EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00798 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:5821177-5822032 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:5821842-5821852GAATAGAAAT+3.34
blmp-1MA0537.1chrI:5821771-5821781TAAGTGAAAA+3.51
blmp-1MA0537.1chrI:5821585-5821595TTTCCCTCTC-3.64
blmp-1MA0537.1chrI:5821372-5821382AGATGGAAAG+3.88
blmp-1MA0537.1chrI:5821801-5821811AAAGTGAAAT+4.33
ceh-22MA0264.1chrI:5821559-5821569GCTCTTGAAC+3.69
ceh-48MA0921.1chrI:5821749-5821757TATCGACC-3.6
ces-2MA0922.1chrI:5821251-5821259TGCATAAT-4.22
che-1MA0260.1chrI:5821598-5821603AAGCC+3.7
daf-12MA0538.1chrI:5821271-5821285TTGCACACACTGTT-3.04
daf-12MA0538.1chrI:5821829-5821843ACACACACAGTCAG-3.37
daf-12MA0538.1chrI:5821825-5821839AAAGACACACACAG-4.06
daf-12MA0538.1chrI:5821378-5821392AAAGTGGGTGTGAT+4.34
dsc-1MA0919.1chrI:5821942-5821951TTAATTAGC+4.77
dsc-1MA0919.1chrI:5821942-5821951TTAATTAGC-4.77
efl-1MA0541.1chrI:5821946-5821960TTAGCCGCCAAGTT+3.1
efl-1MA0541.1chrI:5821584-5821598ATTTCCCTCTCTCG-3.38
efl-1MA0541.1chrI:5821283-5821297TTCTCGCGCACTCT-3.74
efl-1MA0541.1chrI:5821945-5821959ATTAGCCGCCAAGT-3.82
efl-1MA0541.1chrI:5821211-5821225GAACGCGCGAAAAT+5.91
elt-3MA0542.1chrI:5821445-5821452GATAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:5821532-5821539GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:5821881-5821888GATTAAA-3.14
eor-1MA0543.1chrI:5821586-5821600TTCCCTCTCTCGAA-3.36
eor-1MA0543.1chrI:5821584-5821598ATTTCCCTCTCTCG-3.39
eor-1MA0543.1chrI:5821538-5821552AAGTGTCGAAGAAA+3.51
eor-1MA0543.1chrI:5821369-5821383AAGAGATGGAAAGT+4.06
eor-1MA0543.1chrI:5821824-5821838GAAAGACACACACA+4.11
hlh-1MA0545.1chrI:5821260-5821270ACCATCTGAC+3.23
lim-4MA0923.1chrI:5821942-5821950TTAATTAG+3.67
lim-4MA0923.1chrI:5821943-5821951TAATTAGC-5.22
lin-14MA0261.1chrI:5821281-5821286TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrI:5821566-5821571AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:5821643-5821648TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:5821212-5821217AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:5821236-5821241AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:5821439-5821444CGTTC-3.36
mab-3MA0262.1chrI:5821462-5821474TTGTTGAGAAAT+3.97
pha-4MA0546.1chrI:5821774-5821783GTGAAAATA+3.11
skn-1MA0547.1chrI:5821460-5821474TATTGTTGAGAAAT+3.76
unc-62MA0918.1chrI:5821204-5821215ACTGACAGAAC-3.18
unc-62MA0918.1chrI:5821359-5821370GGTGACAGTGA-3.31
unc-62MA0918.1chrI:5821389-5821400GATGACATCTC-4.51
vab-7MA0927.1chrI:5821255-5821262TAATGAC+3
vab-7MA0927.1chrI:5821943-5821950TAATTAG-4.57
zfh-2MA0928.1chrI:5821569-5821579ATTAATTTTC+3.09
zfh-2MA0928.1chrI:5821942-5821952TTAATTAGCC-3.84
zfh-2MA0928.1chrI:5821941-5821951ATTAATTAGC+4.93
Enhancer Sequence
ACTATGAAAT AGTGTACAAT TCAACAGACT GACAGAACGC GCGAAAATGT TGGTCAACGA 60
ACGCTCGAAT TGGTTGCATA ATGACCATCT GACCTTGCAC ACACTGTTCT CGCGCACTCT 120
TGCTCGTTCT GCCTGCAACG ACGGTGTGCT GCTCCGCCCC TGGTGGTCTA TGGGAATAAG 180
AAGGTGACAG TGAAGAGATG GAAAGTGGGT GTGATGACAT CTCTTCCAAA TATTCGCAGT 240
GTGGTGTTGT AATATATTTG TGCGTTCGGA TAAAACTAAC AGATATTGTT GAGAAATTGG 300
GTATGGTTCT CAGTTGGCAT ATGAGTTGCA GAATAAGAGT CTATCAAGTT TCAGTGAGAA 360
AAAGTGTCGA AGAAATAGTA GAGCTCTTGA ACATTAATTT TCAGGAAATT TCCCTCTCTC 420
GAAGCCAAAC AACTACGGAC CCAGCGGTAA CACAAGTAGC CTATAATGTT CTCATACGCT 480
GTAAAATAAT ATTTAAATTC AGCTACAGCA CTGTAGCTAC AGTACACCTA CAGTCCCTAA 540
TCCAAAAACA TTTCGTCATT GTAGCTGGAA TATATCGACC AAAAAGTATT GCTGTAAGTG 600
AAAATAGTTG TACATCTCTT CCGGAAAGTG AAATTTAAAG GTTTTCTGAA AGACACACAC 660
AGTCAGAATA GAAATTTGAT AGATTATATC TAGATTATGT TTGTGATTAA ATCAGTACAT 720
GGCTGAAATC TAAGCAATAG TGTGACGTCA TAATTTTTCA AAACATTAAT TAGCCGCCAA 780
GTTTGGTTCT TTGTAGGTCA ATTCTTTTGC TGGAACTCTA TGCTCATAAC CCTCTTTTGG 840
GGTAACATTT CATTT 855