EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00237 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:1368120-1368566 
TF binding sites/motifs
Number: 33             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:1368453-1368463AAATTGAGAG+4.59
ceh-22MA0264.1chrI:1368351-1368361ACACTCCAGG+3.34
ces-2MA0922.1chrI:1368170-1368178TTCATAAT-3.25
ces-2MA0922.1chrI:1368169-1368177TTTCATAA+3.43
che-1MA0260.1chrI:1368285-1368290AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:1368251-1368256AAGCC+3.7
daf-12MA0538.1chrI:1368324-1368338TGCGCGAGCGCGCT+3.28
daf-12MA0538.1chrI:1368141-1368155GAACAAGCGCCTTC-3.84
dsc-1MA0919.1chrI:1368462-1368471GTAATTAGA+3.76
dsc-1MA0919.1chrI:1368462-1368471GTAATTAGA-3.76
efl-1MA0541.1chrI:1368276-1368290GTCCCCGCGAAACG+3.42
efl-1MA0541.1chrI:1368291-1368305ATTCCCGCGAATTC+3.55
efl-1MA0541.1chrI:1368290-1368304AATTCCCGCGAATT-4.99
elt-3MA0542.1chrI:1368478-1368485TTTATCA+3.23
lim-4MA0923.1chrI:1368463-1368471TAATTAGA-3.15
lim-4MA0923.1chrI:1368342-1368350TAATTATG-3
lim-4MA0923.1chrI:1368462-1368470GTAATTAG+4.08
lin-14MA0261.1chrI:1368471-1368476TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:1368350-1368355AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrI:1368204-1368216CTTCTCAACAAT-3.58
pha-4MA0546.1chrI:1368460-1368469GAGTAATTA+3.04
skn-1MA0547.1chrI:1368167-1368181AATTTCATAATTTT-3.04
skn-1MA0547.1chrI:1368478-1368492TTTATCATCATTTA-6.24
sma-4MA0925.1chrI:1368421-1368431ATGTCTGAGC+3.4
snpc-4MA0544.1chrI:1368319-1368330TGTCGTGCGCG+4.23
vab-7MA0927.1chrI:1368463-1368470TAATTAG+3.02
vab-7MA0927.1chrI:1368342-1368349TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrI:1368342-1368349TAATTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrI:1368463-1368470TAATTAG-4.31
zfh-2MA0928.1chrI:1368341-1368351ATAATTATGA-3.27
zfh-2MA0928.1chrI:1368340-1368350AATAATTATG+3.34
zfh-2MA0928.1chrI:1368462-1368472GTAATTAGAT-3.57
zfh-2MA0928.1chrI:1368461-1368471AGTAATTAGA+3.92
Enhancer Sequence
ACTACAAACT ATGGACAAAC GGAACAAGCG CCTTCAGTTT TCGGTTAAAT TTCATAATTT 60
TACACATTTT CAATTCGGAT GATGCTTCTC AACAATATTA TAAATCAAAA AATCAAAAAT 120
AATTTCCATA GAAGCCAAAA ATAGCAAAAA ACTGCTGTCC CCGCGAAACG AATTCCCGCG 180
AATTCTGGAG TTTGTGAGGT GTCGTGCGCG AGCGCGCTCT AATAATTATG AACACTCCAG 240
GAGGCCGTGT TTTGTTAAAG AAAAAAAATA GTTTTTTAAA TCGAACTAAG AACTTTCAGT 300
TATGTCTGAG CTAAATTTTG TGGAAATTCA CAAAAATTGA GAGTAATTAG ATGTTCAATT 360
TATCATCATT TACTATATAT AAAGCGCTTA TTCCGTTTGT CCATAGTTTG TAGTCTATGT 420
AGTCTTTGTA GTCTGCGAAG TTTTAG 446