zfh-2MA0928.1chrI:7002253-7002263ATTAATTTCA+3.2
zfh-2MA0928.1chrI:7002246-7002256TGAATTAATT-3.36
zfh-2MA0928.1chrI:7002249-7002259ATTAATTAAT+4.38
zfh-2MA0928.1chrI:7002250-7002260TTAATTAATT-4.38
Enhancer Sequence
ATTTATCATG AACAAAAATG AAAACGAGTA GACAATTAGC AAAGAATTGG CAATGATTTT 60
GGAGTAAATG AATATTTGCA ACATTGAATC AAAATGAATC AAAAACACAG CATTGAACCA 120
TTCAAAACAC TTTCAACAAC TTCGACTTCT CAGCGTAACC ATTCATTTAT AAAACATTTT 180
AAAATTAAGA ACAAACAAAT GTTTCCTCCA TTTAGCTTAG AATTAAAAAG AAAACAAATA 240
TTTTTCTGAA TATTCGATTT ATGGAAGAGA AATGCTTAAT GAAAACAAGT CAAATCTATT 300
TTCAGATGAT TCTAGTCATA ATGGAATTCC TGTTGATCTT GCTGATCATC GAAAACATTT 360
ATCAATTTGA AAATTTGTTT TAAAGTGCAA AGAACAAAAC AAATTTCTTA TAAGATTAAA 420
CTGTATGATT TAAAGAAAAA ATATTTTTCA AACTTAATTT CTCTTTCTCG CCAATTTTTC 480
CAGAGGATTG TCAACTCACC ATAGTTTGTC TGATATTTAT TTTTTTAAAA ACTTTTGGAA 540
ATTTTTTGTG AAGTCTCATT ATGAATTTCG GTGGTTTTGG ACCAGTTTTA GTCTATTTAA 600
CCAAAATACC CACACAAACT CTACACCCCC TTTAAAGGTG TGCGTAAAAA TGACAAAGTA 660
ACGATTTTAA ACTATTTCGA ACCTGAATTA ATTAATTTCA CTGATTTACG CTTGTCAGCG 720
TGCTTTTTAA TTGAACATTT GTATTTATCT TGGCTTTTTC TCTAAAATTC AAGCAAAAAT 780
ACACCGAAAC ATTAATAATC GGTGGAAAAT AACAATAAAT AAAATA 826