EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00841 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:6226989-6227942 
TF binding sites/motifs
Number: 58             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:6227886-6227896TATCCATTTT-3.19
blmp-1MA0537.1chrI:6227872-6227882AAATCGAATA+3.24
blmp-1MA0537.1chrI:6227802-6227812AAAAAGAAGA+4.07
blmp-1MA0537.1chrI:6227844-6227854AAATCGAAAA+4.3
blmp-1MA0537.1chrI:6227069-6227079TTTCGATTTT-4.3
blmp-1MA0537.1chrI:6227927-6227937TTTCGATTTT-4.3
blmp-1MA0537.1chrI:6227921-6227931TTTCGTTTTC-4.49
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:6227582-6227595TTATGAAGACAAT-3.59
ceh-22MA0264.1chrI:6227188-6227198GCACTTTAGA+3.24
ceh-48MA0921.1chrI:6227771-6227779TATTGATG-3.16
ceh-48MA0921.1chrI:6227023-6227031TTCGATAT+3.52
ces-2MA0922.1chrI:6227113-6227121TACTTTAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:6227596-6227604TATTTAAT-3.54
dsc-1MA0919.1chrI:6227497-6227506ATAATTAAA+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:6227497-6227506ATAATTAAA-3.33
elt-3MA0542.1chrI:6227778-6227785GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:6227465-6227472TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:6227162-6227169TATAAGA-3.29
elt-3MA0542.1chrI:6227775-6227782GATGAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:6227005-6227012CTTGTCA+3.45
elt-3MA0542.1chrI:6227386-6227393CTAATCA+3.58
elt-3MA0542.1chrI:6227893-6227900TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:6227103-6227110GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:6227674-6227681GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:6227607-6227614TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrI:6227805-6227819AAGAAGAACAAAGA+3.52
eor-1MA0543.1chrI:6227803-6227817AAAAGAAGAACAAA+3.61
fkh-2MA0920.1chrI:6227349-6227356AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:6227158-6227165TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrI:6227614-6227621TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:6227632-6227639TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrI:6227547-6227554TCAACAA+3.66
fkh-2MA0920.1chrI:6227525-6227532TGTTTAC-4.05
fkh-2MA0920.1chrI:6227765-6227772TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrI:6227151-6227161ACAAATGTTT-3.17
hlh-1MA0545.1chrI:6227150-6227160AACAAATGTT+3.74
lim-4MA0923.1chrI:6227386-6227394CTAATCAA+3.21
lim-4MA0923.1chrI:6227497-6227505ATAATTAA+3.57
lim-4MA0923.1chrI:6227498-6227506TAATTAAA-3
lin-14MA0261.1chrI:6227336-6227341AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:6227021-6227026CGTTC-3.36
pal-1MA0924.1chrI:6227611-6227618TCATAAA+3.29
pal-1MA0924.1chrI:6227498-6227505TAATTAA+3.54
pha-4MA0546.1chrI:6227110-6227119ATTTACTTT-3.02
pha-4MA0546.1chrI:6227816-6227825AGACCAACA+3.42
pha-4MA0546.1chrI:6227879-6227888ATACAAATA+3.67
pha-4MA0546.1chrI:6227766-6227775GTTTATATT-3.83
pha-4MA0546.1chrI:6227526-6227535GTTTACTTT-5.52
skn-1MA0547.1chrI:6227582-6227596TTATGAAGACAATT+3.88
skn-1MA0547.1chrI:6227771-6227785TATTGATGAGAAAA+4.59
unc-86MA0926.1chrI:6227886-6227893TATCCAT+3.14
unc-86MA0926.1chrI:6227418-6227425TTCCTAA-3.37
unc-86MA0926.1chrI:6227228-6227235TAGTCAT+3.51
unc-86MA0926.1chrI:6227506-6227513TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:6227387-6227394TAATCAA+3.13
vab-7MA0927.1chrI:6227498-6227505TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:6227496-6227506AATAATTAAA+3.54
zfh-2MA0928.1chrI:6227497-6227507ATAATTAAAT-3.72
Enhancer Sequence
TGTTGCTACA AAATTTCTTG TCAAATTCGT TGCGTTCGAT ATAGTATGAA CCAAAATGGC 60
AACCAAAAAA AGGTGCCATT TTTCGATTTT CGATGTTTTT CAGAAAAAAA ATCTGAAAAA 120
AATTTACTTT ATCTCGACCT TAACACTACT TTATCTCGAC CAACAAATGT TTTTATAAGA 180
AACACTCAAC TACAAAATTG CACTTTAGAT TAAAATGAAC AACTTTATAG TTGATCACAT 240
AGTCATGAAA TATTTTTCCA CGGAGATATA GGTATCCGAA GTGAATTCGT TTTTTTGAAC 300
TTAGGGGTTC TACTAGACCT CAGGTTTTCG TCTGAAATCG TGTGCAGAAC ATTGAGACTA 360
AAAACAACCA AACAAAAATT GCACTTTTCT AAAAGATCTA ATCAAAATTT GAAAAGTTTT 420
CAAAAAAAAT TCCTAAAAAA ATTTTGAAAA AGTTTTGTGA GGGACCCTTT GAATTTTTTG 480
TCAAAAATCG GAAAAAAAAA TTTCAAAAAT AATTAAATAT TCATCAGATA TAAATATGTT 540
TACTTTAATG TTTTTGCATC AACAAGCATA ATTGTGTCTT TATTCAAACT GATTTATGAA 600
GACAATTTAT TTAATCCTTT TATCATAAAA AATTTTTGAA TATTTTTTAC AGATTTTATA 660
GCAAAATATA ACTCTAAAAA GTACTGAAAA AAAAGTTTGT CACCTGGAAA CTTTGGAGAC 720
TTTGTCTCCT CAAAGTTTGT CATCTCGGAG ACCGGGCTTT TTTTTGAATC TAATTTTGTT 780
TATATTGATG AGAAAAACAT AATATTTTCC ACAAAAAAGA AGAACAAAGA CCAACATTTT 840
ATGCTAATTT TTGAAAAATC GAAAATTTTT TCGAAATATT GGAAAATCGA ATACAAATAT 900
CCATTTTTTC AAAAATCAAA ACATCCCAAT TTTTTCGTTT TCGATTTTCT GCA 953