EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00214 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:1250423-1251441 
TF binding sites/motifs
Number: 53             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:1250765-1250775TAAAAGAAAA+3.3
blmp-1MA0537.1chrI:1250784-1250794AAAATGAGTA+3.46
blmp-1MA0537.1chrI:1250584-1250594TCTCGATTCC-3.55
blmp-1MA0537.1chrI:1250549-1250559TTTCAATTCC-3.95
ceh-22MA0264.1chrI:1251062-1251072CTACTTAACT+3.28
ceh-22MA0264.1chrI:1250810-1250820CCACTTGATG+4.11
ceh-48MA0921.1chrI:1251390-1251398TATTGATG-3.16
ceh-48MA0921.1chrI:1251107-1251115ATCAATAT+3.21
ces-2MA0922.1chrI:1250443-1250451TGTTTAAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:1250736-1250744TGTGTCAT-3.06
ces-2MA0922.1chrI:1251023-1251031TTATATAC+3.35
ces-2MA0922.1chrI:1250916-1250924TTACTTAA+3.85
che-1MA0260.1chrI:1251075-1251080AAACG+3.06
dsc-1MA0919.1chrI:1251425-1251434ATAATTAAT+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:1251425-1251434ATAATTAAT-3.33
dsc-1MA0919.1chrI:1250912-1250921TTAATTACT+3.55
dsc-1MA0919.1chrI:1250912-1250921TTAATTACT-3.55
efl-1MA0541.1chrI:1251237-1251251AATAGCGGAAATAC+3.16
efl-1MA0541.1chrI:1250431-1250445ATTTGCCGGCCTTG-3.67
elt-3MA0542.1chrI:1250480-1250487TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:1250763-1250770GATAAAA-3
fkh-2MA0920.1chrI:1250729-1250736TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:1251100-1251107TAAACAT+3.28
fkh-2MA0920.1chrI:1250443-1250450TGTTTAA-3.48
fkh-2MA0920.1chrI:1250997-1251004TGTATAT-3
hlh-1MA0545.1chrI:1250666-1250676TCATTTGCCG-3.31
lim-4MA0923.1chrI:1251426-1251434TAATTAAT-3.12
lim-4MA0923.1chrI:1251425-1251433ATAATTAA+3.37
lim-4MA0923.1chrI:1250913-1250921TAATTACT-4.22
pal-1MA0924.1chrI:1250447-1250454TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrI:1251012-1251019TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrI:1251037-1251044TTATTTC-3.12
pal-1MA0924.1chrI:1250732-1250739TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrI:1251426-1251433TAATTAA+3.54
pal-1MA0924.1chrI:1251398-1251405TACTAAA+3
pal-1MA0924.1chrI:1250913-1250920TAATTAC-4.27
pha-4MA0546.1chrI:1250444-1250453GTTTAATTT-3.15
pha-4MA0546.1chrI:1250707-1250716AAGGAAATA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:1251105-1251114ATATCAATA+3.35
skn-1MA0547.1chrI:1251128-1251142AAATGATGGAAAAA+3.03
skn-1MA0547.1chrI:1250720-1250734ACTTGATGATTTTT+3.79
skn-1MA0547.1chrI:1250812-1250826ACTTGATGATTTTT+3.79
skn-1MA0547.1chrI:1250448-1250462AATTTCAGCAATTT-4.34
unc-62MA0918.1chrI:1250848-1250859ACTTACAGGTA-3.55
unc-62MA0918.1chrI:1251204-1251215AGATGTCAAAG+3.73
unc-86MA0926.1chrI:1250800-1250807TGCATAT-4.66
vab-7MA0927.1chrI:1250913-1250920TAATTAC-3.88
vab-7MA0927.1chrI:1251426-1251433TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:1250445-1250455TTTAATTTCA+3.02
zfh-2MA0928.1chrI:1251424-1251434TATAATTAAT+3.33
zfh-2MA0928.1chrI:1250912-1250922TTAATTACTT-3.59
zfh-2MA0928.1chrI:1250911-1250921TTTAATTACT+3.69
zfh-2MA0928.1chrI:1251425-1251435ATAATTAATC-3.99
Enhancer Sequence
ATATGCCGAT TTGCCGGCCT TGTTTAATTT CAGCAATTTG TCGATTTGCC GGAAATTTTT 60
AACACCGGCA ATTTGCCGAT TTGTCGGAAA CTGTCGATTC CGGCAATATG CCGATTTGCC 120
GGAAATTTTC AATTCCGGCG ATTTGCCGAT TTGCCGGACC TTCTCGATTC CGGCAATTTG 180
CCAGTTTGCC TGAATTTGCC AATTCCGGCA ATTTGTCGAT TTGCCGGAAA TTTTCAGTTC 240
CGGTCATTTG CCGATTCTTC TTCTGTCGAT TTGCCGATTT CTTAAAGGAA ATACGTCACT 300
TGATGATTTT TATTGTGTCA TCGGAAAGAC TTAACGAGAA GATAAAAGAA AAACTCGCTC 360
GAAAATGAGT AAAGTCATGC ATATACGCCA CTTGATGATT TTTTTAATTT TTTTTTGTTG 420
GAAATACTTA CAGGTAGATC AGAAAACTCG ATCGAGAATT AGTACACCAT TAGTTTTGAA 480
CTATAAATTT TAATTACTTA ACTCTTTAAA AAGTAACTCT GTACAATTAT AGTTTTAAGT 540
TTTTTTTTTC CATTTGTCAC ATGAGTGATG CTACTGTATA TTTTCAGTTT AATTTCCATA 600
TTATATACCG TGATTTATTT CTATTAGTAT TGCACCCGAC TACTTAACTT TGAAACGTTA 660
TATATCATGG CTTATTTTAA ACATATCAAT ATATTGTCAA CTACGAAATG ATGGAAAAAG 720
AACTAACAAA TATTTTGTTA GTTGACGATT TTTGAATAGA ACAAACGAGA ACTGAGATAT 780
AAGATGTCAA AGTTGAACAA TGGGGTGCAA TACTAATAGC GGAAATACGG TACATATATA 840
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATACTAT 900
AGTTTAGGCA ACTCGAAGTT TCTTCTCGTT TGGCAAACTG TGACGATCTA CTTATACTGA 960
CCAAAGATAT TGATGTACTA AATGGCACAT ACTGTTTTCA GTATAATTAA TCTGAAAT 1018