EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00840 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:6224214-6225035 
TF binding sites/motifs
Number: 60             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:6224887-6224897CATCGATTTT-3.19
blmp-1MA0537.1chrI:6224408-6224418GAGGCGAAAG+3.42
blmp-1MA0537.1chrI:6224904-6224914ATTCATTTTT-3.57
blmp-1MA0537.1chrI:6224420-6224430CCTCCCTTTT-3.5
blmp-1MA0537.1chrI:6224624-6224634AAAACGATAA+3.71
blmp-1MA0537.1chrI:6224698-6224708TCTCTATCTT-3.96
blmp-1MA0537.1chrI:6224470-6224480AAAAAGAAGG+4.04
blmp-1MA0537.1chrI:6224808-6224818TTTCATTCTC-4.31
ceh-48MA0921.1chrI:6224486-6224494AATCGATA-3.06
ceh-48MA0921.1chrI:6224878-6224886TTCGATAT+3.07
ceh-48MA0921.1chrI:6224263-6224271TATCGAAG-3.2
ceh-48MA0921.1chrI:6224887-6224895CATCGATT-3.41
ceh-48MA0921.1chrI:6224487-6224495ATCGATAC+4.57
ces-2MA0922.1chrI:6224843-6224851CGTGTAAT-3.01
ces-2MA0922.1chrI:6224533-6224541TTTTGTAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:6224770-6224778TTGTATAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:6224737-6224745TAGATAAT-3.42
ces-2MA0922.1chrI:6224534-6224542TTTGTAAT-3.45
ces-2MA0922.1chrI:6224736-6224744TTAGATAA+3.64
ces-2MA0922.1chrI:6224512-6224520TATTTTAT-3
che-1MA0260.1chrI:6224309-6224314GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:6224688-6224693GTTTC-3.36
dsc-1MA0919.1chrI:6224863-6224872TTAATTAAT+4.29
dsc-1MA0919.1chrI:6224863-6224872TTAATTAAT-4.29
dsc-1MA0919.1chrI:6224867-6224876TTAATTAAC+4.37
dsc-1MA0919.1chrI:6224867-6224876TTAATTAAC-4.37
efl-1MA0541.1chrI:6224276-6224290ACGCGCGCCACCAC+3.3
efl-1MA0541.1chrI:6224714-6224728ATTTTCCGCTGAGT-3.62
efl-1MA0541.1chrI:6224792-6224806TCTCGCGCGGAAAG+3.71
efl-1MA0541.1chrI:6224794-6224808TCGCGCGGAAAGAT+4.17
efl-1MA0541.1chrI:6224791-6224805ATCTCGCGCGGAAA-4.53
elt-3MA0542.1chrI:6224734-6224741GATTAGA-3.58
elt-3MA0542.1chrI:6224620-6224627GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:6224822-6224836GTGTACTTCTCTCG-3.56
fkh-2MA0920.1chrI:6224557-6224564TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:6224974-6224981TAAAAAC+3.26
hlh-1MA0545.1chrI:6224295-6224305CACAGGTGAT+3.22
lim-4MA0923.1chrI:6224863-6224871TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrI:6224867-6224875TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrI:6224864-6224872TAATTAAT-3.75
lim-4MA0923.1chrI:6224868-6224876TAATTAAC-3.96
lin-14MA0261.1chrI:6224654-6224659TGTTC-3.14
pal-1MA0924.1chrI:6224680-6224687AAATTAA+3.07
pal-1MA0924.1chrI:6224767-6224774TTATTGT-3.46
pha-4MA0546.1chrI:6224584-6224593ATTTATCTG-3.36
skn-1MA0547.1chrI:6224882-6224896ATATTCATCGATTT-3.96
sma-4MA0925.1chrI:6224990-6225000CTGACTGTAA+3.09
unc-86MA0926.1chrI:6224439-6224446TGCATGT-3.18
unc-86MA0926.1chrI:6224903-6224910TATTCAT+3.58
unc-86MA0926.1chrI:6224883-6224890TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:6224864-6224871TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:6224868-6224875TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:6224864-6224871TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrI:6224868-6224875TAATTAA-3.22
zfh-2MA0928.1chrI:6224739-6224749GATAATTTGA+3.07
zfh-2MA0928.1chrI:6224679-6224689GAAATTAAGG-3.13
zfh-2MA0928.1chrI:6224867-6224877TTAATTAACA-4.19
zfh-2MA0928.1chrI:6224866-6224876ATTAATTAAC+4.29
zfh-2MA0928.1chrI:6224862-6224872ATTAATTAAT+4.31
zfh-2MA0928.1chrI:6224863-6224873TTAATTAATT-4.38
Enhancer Sequence
GACTTCAAAA TACATTCCCT CTACTCAGTT CATCTAATTT TCCTTAACTT ATCGAAGAAA 60
CAACGCGCGC CACCACCACC ACACAGGTGA TTCGCGTTTC ATGCGTGACG CTTTGAGGCG 120
CGTATGAGGC GCGTATTGGA CGCGTAGCGA AAAGCGAGCC TCGGACGCAT GTGTGAAGCA 180
TGCGTGACGC ACGAGAGGCG AAAGTGCCTC CCTTTTCGCC ACGCATGCAT GTAGCATGCG 240
TGAAACACGA TTGGCGAAAA AGAAGGAACA ATAATCGATA CAAATATTTT AGGCAATTTA 300
TTTTATTTTT CGCAGTTTAT TTTGTAATTC CCCTGTTTTT CATTGTTTTT CCGTTGTGAA 360
AAGTCACGAT ATTTATCTGG AGTGAACCTA AAAACGAATT TTTGCTGAAA AAAACGATAA 420
TTCATTCCAA TTCCGTTCAA TGTTCTGTTT TAAATTGTTA CTGAAGAAAT TAAGGTTTCC 480
ACCTTCTCTA TCTTCGGAAA ATTTTCCGCT GAGTTTTTGT GATTAGATAA TTTGAAAGTT 540
TTTTGCTTGA AATTTATTGT ATAAAATTCG AATTTAAATC TCGCGCGGAA AGATTTTCAT 600
TCTCCGCCGT GTACTTCTCT CGGACAACTC GTGTAATCCT CTCGGACGAT TAATTAATTA 660
ACATTTCGAT ATTCATCGAT TTTGAATTTT ATTCATTTTT TGAAGTGATT TTGCTAGATT 720
TTTTAGAATT TTTGTCTTGA AACATATATT TCGACGTCTG TAAAAACATT GATTTACTGA 780
CTGTAACATT TAAAAATAGT CGAAACTTCA GTTGTTTTGC C 821