EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00729 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:5229253-5230279 
TF binding sites/motifs
Number: 72             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:5229364-5229374GAGGCGAGGA+3.02
blmp-1MA0537.1chrI:5230092-5230102AGGAAGAAGA+3.13
blmp-1MA0537.1chrI:5229985-5229995CCTCATTCCT-3.18
blmp-1MA0537.1chrI:5230111-5230121AAATGGAATA+3.31
blmp-1MA0537.1chrI:5229446-5229456AGGAGGAGAA+3.34
blmp-1MA0537.1chrI:5230187-5230197TTTCTTCTTT-3.91
blmp-1MA0537.1chrI:5230190-5230200CTTCTTTTTT-4.07
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:5230164-5230177TAATGCCACCAAT-3.63
ceh-48MA0921.1chrI:5229764-5229772TTCGATAG+3.54
ces-2MA0922.1chrI:5229270-5229278TGTGTAAT-3.08
ces-2MA0922.1chrI:5229802-5229810TACATAAA-3.34
ces-2MA0922.1chrI:5229967-5229975TACATAAA-3.34
ces-2MA0922.1chrI:5229801-5229809TTACATAA+3.78
ces-2MA0922.1chrI:5229966-5229974TTACATAA+4.87
ces-2MA0922.1chrI:5229555-5229563TTACGTAA+5.22
ces-2MA0922.1chrI:5229556-5229564TACGTAAT-5.22
che-1MA0260.1chrI:5229454-5229459AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrI:5229319-5229324AAGCC+3.7
daf-12MA0538.1chrI:5229338-5229352TGTGCAACTGTTTG+3.09
dsc-1MA0919.1chrI:5229562-5229571ATAATTAAT+3.62
dsc-1MA0919.1chrI:5229562-5229571ATAATTAAT-3.62
dsc-1MA0919.1chrI:5230159-5230168TTAATTAAT+3.84
dsc-1MA0919.1chrI:5230159-5230168TTAATTAAT-3.84
efl-1MA0541.1chrI:5229568-5229582AATGACGGAAATTT+3.18
elt-3MA0542.1chrI:5229757-5229764GAAAAGA-3.31
eor-1MA0543.1chrI:5230188-5230202TTCTTCTTTTTTTC-3.98
fkh-2MA0920.1chrI:5229853-5229860TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:5230212-5230219TGTTGAC-3.55
fkh-2MA0920.1chrI:5229598-5229605TAAACAA+4.31
fkh-2MA0920.1chrI:5229607-5229614TAAACAA+4.31
lim-4MA0923.1chrI:5229273-5229281GTAATTAC+3.06
lim-4MA0923.1chrI:5229274-5229282TAATTACA-3.06
lim-4MA0923.1chrI:5229563-5229571TAATTAAT-3.12
lim-4MA0923.1chrI:5229938-5229946TTCATTAA+3.18
lim-4MA0923.1chrI:5229567-5229575TAATGACG-3.35
lim-4MA0923.1chrI:5229562-5229570ATAATTAA+3.57
lim-4MA0923.1chrI:5230159-5230167TTAATTAA+3.59
lim-4MA0923.1chrI:5230160-5230168TAATTAAT-3.75
pal-1MA0924.1chrI:5230116-5230123GAATAAA+3.15
pal-1MA0924.1chrI:5229963-5229970TCATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrI:5229563-5229570TAATTAA+3.54
pal-1MA0924.1chrI:5230135-5230142CAATAAC+3.69
pal-1MA0924.1chrI:5229567-5229574TAATGAC-3.73
pal-1MA0924.1chrI:5229678-5229685TTATGAC-3.79
pal-1MA0924.1chrI:5229274-5229281TAATTAC+3.85
pal-1MA0924.1chrI:5229274-5229281TAATTAC-3.85
pha-4MA0546.1chrI:5229595-5229604ATATAAACA+3.83
pha-4MA0546.1chrI:5229604-5229613ATATAAACA+3.83
pha-4MA0546.1chrI:5229475-5229484GTGTAAATA+4.36
pha-4MA0546.1chrI:5229347-5229356GTTTGCTCA-4.77
skn-1MA0547.1chrI:5229485-5229499GATTGATGACATTG+4.66
skn-1MA0547.1chrI:5230185-5230199TTTTTCTTCTTTTT-4.6
sma-4MA0925.1chrI:5229374-5229384GCTAGACGTT-3.04
unc-62MA0918.1chrI:5230213-5230224GTTGACAGATG-3.27
unc-86MA0926.1chrI:5229990-5229997TTCCTAC-3.42
unc-86MA0926.1chrI:5229999-5230006TAGGCAT+3.83
vab-7MA0927.1chrI:5230160-5230167TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:5230160-5230167TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrI:5229963-5229970TCATTAC-3.29
vab-7MA0927.1chrI:5229567-5229574TAATGAC-3.4
vab-7MA0927.1chrI:5229274-5229281TAATTAC+3.54
vab-7MA0927.1chrI:5229274-5229281TAATTAC-3.54
vab-7MA0927.1chrI:5229563-5229570TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:5230119-5230129TAAATTAAAA-3.07
zfh-2MA0928.1chrI:5229273-5229283GTAATTACAA-3.23
zfh-2MA0928.1chrI:5229272-5229282TGTAATTACA+3.26
zfh-2MA0928.1chrI:5230102-5230112GTTAATTTAA+3.26
zfh-2MA0928.1chrI:5229941-5229951ATTAATTCAA+3.28
zfh-2MA0928.1chrI:5229561-5229571AATAATTAAT+3.46
zfh-2MA0928.1chrI:5230158-5230168TTTAATTAAT+3.84
zfh-2MA0928.1chrI:5229562-5229572ATAATTAATG-3.99
zfh-2MA0928.1chrI:5230159-5230169TTAATTAATG-4.31
Enhancer Sequence
TAGACGGTTC CATGCAATGT GTAATTACAA TTTGAAATTC CGAAAATTTT GGAAAAAATT 60
CGGAAGAAGC CCCCCCTCTG TGATGTGTGC AACTGTTTGC TCAAGTGACC AGAGGCGAGG 120
AGCTAGACGT TTATTTGGTT ACTATTAACT AATAACTACA GTATCCACTG ACTCTTGGAC 180
ACAAAGGAAC TGAAGGAGGA GAAGCGCCTC GATTTGGAGG CTGTGTAAAT AGGATTGATG 240
ACATTGATTC AATTTGGACG ATTGCCATGG ATTTTTGGAG CGCGTGATGA TGCGGATGGC 300
TATTACGTAA TAATTAATGA CGGAAATTTC GACAATTTTA CAATATAAAC AATATAAACA 360
AAATCTGGGG GACTTCTTTG AATAACATTG CTCATGCTTT TCTTCAAATC ACGCTCAAAG 420
GTTCTTTATG ACTCTGGAAA ACTATAAACG ACCTTGGCAC GACCAAAAAA TTTTTGAGAT 480
TTTTGAAGAT TGCAAAAAAA TTGTGAAAAG ATTCGATAGA GAAACATCAG TGAAAGAAAT 540
GTTAAATGTT ACATAAAACA TTTTTCACAT GGTAGCCAAA TCGAGATGCC AGCCCAATCT 600
TCAACAAGAT CAAATAACTT TTTTTGTAGA TTTATTCAAT CTACAGTACC CCTTCCGCCA 660
AACTCAATTT TTGTGATTTT CCTCGTTCAT TAATTCAAAA TATCCTAAAT TCATTACATA 720
AAACTCGATT TCCCTCATTC CTACCGTAGG CATCATCTAA TATAAAGTTG ATATTCTGAC 780
GACGTCTTTG TTCGGCGGTT ATTTGGTTTT TCACTCTAAA TCTAGAAGGT TTGATTTTGA 840
GGAAGAAGAG TTAATTTAAA ATGGAATAAA TTAAAAAGAA AGCAATAACT TGATTATGAA 900
CAATTTTTAA TTAATGCCAC CAATTTTTGA GATTTTTCTT CTTTTTTTCG ACAAATACCT 960
GTTGACAGAT GCGATGAACC GCTAAGGAGA TAACTATAAA ATATGATTTT ATGAGTTACC 1020
ATGAAC 1026