EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00478 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:3052389-3053194 
TF binding sites/motifs
Number: 41             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:3052518-3052528AAATCGAGAT+3.48
blmp-1MA0537.1chrI:3053173-3053183TCTCGATTTT-3.48
blmp-1MA0537.1chrI:3052488-3052498TCTCATTTTC-3.86
blmp-1MA0537.1chrI:3052887-3052897TTTCAATTTT-4.82
blmp-1MA0537.1chrI:3052944-3052954TTTCAATTTT-4.82
ceh-22MA0264.1chrI:3052740-3052750TTTAATTGGA-3.06
ceh-22MA0264.1chrI:3052933-3052943ACACTCCAAA+3.77
ceh-22MA0264.1chrI:3052754-3052764TTGGAGTGTT-3.77
ces-2MA0922.1chrI:3052389-3052397TTGCACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:3052613-3052621TGTGCAAT-3.01
ces-2MA0922.1chrI:3052644-3052652CACGTAAT-3.59
dsc-1MA0919.1chrI:3052741-3052750TTAATTGGA+3
dsc-1MA0919.1chrI:3052741-3052750TTAATTGGA-3
efl-1MA0541.1chrI:3052403-3052417TGACGCGCAAAATA+3.67
efl-1MA0541.1chrI:3053094-3053108TGACGCGCAAAATA+3.67
efl-1MA0541.1chrI:3052593-3052607ATTTTGCGCGTCAA-3.67
elt-3MA0542.1chrI:3052794-3052801GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:3052885-3052892TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:3053026-3053033GAAAAAA-3
fkh-2MA0920.1chrI:3052732-3052739TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:3052961-3052968TATACAT+3.12
lim-4MA0923.1chrI:3052742-3052750TAATTGGA-3.74
lin-14MA0261.1chrI:3052711-3052716AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:3052981-3052986TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:3052640-3052645TGTTC-3.62
pha-4MA0546.1chrI:3052653-3052662ATGAAAATA+3.1
pha-4MA0546.1chrI:3053039-3053048ATTTTCATT-3.1
skn-1MA0547.1chrI:3052492-3052506ATTTTCATGATGTG-3.88
skn-1MA0547.1chrI:3053012-3053026AAATGTAGAAATTT+3.89
skn-1MA0547.1chrI:3052672-3052686AATTTCTACATTTT-3.89
unc-86MA0926.1chrI:3053074-3053081TGCGTAC-3.04
unc-86MA0926.1chrI:3052961-3052968TATACAT+3.07
unc-86MA0926.1chrI:3052620-3052627TACGCAT+3.29
unc-86MA0926.1chrI:3052554-3052561TAGTCAT+3.42
unc-86MA0926.1chrI:3052449-3052456TGACTAC-3.42
unc-86MA0926.1chrI:3053140-3053147TGACTAC-3.42
vab-7MA0927.1chrI:3052651-3052658TAATGAA+3.35
vab-7MA0927.1chrI:3053043-3053050TCATTAT-3.35
vab-7MA0927.1chrI:3052742-3052749TAATTGG-3.7
zfh-2MA0928.1chrI:3052504-3052514TGAATTAAAT-3.15
zfh-2MA0928.1chrI:3052740-3052750TTTAATTGGA+3.34
Enhancer Sequence
TTGCACAACA TATTTGACGC GCAAAATATC TCGTAGCGAA AACTACAGTA ATTCTTTAAA 60
TGACTACTGT AGCGCTCTTG TGTGTGTCGA TTTACGGGAT CTCATTTTCA TGATGTGAAT 120
TAAATTCGAA AATCGAGATC CCGTAAATCG ACGCAAGAGC TACAGTAGTC ATTTAAAGAA 180
TTACTGTAGT TTTCGCTACG AGATATTTTG CGCGTCAAAT ATGTTGTGCA ATACGCATTT 240
TCAGAATTTT GTGTTCACGT AATAATGAAA ATAAAATTTT TTAAATTTCT ACATTTTCAG 300
ACTTTTTTTT TGGGATTTTT GGAACATATA TTTTGAAGGA ATTTGTTTTT TTTTAATTGG 360
AAAATTTGGA GTGTTTGAAA AATTTCGGTT TTTTTTTGAA ATAATGATCA AAAAATTTTT 420
TAAAAATCGG GTTGGAAAAA AAAGCTTAAA AATTTAAATT TTTAGACTTT TTCACAACTT 480
TTCCCCAATA ATTTTTTTTT TCAATTTTTC CAATATCATT TCAAAAACAT TGAAATTTTT 540
TCTAACACTC CAAATTTTCA ATTTTTTTAA AATATACATC CTTCAAAATA TATGTTCCAA 600
AAATCTCAAA AAAAAAAGTC TGAAAATGTA GAAATTTGAA AAAAAAAAAT ATTTTCATTA 660
TTACGGGTGC ACAAAATTCT GAAAATGCGT ACTGCACAAC ATATTTGACG CGCAAAATAT 720
CTCGTAGCGA AAACTACAGT AATACTTTAA ATGACTACTG TAGCTCTTGC GTCGATTCAC 780
GGGATCTCGA TTTTCGAATT TAAAA 805