EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00047 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:239779-241763 
TF binding sites/motifs
Number: 122             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:241513-241523AGATCGAATA+3.02
blmp-1MA0537.1chrI:240856-240866TAAAAGAGAG+3.22
blmp-1MA0537.1chrI:240237-240247AAATCGAAAC+3.61
blmp-1MA0537.1chrI:240039-240049TTTCCTCTTT-3.76
blmp-1MA0537.1chrI:240860-240870AGAGAGATAG+3.83
blmp-1MA0537.1chrI:241610-241620AAAAAGAGAC+3.89
blmp-1MA0537.1chrI:240858-240868AAAGAGAGAT+4.16
blmp-1MA0537.1chrI:239842-239852TTTCATTTCT-4.17
blmp-1MA0537.1chrI:241446-241456TTTCTCTTTT-4.28
blmp-1MA0537.1chrI:241448-241458TCTCTTTTTT-4.78
blmp-1MA0537.1chrI:239883-239893AAAATGAAAA+5.09
ceh-22MA0264.1chrI:240606-240616ACTCTTGAAT+3.14
ceh-22MA0264.1chrI:240319-240329ACAATTGAAA+3.17
ceh-22MA0264.1chrI:240511-240521ATACTCGAAA+3.22
ceh-48MA0921.1chrI:240662-240670GTCAATAA+3.56
ceh-48MA0921.1chrI:241366-241374TATTGGTT-3.69
ces-2MA0922.1chrI:239859-239867TGTCTAAT-3.08
ces-2MA0922.1chrI:240115-240123TAACTTAA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:241044-241052TGTGTAAT-3.15
ces-2MA0922.1chrI:240303-240311TCTATAAT-3.25
ces-2MA0922.1chrI:240307-240315TAATATAA+4.08
che-1MA0260.1chrI:239975-239980GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:239997-240002AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:240243-240248AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:240903-240908AAGCC+3.7
daf-12MA0538.1chrI:240993-241007TGCGTGCATGTTCT+3.3
dpy-27MA0540.1chrI:240429-240444TTTCCTTTGCAAAGG+4.73
dsc-1MA0919.1chrI:240286-240295GTAATTACG+3.44
dsc-1MA0919.1chrI:240286-240295GTAATTACG-3.44
dsc-1MA0919.1chrI:240012-240021CCAATTAAA+3
dsc-1MA0919.1chrI:240012-240021CCAATTAAA-3
dsc-1MA0919.1chrI:241344-241353CTAATTAAA+4.07
dsc-1MA0919.1chrI:241344-241353CTAATTAAA-4.07
efl-1MA0541.1chrI:239975-239989GTTTCGCGCCTCAC-3.73
elt-3MA0542.1chrI:241315-241322GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:241027-241034TTAATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:241206-241213CTTATGA+3.27
elt-3MA0542.1chrI:240230-240237CTTACCA+3.35
elt-3MA0542.1chrI:240051-240058GATAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:240638-240645TTTATCT+3
elt-3MA0542.1chrI:240919-240926GATAAAA-4.31
eor-1MA0543.1chrI:241607-241621GAAAAAAAGAGACT+3.48
eor-1MA0543.1chrI:240459-240473ATTTGTGTCTCTAT-3.63
eor-1MA0543.1chrI:241449-241463CTCTTTTTTTTCTC-3.75
eor-1MA0543.1chrI:241605-241619CAGAAAAAAAGAGA+4.36
eor-1MA0543.1chrI:241447-241461TTCTCTTTTTTTTC-4
fkh-2MA0920.1chrI:241437-241444AAAACAC+3.08
fkh-2MA0920.1chrI:240197-240204AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:239779-239786TATACAT+3.12
fkh-2MA0920.1chrI:240031-240038TATACAT+3.12
fkh-2MA0920.1chrI:240102-240109TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrI:241546-241553AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:241259-241266TATACAT+3.24
fkh-2MA0920.1chrI:239789-239796TGTATAC-3.24
fkh-2MA0920.1chrI:241349-241356TAAACAT+3.28
fkh-2MA0920.1chrI:241194-241201TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:240910-240917TGTTGAT-3.43
fkh-2MA0920.1chrI:240268-240275TTTTTAC-3.4
hlh-1MA0545.1chrI:240363-240373ACAGATGGTG-3.27
hlh-1MA0545.1chrI:240362-240372GACAGATGGT+3.67
lim-4MA0923.1chrI:240287-240295TAATTACG-3.22
lim-4MA0923.1chrI:241467-241475CCAATCAA+3.26
lim-4MA0923.1chrI:240286-240294GTAATTAC+3.33
lim-4MA0923.1chrI:241345-241353TAATTAAA-3.48
lim-4MA0923.1chrI:240012-240020CCAATTAA+3.74
lim-4MA0923.1chrI:241344-241352CTAATTAA+4.52
lin-14MA0261.1chrI:240793-240798AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:241001-241006TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:241333-241338TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:241659-241664TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:239918-239923AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:240371-240376TGTTC-3.62
lin-14MA0261.1chrI:240947-240952TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:240502-240514ATTCCCAACATA-3.6
mab-3MA0262.1chrI:241658-241670ATGTTCCAGATT+3.74
mab-3MA0262.1chrI:241108-241120ATGTTGTGATTA+3.91
pal-1MA0924.1chrI:240918-240925TGATAAA+3.1
pal-1MA0924.1chrI:241197-241204TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrI:240667-240674TAATAAC+3.36
pal-1MA0924.1chrI:241146-241153CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrI:240287-240294TAATTAC+3.85
pal-1MA0924.1chrI:240287-240294TAATTAC-3.85
pal-1MA0924.1chrI:240149-240156TAATACA+3
pal-1MA0924.1chrI:241681-241688TAACAAA+3
pha-4MA0546.1chrI:239811-239820AAGTAAATT+3.02
pha-4MA0546.1chrI:241346-241355AATTAAACA+3.03
pha-4MA0546.1chrI:241057-241066GAGCAAAAA+3.12
pha-4MA0546.1chrI:239840-239849ATTTTCATT-3.1
pha-4MA0546.1chrI:240644-240653TGGTAAATA+3.31
pha-4MA0546.1chrI:241367-241376ATTGGTTCA-3.47
pha-4MA0546.1chrI:240198-240207AAACAAACA+3.85
skn-1MA0547.1chrI:240187-240201TATTGAAGAAAAAA+3.78
skn-1MA0547.1chrI:239827-239841TTCGTCAACTTTTA-3.81
skn-1MA0547.1chrI:240209-240223ATATGATGAATTCT+3.89
sma-4MA0925.1chrI:241039-241049GTTTCTGTGT+3.08
sma-4MA0925.1chrI:240572-240582TCTAGAAATA-3.12
sma-4MA0925.1chrI:240569-240579TTTTCTAGAA+3.14
sma-4MA0925.1chrI:240586-240596TCTAGACCGA-3
unc-62MA0918.1chrI:240827-240838AGAGACAGCGT-3.27
unc-62MA0918.1chrI:240483-240494ATCTGTCATGC+3.65
unc-62MA0918.1chrI:240019-240030AATTACAGGTG-3.86
unc-62MA0918.1chrI:241285-241296TCCTGTAACTT+3
unc-86MA0926.1chrI:239787-239794TATGTAT+3.06
unc-86MA0926.1chrI:239781-239788TACATAT-3.06
unc-86MA0926.1chrI:239779-239786TATACAT+3.07
unc-86MA0926.1chrI:240031-240038TATACAT+3.07
unc-86MA0926.1chrI:240970-240977AATGCAT+3.11
unc-86MA0926.1chrI:240852-240859TTCATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrI:240972-240979TGCATAT-4.66
vab-7MA0927.1chrI:240978-240985TCATTAC+3.09
vab-7MA0927.1chrI:240287-240294TAATTAC+3.54
vab-7MA0927.1chrI:240287-240294TAATTAC-3.54
vab-7MA0927.1chrI:240013-240020CAATTAA+3.7
vab-7MA0927.1chrI:241345-241352TAATTAA+4.57
zfh-2MA0928.1chrI:239908-239918AAAATTAGTG-3.01
zfh-2MA0928.1chrI:239895-239905TTTAATTCAC+3.07
zfh-2MA0928.1chrI:239873-239883CGAATTATTG-3.1
zfh-2MA0928.1chrI:240286-240296GTAATTACGG-3.36
zfh-2MA0928.1chrI:240285-240295GGTAATTACG+3.42
zfh-2MA0928.1chrI:240012-240022CCAATTAAAT-3.42
zfh-2MA0928.1chrI:241343-241353ACTAATTAAA+3.8
zfh-2MA0928.1chrI:241344-241354CTAATTAAAC-4.58
Enhancer Sequence
TATACATATA TGTATACTAG GAATTCGCAC TAAAGTAAAT TATTGAAATT CGTCAACTTT 60
TATTTTCATT TCTTATATTT TGTCTAATTT TCAACGAATT ATTGAAAATG AAAATTTTTA 120
ATTCACGTCA AAATTAGTGA ACGCGGTGAA CGGCGACGGC GAAGGCGGGC CGGCGTGAGG 180
CCGGCGTGAG GCCCGCGTTT CGCGCCTCAC TTAGCTGGAA ACCCTAAGTT TCTCCAATTA 240
AATTACAGGT GATATACATT TTTCCTCTTT AGGATAAGAA AAGATCATTT CCTAAGCCTG 300
ACAATACAAA AATGTGGTTC ACGTTTTTAT TTTTCATAAC TTAAAAAAAT ACTATTAAAA 360
TGAGGGCATG TAATACACAA ATACCGGCAA ACGGTGTTTC AAATCAAATA TTGAAGAAAA 420
AACAAACAAA ATATGATGAA TTCTCTTTGT TCTTACCAAA ATCGAAACCA TCATTTAAAA 480
TTTAGCAATT TTTTACAGTT ATATTTGGTA ATTACGGCCC ATTTTCTATA ATATAAAGAA 540
ACAATTGAAA CTGATCCACC CTGTCCGCCG ACTATTGGGC ATCGACAGAT GGTGTTCTCA 600
AAATACCAAA AATGGGTGGA ACTCTCTCAC GAGCGCTCTG CAGGTGTCGT TTTCCTTTGC 660
AAAGGACTGC CCTTCCATTC ATTTGTGTCT CTATACAACA TCTCATCTGT CATGCAAACC 720
GACATTCCCA ACATACTCGA AATCCCAATT GATGTAAGTT CTTGTTTCTT AAACTAAAAT 780
TAGCCAACTA TTTTCTAGAA ATATCAATCT AGACCGAAAT ACCTTTTACT CTTGAATGAT 840
ATCAAAAGTT TAAAAATGTT TTATCTGGTA AATATATTAT TCAGTCAATA ATAACAGAGC 900
AATAATTTCC TATTTGTAAG ACGGTTTGCC AGCCCTACTG ATGTAAGCTA AAGGTCCTAC 960
AAAAAATCCC TGAATTTTGG GTCTCCTTTG CTAACTACAA ATGGTAGGCA AAAGAACATA 1020
TTTGTGTACA AAAAAGTATG CAAGCAAAAG AGACAGCGTA GGCAGGCAAA AGATTCATAA 1080
AAGAGAGATA GCCCCCGCGG TCAAATCATT CTACTAGTGG CTTGAAGCCT CTGTTGATGT 1140
GATAAAAGTA ACATTTTATA TAGCATTGTG TTCGATTTTT CTAACAAATA AAATGCATAT 1200
CATTACTTAT ACAGTGCGTG CATGTTCTTT ATGCCACCCC CAAAGTTTTT AATCATGGCA 1260
GTTTCTGTGT AATTTGGTGA GCAAAAAGTA TTGAAAACCT ATTCACAATG AAAAACCTAA 1320
ACTCAAGAAA TGTTGTGATT ATATCTCGAA AATTGTGAAA AATAAGACAA TAAATCAAAA 1380
ATTGGCCGTG CAACTTCTAT ATGCCACCTC GGATTTTTTT ATGATTTCTT ATGATTTTAG 1440
ACTATTAACT TATTATTCAA ATAAAATTCG ATTCAATTCG TATACATTTC AGTGCTAAAT 1500
AACTATTCCT GTAACTTCTC CCAAAGACGA TACGATGATC AAAATATGGG GATATGTTCT 1560
AGATACTAAT TAAACATAGT ATGTGAATAT TGGTTCACAT TGGTGGATTT TTAGCGTCGC 1620
CAGAGGGACA TATTTGGTGT CCCCAGCCGT TTTTGGTGAA AACACTATTT CTCTTTTTTT 1680
TCTCGGTGCC AATCAAGTTG AGAAATTTCA GGCATGCTCT CGAACCTTCA GGAAAGATCG 1740
AATACTGCAG AAAACCTGTA GACTAGGAAA ACAACTTGGA AGTTTCTTAA AAGTTTGGAA 1800
TTTTACTAGA ATTTTCTGAA AAATTTCAGA AAAAAAGAGA CTTTCAAGAA ACTTCTGAAA 1860
ACTTCGAGAA AGTTCTGGAA TGTTCCAGAT TTTTCTAAAA AGTAACAAAT TCCGTTCAGA 1920
ACAATGTTTT GAATATATGC CAGAATCTTA CTCAAGTAAA ATAATTTTTT TTAAATTCTG 1980
ATAC 1984