EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00754 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:5453969-5454957 
TF binding sites/motifs
Number: 47             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:5454397-5454407AAAAAGAATA+3.51
blmp-1MA0537.1chrI:5454846-5454856AAATAGAAAA+4.67
blmp-1MA0537.1chrI:5454670-5454680AAATTGAAAA+4.82
ceh-22MA0264.1chrI:5454573-5454583GTCAATTGGT-3.31
ceh-22MA0264.1chrI:5454505-5454515TTTAAGTGTA-3.6
ceh-48MA0921.1chrI:5454857-5454865TTCAATAT+3.27
ceh-48MA0921.1chrI:5454195-5454203TTCAATAA+3.49
ces-2MA0922.1chrI:5454267-5454275TTATGAAA+3.25
ces-2MA0922.1chrI:5454006-5454014TATATAAA-3.3
ces-2MA0922.1chrI:5454540-5454548TATGTACT-3.46
ces-2MA0922.1chrI:5454005-5454013TTATATAA+4.53
che-1MA0260.1chrI:5454411-5454416AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:5454341-5454346GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:5454274-5454288AATGCGCGTGGTGT+3.93
dsc-1MA0919.1chrI:5454324-5454333GCAATTAAT+3.1
dsc-1MA0919.1chrI:5454324-5454333GCAATTAAT-3.1
elt-3MA0542.1chrI:5454320-5454327TTTAGCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:5454554-5454561GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:5454615-5454622GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:5454791-5454798GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:5454400-5454414AAGAATAAAAGAAA+3.24
eor-1MA0543.1chrI:5454398-5454412AAAAGAATAAAAGA+3.59
fkh-2MA0920.1chrI:5454023-5454030TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:5454250-5454257AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:5454531-5454538TATACAT+3.24
fkh-2MA0920.1chrI:5454029-5454036TAAACAG+3.71
hlh-1MA0545.1chrI:5454574-5454584TCAATTGGTG-3.58
lim-4MA0923.1chrI:5454263-5454271GCAATTAT+3.17
lim-4MA0923.1chrI:5454324-5454332GCAATTAA+3.81
pal-1MA0924.1chrI:5454325-5454332CAATTAA+4.01
pha-4MA0546.1chrI:5454715-5454724TTTTGCACA-3.05
pha-4MA0546.1chrI:5454891-5454900TTTTGCACA-3.05
pha-4MA0546.1chrI:5454747-5454756GAGTAAACT+3.08
pha-4MA0546.1chrI:5454923-5454932GAGTAAACT+3.08
pha-4MA0546.1chrI:5454373-5454382AAGCAAAAA+3.11
pha-4MA0546.1chrI:5454510-5454519GTGTAAACT+3.13
pha-4MA0546.1chrI:5454026-5454035AAATAAACA+3.87
skn-1MA0547.1chrI:5454011-5454025AAACGTTGAAAATA+3.8
sma-4MA0925.1chrI:5454233-5454243CCTAGAAAAA-3.17
unc-62MA0918.1chrI:5454760-5454771AAATGTCAGAA+3.64
unc-86MA0926.1chrI:5454380-5454387AATGCAT+3.11
unc-86MA0926.1chrI:5454328-5454335TTAATAC-3.35
vab-7MA0927.1chrI:5454683-5454690CAATGAG-3.09
vab-7MA0927.1chrI:5454325-5454332CAATTAA+3.16
zfh-2MA0928.1chrI:5454722-5454732CATAATTTGT+3.05
zfh-2MA0928.1chrI:5454898-5454908CATAATTTGA+3.05
zfh-2MA0928.1chrI:5454324-5454334GCAATTAATA-3.17
Enhancer Sequence
TACTAACACT AAAAACGAAT TTTATTAGTT GCAGGATTAT ATAAACGTTG AAAATAAAAA 60
TAAACAGACT AAAGTTTAGT TGGAGAAAAA AGTAGTTAAA TTTGTTTCAG ACTTTCAAAA 120
TGAGTCAAGA TATTATGCCA CAAAGTACAC GGTTTAGGAG AAAGGGTCCC TGTGGAGCAA 180
AATTCCAACT CTATCATATT ATTCAAATTA TAATATATAT ATAGTATTCA ATAAGCGCCA 240
CGGCGTGTAA ATTGGTACCT CTGGCCTAGA AAAAAGCTTG AAAAACAAAT GTACGCAATT 300
ATGAAAATGC GCGTGGTGTT TGCGGACTTG ACTACCGTAG TCCACATAAA TTTTAGCAAT 360
TAATACTTCC CGGTTTCGTT TTATATGAAA ATATCGTTGA ATTTAAGCAA AAATGCATTA 420
GTTTCACGAA AAAGAATAAA AGAAACCCTA AAAATATATG AAATTCAAAT ACAAAAAATA 480
TGAACTGCGC ATTGAACGAA ACAAAGCAGT TTGAAGCTGC ATTAAGGAAC AACGCTTTTA 540
AGTGTAAACT TGTGACGGTG GGTATACATT TTATGTACTT AAATTGTTAA AAAACCTTCA 600
TTTAGTCAAT TGGTGAAGTT TCAAAAACTT TGCGAATCTA GTTTTTGAAA AAATTTAAAA 660
TTTGTGGCAA TTTTACCGAT TTTTCGTGAA TTTCCGAGCT AAAATTGAAA AATTCAATGA 720
GAACTTGTGA CGGTGGGTAT GATTTTTTTT GCACATAATT TGTTTGAAAT AGTCTACTGA 780
GTAAACTGGT GAAATGTCAG AAACTTTGTG GATCTAGTTT TTGAAAAAAG TTTAAAAATG 840
TGCCAATTTT GACGAATTTT AGTGGTTTTT GGAGCTAAAA TAGAAAAATT CAATATGAAC 900
TTGTGACGGT GGGTATTATT TTTTTTGCAC ATAATTTGAT TATAATAGTC TACTGAGTAA 960
ACTGGTGAAA TTTTAGAAAA TTTGTGGA 988