EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00270 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:1689155-1690020 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:1689297-1689307CCTCTTTTCC-3.06
blmp-1MA0537.1chrI:1689518-1689528TCTCCCCTTT-3.93
blmp-1MA0537.1chrI:1689596-1689606AAAGCGAAAC+4.05
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:1689461-1689474TAACGGAAAAAAT-3.58
ceh-22MA0264.1chrI:1689977-1689987ATACTTCAAA+3.49
ceh-48MA0921.1chrI:1689782-1689790TATTGGAT-3.33
ces-2MA0922.1chrI:1689623-1689631TACAAAAT-3.19
ces-2MA0922.1chrI:1689823-1689831TTCATAAT-3.25
ces-2MA0922.1chrI:1689428-1689436GACATAAT-3.27
ces-2MA0922.1chrI:1689822-1689830TTTCATAA+3.43
che-1MA0260.1chrI:1689564-1689569AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:1689602-1689607AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:1689515-1689520GCTTC-3.7
dsc-1MA0919.1chrI:1689909-1689918TTAATTACC+3.59
dsc-1MA0919.1chrI:1689909-1689918TTAATTACC-3.59
efl-1MA0541.1chrI:1689301-1689315TTTTCCCGCAATTT-4.04
elt-3MA0542.1chrI:1689532-1689539GATAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:1689679-1689686GGTAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:1689571-1689578GCTAAGA-3.45
eor-1MA0543.1chrI:1689292-1689306CTGCGCCTCTTTTC-3.46
eor-1MA0543.1chrI:1689290-1689304CTCTGCGCCTCTTT-5.04
fkh-2MA0920.1chrI:1689316-1689323TGTAGAC-3.02
fkh-2MA0920.1chrI:1689811-1689818AAAACAC+3.08
fkh-2MA0920.1chrI:1689685-1689692AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:1689534-1689541TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:1689778-1689785TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:1689681-1689688TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrI:1689492-1689499TGTTGAT-3.57
hlh-1MA0545.1chrI:1689652-1689662ACAATTGCCT-3.22
hlh-1MA0545.1chrI:1689651-1689661AACAATTGCC+4.39
lim-4MA0923.1chrI:1689156-1689164GCCATTAG+3.02
lim-4MA0923.1chrI:1689910-1689918TAATTACC-4.64
lin-14MA0261.1chrI:1689346-1689351AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:1689555-1689560TGTTC-3.14
pal-1MA0924.1chrI:1689910-1689917TAATTAC-4.27
pha-4MA0546.1chrI:1689493-1689502GTTGATTTG-3.42
sma-4MA0925.1chrI:1689707-1689717ACCAGAAAAC-3.23
sma-4MA0925.1chrI:1689804-1689814TTGTCTGAAA+3.26
sma-4MA0925.1chrI:1689559-1689569CCTAGAAACG-3.2
sma-4MA0925.1chrI:1689507-1689517TTGACTAGGC+3.33
vab-7MA0927.1chrI:1689827-1689834TAATGAA+3.35
vab-7MA0927.1chrI:1689910-1689917TAATTAC-3.88
zfh-2MA0928.1chrI:1689484-1689494AAAATTAGTG-3.01
zfh-2MA0928.1chrI:1689909-1689919TTAATTACCA-3.49
zfh-2MA0928.1chrI:1689908-1689918TTTAATTACC+3.65
zfh-2MA0928.1chrI:1689992-1690002ACTAATTTTA+3
zfh-2MA0928.1chrI:1689888-1689898AAAATTAGTT-3
zfh-2MA0928.1chrI:1689933-1689943AAAATTAGTT-3
Enhancer Sequence
AGCCATTAGT TCAAGACTAT CACATGGTGC CAGTCTGTCC CATCACGGTT TGATCTACAA 60
AAAATGTGGG AGTTTTTTGC CCAACAAAAA TAAGTGACGT CAGCACGTTC TTAACCATAC 120
GAAATCAGTT GAGAACTCTG CGCCTCTTTT CCCGCAATTT TTGTAGACCT ATGTAGATCA 180
AACCGAAATG GAACAGTTTT TCACCACGTG GGCTATAGTG AATAGTATAT TAGTGGAAAT 240
TGGTGAGTCA CAATTTGATT TTTAATCCAA TTTGACATAA TTTTTTTCGC ACACTAACTT 300
TTTTTTTAAC GGAAAAAATG ATTTTCCACA AAATTAGTGT TGATTTGCCT GATTGACTAG 360
GCTTCTCCCC TTTCTTGGAT AAAAAAGTAG TAGTAGTTAA TGTTCCTAGA AACGTTGCTA 420
AGAAAAATAA TTTTGTACCA AAAAGCGAAA CCTAAAAAAA CTAAATTTTA CAAAATATAA 480
AAGATTTTTA AGTTACAACA ATTGCCTTTT TTTTGAATTT TTTTGGTAAA AAAACAATTT 540
TTCTGTGAAA TTACCAGAAA ACCGGTTTTA AAACCCAAAT AATGGCCATG CTTGGAAGTA 600
TATCAAAGAT AATGTACTCA AATTTTTTAT TGGATTATTA GACTCAAAAT TGTCTGAAAA 660
CACCGAATTT CATAATGAAA CTTCTTTTTA AAAAATTTCT CAAAAAAAGT TACGAAGGCT 720
CAAAAAATGA CCTAAAATTA GTTGAACTAT TTTTTTAATT ACCATCTTAT TTCAAAAAAA 780
AATTAGTTTC CAGCTGCCTT TGTCAAAATT CAAATTTTAA AAATACTTCA AATTTTAACT 840
AATTTTAGGC TATTTTTTGA GCCGT 865