EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00508 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:3308937-3310507 
TF binding sites/motifs
Number: 87             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:3309635-3309645AAGAAGAGTA+3.02
blmp-1MA0537.1chrI:3309296-3309306GAGAAGAAGA+3.07
blmp-1MA0537.1chrI:3309650-3309660AAGAGGAGAC+3.21
blmp-1MA0537.1chrI:3309402-3309412CATCCATTTC-3.24
blmp-1MA0537.1chrI:3309707-3309717CCTCTTTTTT-3.36
blmp-1MA0537.1chrI:3309299-3309309AAGAAGAAGG+3.39
blmp-1MA0537.1chrI:3309477-3309487TTTCAACTTT-3.3
blmp-1MA0537.1chrI:3310471-3310481GAAAAGAGGG+3.43
blmp-1MA0537.1chrI:3309303-3309313AGAAGGAAGA+3.52
blmp-1MA0537.1chrI:3309774-3309784GGAAAGAGAG+3.53
blmp-1MA0537.1chrI:3308991-3309001TCTCTATTCC-3.77
blmp-1MA0537.1chrI:3309293-3309303AAAGAGAAGA+4.43
blmp-1MA0537.1chrI:3310380-3310390AAATTGAAAG+4.78
blmp-1MA0537.1chrI:3310386-3310396AAAGGGAAAA+5.19
blmp-1MA0537.1chrI:3309776-3309786AAAGAGAGAG+5.21
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:3309395-3309408TTGGCTCCATCCA+4.39
ceh-22MA0264.1chrI:3309342-3309352CTCAATTGGA-3.12
ceh-22MA0264.1chrI:3310419-3310429TTCAAGTGTC-4.24
ceh-22MA0264.1chrI:3309228-3309238CTCAAGTGTT-4.34
ceh-22MA0264.1chrI:3309424-3309434ACACTTGAAG+4
ceh-48MA0921.1chrI:3310006-3310014ATCAATAT+3.16
ceh-48MA0921.1chrI:3308949-3308957GATCGATT-3.21
ceh-48MA0921.1chrI:3308950-3308958ATCGATTT+3.24
ceh-48MA0921.1chrI:3309278-3309286TATTGGTC-3.52
ces-2MA0922.1chrI:3309848-3309856TTATGTGA+3.27
ces-2MA0922.1chrI:3309849-3309857TATGTGAT-3.55
che-1MA0260.1chrI:3310015-3310020AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrI:3310078-3310083AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:3309064-3309069GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:3309476-3309481GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:3310231-3310245AAACACTGACACAT-3.08
daf-12MA0538.1chrI:3309835-3309849ATGCACACACTTAT-4.69
dsc-1MA0919.1chrI:3309692-3309701CTGATTAGT+3.1
dsc-1MA0919.1chrI:3309692-3309701CTGATTAGT-3.1
efl-1MA0541.1chrI:3310145-3310159AATTCCGGCAAATT+3.06
efl-1MA0541.1chrI:3310013-3310027TGAAGCGCAAATTT+3.08
efl-1MA0541.1chrI:3308997-3309011TTCCGAGCCAAAAC+3.09
efl-1MA0541.1chrI:3309755-3309769AATGGCGGGACGAA+3.12
efl-1MA0541.1chrI:3310256-3310270TCACGCGCGTAATG+3.79
efl-1MA0541.1chrI:3309965-3309979GTTTTGCGCGTAAA-3.95
efl-1MA0541.1chrI:3309922-3309936TGACGCGCAAAATT+4.04
elt-3MA0542.1chrI:3309150-3309157TTAATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:3309601-3309608GATAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:3309548-3309555TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:3309812-3309819GATAAGA-4.66
eor-1MA0543.1chrI:3309775-3309789GAAAGAGAGAGCAA+3.31
eor-1MA0543.1chrI:3309710-3309724CTTTTTTTTTCCAC-3.31
eor-1MA0543.1chrI:3310446-3310460TTGTTCTTCTTCCC-3.32
eor-1MA0543.1chrI:3309409-3309423TTCTTGGTTTTTTT-3.44
eor-1MA0543.1chrI:3309297-3309311AGAAGAAGAAGGAA+3.55
eor-1MA0543.1chrI:3309773-3309787GGGAAAGAGAGAGC+3.79
eor-1MA0543.1chrI:3309708-3309722CTCTTTTTTTTTCC-3.86
eor-1MA0543.1chrI:3309769-3309783TGGAGGGAAAGAGA+4.23
eor-1MA0543.1chrI:3309294-3309308AAGAGAAGAAGAAG+5.17
fkh-2MA0920.1chrI:3310296-3310303TATTTAC-3.21
fkh-2MA0920.1chrI:3310268-3310275TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrI:3310331-3310338TAAACAC+3.37
fkh-2MA0920.1chrI:3309953-3309960TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:3310102-3310109TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:3309419-3309426TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrI:3309748-3309755TCAACAA+3.76
hlh-1MA0545.1chrI:3310408-3310418ACAAGTGCTC-3.43
hlh-1MA0545.1chrI:3310407-3310417AACAAGTGCT+3.54
lim-4MA0923.1chrI:3309693-3309701TGATTAGT-3.28
lin-14MA0261.1chrI:3309333-3309338AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:3309448-3309453TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:3309193-3309198CGTTC-3.36
mab-3MA0262.1chrI:3309795-3309807AAGAGCAACATT-3.64
pal-1MA0924.1chrI:3309935-3309942TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrI:3310105-3310112TTATGGC-3.51
pal-1MA0924.1chrI:3309790-3309797TAATAAA+3.63
pal-1MA0924.1chrI:3309990-3309997TTATTGC-3.69
pha-4MA0546.1chrI:3309640-3309649GAGTAAATC+3.05
pha-4MA0546.1chrI:3310269-3310278GTTTAATTT-3.15
pha-4MA0546.1chrI:3309420-3309429TTTTACACT-3.22
pha-4MA0546.1chrI:3309745-3309754TTGTCAACA+3.33
pha-4MA0546.1chrI:3309783-3309792GAGCAAATA+4.64
skn-1MA0547.1chrI:3309633-3309647AAAAGAAGAGTAAA+3.84
skn-1MA0547.1chrI:3310129-3310143AAATGTAGAAATTT+3.89
sma-4MA0925.1chrI:3309124-3309134ACTAGAAACA-3.02
unc-62MA0918.1chrI:3310422-3310433AAGTGTCATTT+3.1
unc-62MA0918.1chrI:3309737-3309748ACCTGTCCTTG+3.48
unc-62MA0918.1chrI:3309431-3309442AAGGACAGGTT-3.48
unc-86MA0926.1chrI:3309274-3309281TGCATAT-3.18
zfh-2MA0928.1chrI:3309930-3309940AAAATTAATT-3.19
zfh-2MA0928.1chrI:3309933-3309943ATTAATTTCA+3.2
zfh-2MA0928.1chrI:3310270-3310280TTTAATTTTT+3
Enhancer Sequence
AGTCCATTTT GAGATCGATT TTTGGGACTT TGAAATTTCC CTAAAATTTG AATTTCTCTA 60
TTCCGAGCCA AAACACTAAT CTGTGAGTTA CAAAGTTCAG GTAGCCAGTA CCAAAAAACT 120
GTGCATGGTT TCTAAAACAC AGAAAATAGG TCGTAGGCAC GCATGCAGGT AGGCAAAACT 180
TCTGTGCACT AGAAACAAAA GTATGTATAA AGTTTAATCA CCGAAAATAA AAGTGTTTTT 240
AGATGAAAGT GTACGGCGTT CAAAACTTCA TAGTTACGGA GGAAGGGGGG TCTCAAGTGT 300
TAGAGGAGGG GTCCTCAAGT GAAAGCAACA AAAGGGGTGC ATATTGGTCA TTTTTAAAAG 360
AGAAGAAGAA GGAAGAATAG TTTTGCAGGA TTTTTGAACA GAAAACTCAA TTGGAAAATT 420
TTTAATTTTA AAGAAAAACA TAAATTTAAA AAAAAACATT GGCTCCATCC ATTTCTTGGT 480
TTTTTTTACA CTTGAAGGAC AGGTTCAAAG ATGTTCTAAA TTTCAAAAAA GTGTCTTTGG 540
TTTCAACTTT TGACACAAAA AAGTCTTTGA ATAATTTAAG GGGGCTCCAA AATTTTGCAC 600
ATCTTCAAAT TTTTTTCAAA ACTGGAAAAA GCAAAACGGA AGAGCAGCGG GCGGAGAGAC 660
GGGGGATAAG AAGTCGTGGG AATTCGGGTT GACACAAAAA GAAGAGTAAA TCAAAGAGGA 720
GACCCTGCCT ACCCCATCCA TCACTTTACT CTCGTCTGAT TAGTTTCAGA CCTCTTTTTT 780
TTTCCACGTG ATGTGCACCT ACCTGTCCTT GTCAACAAAA TGGCGGGACG AATGGAGGGA 840
AAGAGAGAGC AAATAATAAA GAGCAACATT TCTTTGATAA GATTACAATC ATAGTACGAT 900
GCACACACTT ATTATGTGAT TAACTGCACG GCGCAAGGAA CGATGCGCGT CAAATTTGGT 960
GCATTGGTTG AGAATACATC AGATTTGACG CGCAAAATTA ATTTCAGTGG GAGGTATAAA 1020
AAAAACTAGT TTTGCGCGTA AAATATGGTG CAGTTATTGC GGTTCACACA TCAATATGAA 1080
GCGCAAATTT AAAACTATCC GAATTTTGGA ATATGGCGTT TTTGTTAGCT ATAACGACTT 1140
GAAACCAGGG GTGGGGTCAA ACGATTTTTT ATGGCAATTC GCCAAATCGG CAAAATGTAG 1200
AAATTTAAAA TTCCGGCAAA TTGGCACATC GACAAATTGC CTGAATAGAA AATTTCCGGC 1260
AAACCGGCAA AAATTGGAAA TCATGGTGCA TCAGAAACAC TGACACATAA TTTTAAGCTT 1320
CACGCGCGTA ATGTTTAATT TTTTTGGATT TTAACGGATT ATTTACAACG CTCTGCGCTT 1380
TAAATGTTAA ATGTTAAACA CTAAAAAGTT CGAAAACCAT TCAGAAATTT AAAACGAGAA 1440
CAAAAATTGA AAGGGAAAAT ACTCGCCGAG AACAAGTGCT CCTTCAAGTG TCATTTTGCT 1500
CGGAATTTTT TGTTCTTCTT CCCACACCTT TAAAGAAAAG AGGGGGTCTT CCCCCGGATG 1560
TTATCGTCAT 1570