EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00445 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:2850600-2851510 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:2850897-2850907TCTCGTCTCT-3.17
blmp-1MA0537.1chrI:2850840-2850850GAAATGAGAT+3.37
blmp-1MA0537.1chrI:2850969-2850979TCTCTTCTTT-3.3
blmp-1MA0537.1chrI:2851019-2851029GGAGCGAAAA+3.63
blmp-1MA0537.1chrI:2851283-2851293AAAATGAGAT+3.86
ceh-22MA0264.1chrI:2851362-2851372TTCAATTGTA-3.06
ceh-22MA0264.1chrI:2851201-2851211ATACTTGAAT+3.35
ceh-22MA0264.1chrI:2851189-2851199ATACTTGACA+3.65
ceh-48MA0921.1chrI:2851086-2851094ACCGATTT+3.22
ceh-48MA0921.1chrI:2851031-2851039AATTGATT-3.22
ceh-48MA0921.1chrI:2851185-2851193ACCAATAC+3.69
ces-2MA0922.1chrI:2850641-2850649TCATATAA+3.25
ces-2MA0922.1chrI:2851195-2851203GACATAAT-3.27
ces-2MA0922.1chrI:2851318-2851326TTATACAA+4.13
che-1MA0260.1chrI:2851388-2851393GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:2851461-2851466GTTTC-3.36
efl-1MA0541.1chrI:2851336-2851350TTCTTGCGCCCGAC-3.43
elt-3MA0542.1chrI:2850980-2850987GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:2850771-2850778GATAACC-3.19
elt-3MA0542.1chrI:2851469-2851476GATAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrI:2851221-2851228GATAAGT-3.75
elt-3MA0542.1chrI:2851158-2851165GTTATCA+4.15
eor-1MA0543.1chrI:2850962-2850976GTCCTTGTCTCTTC-3.92
fkh-2MA0920.1chrI:2850670-2850677TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:2851368-2851375TGTATAT-3.35
lim-4MA0923.1chrI:2851314-2851322CCAATTAT+3.1
lim-4MA0923.1chrI:2851034-2851042TGATTACT-3.27
lin-14MA0261.1chrI:2851396-2851401TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrI:2850851-2850856TGTTC-3.14
mab-3MA0262.1chrI:2851476-2851488TTTTTGCGAAGT+3.95
pal-1MA0924.1chrI:2851034-2851041TGATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrI:2850928-2850935CAATGAA+3
pha-4MA0546.1chrI:2850830-2850839GAGAAAATA+3.19
pha-4MA0546.1chrI:2850923-2850932ATTTGCAAT-3.51
pha-4MA0546.1chrI:2851183-2851192AAACCAATA+3.52
sma-4MA0925.1chrI:2850806-2850816TCTAGAAAAA-3.21
sma-4MA0925.1chrI:2851398-2851408TTCAGACAAT-3.47
sma-4MA0925.1chrI:2850803-2850813ATGTCTAGAA+4.14
snpc-4MA0544.1chrI:2851260-2851271GTGGCCGACAT-5.46
snpc-4MA0544.1chrI:2851341-2851352GCGCCCGACAC-5.5
snpc-4MA0544.1chrI:2851443-2851454GCGGCCGACAC-7.5
unc-62MA0918.1chrI:2850713-2850724GTTGACAATTT-3.1
unc-62MA0918.1chrI:2851129-2851140ATTGACAGGGA-3.67
unc-86MA0926.1chrI:2851080-2851087TGACTAA-3.37
vab-7MA0927.1chrI:2851315-2851322CAATTAT+3.03
vab-7MA0927.1chrI:2851030-2851037TAATTGA+3.15
vab-7MA0927.1chrI:2851100-2851107TAATTGA+3.15
zfh-2MA0928.1chrI:2851056-2851066TTTAATTCGA+3.34
Enhancer Sequence
AAAAAATGGC AAAAACTAAC ATTCTTCCAA TTTTCAAAAA ATCATATAAA ATTTGGAATT 60
TTTTAAAGAA TTTTTATACT ATGATATTTG GACCTTTAAG CTGCGTTTTT GTAGTTGACA 120
ATTTAAAAAA AAACTCCAAA TTGCTTTGAA AACTACCAAA ATGAGTACCC TGATAACCAT 180
ATTGAAAAAC CATCAAATGG GTAATGTCTA GAAAAATGAA CGAAAAATTA GAGAAAATAG 240
GAAATGAGAT ATGTTCTTCT TCCTATTCTT TATCTTCTAA GCTTCTCACA CCTTTTCTCT 300
CGTCTCTCCA CGATTTACAC ACTATTTGCA ATGAATCTCA CTCTGATGAG CGTATCTATC 360
AAGTCCTTGT CTCTTCTTTT GACAAAACTT CAAAGAAATC GCCGACTTGC GAGGAGGGGG 420
GAGCGAAAAA TAATTGATTA CTGTACATCT TTATTTTTTA ATTCGATTTT CTGATGGCAA 480
TGACTAACCG ATTTTCGGGA TAATTGAGAT GAGGGGAGGT ATTTTGGGAA TTGACAGGGA 540
GGTATTTCTG CAGATTTTGT TATCAGAGTG TACTGTAGCT CTAAAACCAA TACTTGACAT 600
AATACTTGAA TCTATACAGT TGATAAGTTT TTTTGCAGTT TCAAGTTGAA TAAAGTTATA 660
GTGGCCGACA TCTTAGAGGT CTAAAAATGA GATTTTGGTC AAATTTGAGC TAGTCCAATT 720
ATACAACTAA TCGCAGTTCT TGCGCCCGAC ACTTTACGGG ATTTCAATTG TATATGTTTT 780
GTTTCAAGGT TTCATCTGTT CAGACAATGC GAAGCATTTT GTTGGCAGGT TTACAAAGTT 840
TTAGCGGCCG ACACCTCGCG GGTTTCTAAG ATAAGATTTT TGCGAAGTCT TCAGCCATCT 900
GTAAGCTACA 910