EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00550 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:3678544-3679381 
TF binding sites/motifs
Number: 66             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:3678988-3678998TGAAAGAGAA+3.01
blmp-1MA0537.1chrI:3678964-3678974GAATTGAGTG+3.03
blmp-1MA0537.1chrI:3679051-3679061GGATTGATAA+3.12
blmp-1MA0537.1chrI:3678990-3679000AAAGAGAATT+3.22
blmp-1MA0537.1chrI:3678919-3678929TTTCACTCAT-3.22
blmp-1MA0537.1chrI:3679287-3679297TTTCAATTCC-3.95
blmp-1MA0537.1chrI:3678915-3678925TCTCTTTCAC-3
blmp-1MA0537.1chrI:3678913-3678923TCTCTCTTTC-4.19
blmp-1MA0537.1chrI:3679195-3679205AAATTGAAAA+4.82
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:3678614-3678627TAAGGAAACGAAT-3.94
ceh-22MA0264.1chrI:3679023-3679033CTGGAGTGTA-3.46
ceh-22MA0264.1chrI:3678845-3678855CCACTCGTCG+3.48
ces-2MA0922.1chrI:3679063-3679071TTACAAAA+3.45
ces-2MA0922.1chrI:3678900-3678908TTGCATAA+3.46
ces-2MA0922.1chrI:3678960-3678968TATGGAAT-3.46
che-1MA0260.1chrI:3678619-3678624AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:3679350-3679355AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:3678951-3678956GTTTC-3.06
daf-12MA0538.1chrI:3678834-3678848TGTGTGTGTGGCCA+3.06
daf-12MA0538.1chrI:3678719-3678733AAACACAAACTCTT-3.24
daf-12MA0538.1chrI:3678832-3678846TATGTGTGTGTGGC+5.01
efl-1MA0541.1chrI:3679002-3679016GAGGGGGGGAAATG+3.4
efl-1MA0541.1chrI:3678598-3678612GTGGCCGCAAAAAT+3.55
efl-1MA0541.1chrI:3679226-3679240GTGGGCGGCAATTG+4.48
elt-3MA0542.1chrI:3679216-3679223TCTATCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:3678930-3678937GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:3679056-3679063GATAAGA-4.66
eor-1MA0543.1chrI:3678981-3678995GAGATAATGAAAGA+3.25
eor-1MA0543.1chrI:3679000-3679014TAGAGGGGGGGAAA+3.42
eor-1MA0543.1chrI:3678748-3678762CTCTAACTCTTTTT-3.42
eor-1MA0543.1chrI:3678930-3678944GAGAAAAGCAGCGA+3.53
eor-1MA0543.1chrI:3679111-3679125AAAAGACCTAGAAA+3.61
eor-1MA0543.1chrI:3678916-3678930CTCTTTCACTCATT-3.68
eor-1MA0543.1chrI:3678910-3678924CTGTCTCTCTTTCA-4.04
eor-1MA0543.1chrI:3678912-3678926GTCTCTCTTTCACT-4.25
eor-1MA0543.1chrI:3678908-3678922ATCTGTCTCTCTTT-4.28
eor-1MA0543.1chrI:3678914-3678928CTCTCTTTCACTCA-4.87
fkh-2MA0920.1chrI:3679201-3679208AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrI:3679077-3679084TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3679345-3679352TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3678826-3678833TATACAT+3.24
fkh-2MA0920.1chrI:3678824-3678831TGTATAC-3.33
fkh-2MA0920.1chrI:3678761-3678768TGTTTAC-4.66
hlh-1MA0545.1chrI:3679232-3679242GGCAATTGCC+3.57
hlh-1MA0545.1chrI:3679233-3679243GCAATTGCCG-3.57
lin-14MA0261.1chrI:3678580-3678585TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:3678574-3678586ATGTTGTGTTCC+3.64
mab-3MA0262.1chrI:3678549-3678561ATGTTGCGCAAA+3.6
pal-1MA0924.1chrI:3679031-3679038TAATAAG+3.11
pal-1MA0924.1chrI:3678884-3678891CAATAAA+3.46
pha-4MA0546.1chrI:3678823-3678832GTGTATACA+3.01
pha-4MA0546.1chrI:3678715-3678724GTTCAAACA+3.05
pha-4MA0546.1chrI:3679163-3679172GTTTAGTTT-3.16
pha-4MA0546.1chrI:3679035-3679044AAGGAAACA+3.21
pha-4MA0546.1chrI:3679125-3679134AAGCAAAAA+3.23
skn-1MA0547.1chrI:3679274-3679288ATTTGCTGAAAATT+3.92
sma-4MA0925.1chrI:3679117-3679127CCTAGAAAAA-3.01
sma-4MA0925.1chrI:3679171-3679181TTTTCTAGGC+3.17
sma-4MA0925.1chrI:3678736-3678746ACCAGTCACC-3.73
unc-62MA0918.1chrI:3678908-3678919ATCTGTCTCTC+3.04
unc-62MA0918.1chrI:3678942-3678953GAAGACAGCGT-3.13
unc-86MA0926.1chrI:3678828-3678835TACATAT-3.06
unc-86MA0926.1chrI:3678877-3678884TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrI:3678875-3678882TATTAAT+3.35
vab-7MA0927.1chrI:3678925-3678932TCATTGA+3.09
vab-7MA0927.1chrI:3678985-3678992TAATGAA+3.35
Enhancer Sequence
CAAATATGTT GCGCAAAACG CATTCTCAGA ATGTTGTGTT CCCGTAATAT GTACGTGGCC 60
GCAAAAATCA TAAGGAAACG AATTGAAAAC GGTACGATAC TTGTGGAGTT TAGTTCGCGG 120
TAGGACCCTG GTCACTAGAT AGGTCAACTT TTTGTAGAAA GTGTTATATT AGTTCAAACA 180
CAAACTCTTT TGACCAGTCA CCTACTCTAA CTCTTTTTGT TTACTGGAGA CTTTGAATAA 240
GTCGATGAAT CATTGGCAAA CTATGAAAAG TCACTAAATG TGTATACATA TGTGTGTGTG 300
GCCACTCGTC GTAATTCACA CAACGGATTT GTATTAATAA CAATAAAAGA ATTGAATTGC 360
ATAAATCTGT CTCTCTTTCA CTCATTGAGA AAAGCAGCGA AGACAGCGTT TCTTTTTATG 420
GAATTGAGTG AATTCGTGAG ATAATGAAAG AGAATTTAGA GGGGGGGAAA TGTGTAGTTC 480
TGGAGTGTAA TAAGGAAACA TGGTATAGGA TTGATAAGAT TACAAAACAA ATTTGTTGAA 540
AAGCTAGAAT GCTTAACTTA AATGTCTAAA AGACCTAGAA AAAGCAAAAA CTCGGCCACT 600
CTGGAAAATT GCTGGTCGTG TTTAGTTTTT TCTAGGCTAC GTCGCAATCT AAAATTGAAA 660
ACATTTTGTG ATTCTATCAG GGGTGGGCGG CAATTGCCGT TGGGCAAATC GGCAAATTGA 720
AGATTTCCCG ATTTGCTGAA AATTTTCAAT TCCGGCAATT TGTGGGTTTG CCGATTTGCC 780
GGATATCAGA TTTGCCGGAA TTGTTGAAAC GGAATTTTTT CTTGAAAAGC GGAAACA 837