EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00043 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:229447-230401 
TF binding sites/motifs
Number: 58             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:230081-230091ATTCTTCTTT-3.07
blmp-1MA0537.1chrI:229681-229691AATCATTTTC-3.12
blmp-1MA0537.1chrI:230188-230198AGAAAGATGG+3.18
blmp-1MA0537.1chrI:229995-230005AAGTGGAGAA+3.52
blmp-1MA0537.1chrI:230184-230194GGAAAGAAAG+3.64
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:229811-229824TTGGCTTCGACCA+3.58
ceh-22MA0264.1chrI:229992-230002ATGAAGTGGA-3.72
ceh-22MA0264.1chrI:229954-229964CTTAAGTGCG-3.7
ceh-48MA0921.1chrI:229826-229834TATTGAGT-3.03
ceh-48MA0921.1chrI:230123-230131AATTGGTT-3.09
ceh-48MA0921.1chrI:230117-230125ATCAATAA+4.21
ceh-48MA0921.1chrI:229894-229902ATCGATAT+4.57
ces-2MA0922.1chrI:230157-230165TTAAGTAA+3.64
ces-2MA0922.1chrI:230356-230364TACCTAAT-3.73
che-1MA0260.1chrI:229611-229616GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:229814-229819GCTTC-3.7
dsc-1MA0919.1chrI:230121-230130ATAATTGGT+3.09
dsc-1MA0919.1chrI:230121-230130ATAATTGGT-3.09
dsc-1MA0919.1chrI:229577-229586TTAATTATC+3.39
dsc-1MA0919.1chrI:229577-229586TTAATTATC-3.39
dsc-1MA0919.1chrI:230376-230385TTAATTATT+3.62
dsc-1MA0919.1chrI:230376-230385TTAATTATT-3.62
elt-3MA0542.1chrI:230172-230179AATAAGA-3.25
elt-3MA0542.1chrI:230219-230226GATAAGA-4.66
eor-1MA0543.1chrI:230132-230146AGAAGAAAGACAAA+3.22
eor-1MA0543.1chrI:230134-230148AAGAAAGACAAAAT+3.28
fkh-2MA0920.1chrI:229616-229623TGTTTAA-3.16
hlh-1MA0545.1chrI:229450-229460GCAGTTGTCT-3.4
hlh-1MA0545.1chrI:229449-229459CGCAGTTGTC+3.89
lim-4MA0923.1chrI:230376-230384TTAATTAT+3.12
lim-4MA0923.1chrI:230122-230130TAATTGGT-3.25
lim-4MA0923.1chrI:230377-230385TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrI:229578-229586TAATTATC-3.71
lim-4MA0923.1chrI:229577-229585TTAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrI:229781-229786AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrI:230352-230364ATGTTACCTAAT+3.93
pal-1MA0924.1chrI:230320-230327TAATGAC-3.38
pal-1MA0924.1chrI:230304-230311CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrI:229578-229585TAATTAT-3.54
pal-1MA0924.1chrI:230377-230384TAATTAT-3.54
pal-1MA0924.1chrI:229804-229811CAATGAA+3
pha-4MA0546.1chrI:230115-230124AAATCAATA+3.55
skn-1MA0547.1chrI:229580-229594ATTATCATGTCTTT-4.02
sma-4MA0925.1chrI:229669-229679ACCAGAAATA-3.32
sma-4MA0925.1chrI:229498-229508CCGTCTGGGT+3.41
sma-4MA0925.1chrI:229690-229700CTGTCTGGCC+4.95
unc-62MA0918.1chrI:229452-229463AGTTGTCTTCA+3.14
unc-86MA0926.1chrI:229556-229563TGCATAT-3.11
unc-86MA0926.1chrI:230374-230381TATTAAT+3.32
vab-7MA0927.1chrI:230122-230129TAATTGG-3.03
vab-7MA0927.1chrI:230320-230327TAATGAC-3.04
vab-7MA0927.1chrI:229578-229585TAATTAT-4.09
vab-7MA0927.1chrI:230377-230384TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:230120-230130AATAATTGGT+3.1
zfh-2MA0928.1chrI:229577-229587TTAATTATCA-3.45
zfh-2MA0928.1chrI:230376-230386TTAATTATTC-3.5
zfh-2MA0928.1chrI:229576-229586TTTAATTATC+3.65
zfh-2MA0928.1chrI:230375-230385ATTAATTATT+3.87
Enhancer Sequence
CGCGCAGTTG TCTTCAAGAT GTTTTTTGAG GCTTACGATT GGATCGTCAG CCCGTCTGGG 60
TCGTATAAAG TTACGCGGAG TCAGCTCGGT ATAGTCAGCT TGATAGTCTT GCATATAGTC 120
TTTGAGATCT TTAATTATCA TGTCTTTGGA TTTAATCGTT GAAGGTTTCT GTTTAACAGT 180
TTCCAACAAG TCTTTAATCG TCGATAGTCT ATGTCTCAAG TCACCAGAAA TAACAATCAT 240
TTTCTGTCTG GCCAGATTAG TCGTGGATCG TATGATATCT GTTAAATTCA AAATTGGCGT 300
ACCTGTATCC TTTGCCTTCT CGGCGACGTC CTTGAACATC TCCTCGATGA TATCCGGCAA 360
TGAATTGGCT TCGACCAAGT ATTGAGTCAG GTCTTTGTAC CATTTGTGAA GATCCTTGAT 420
GTAGTCCATA TGCTGCTGCT TGTCACAATC GATATTGGCG TTAAGCCAGT CGGATGAAGA 480
CTTATCTTTG TGCTTCAAGT CTTCAGTCTT AAGTGCGATA CGCGTCAGCA ACAATGCTAT 540
GGATGATGAA GTGGAGAATG GGGTCCTGGA TTCCCTTCCC AAGCTGCCAC CACCGGAGTC 600
GGGATCAAGA CTTCCACCTC CAAGATGAAA AGTCATTCTT CTTTGAAAAC CGAGAAACTT 660
GTTATCTAAA ATCAATAATT GGTTAAGAAG AAAGACAAAA TGTTTTGAGA TTAAGTAAAA 720
GACTTAATAA GAGATTAGGA AAGAAAGATG GGGATGAAGA CTCAATTTGA GTGATAAGAA 780
AAAAAGGTAT TTTAATATAA GATTCTACAA TAGGGATTGG GAAAGGTGTG CCGTGGCCTA 840
ATATAGGTTT GGTGGTACAA TAAATAGGGG AAGTAATGAC CCAATATGGG TGGGGGGATT 900
ATTAAATGTT ACCTAATATG GGTGAATTAT TAATTATTCC TTTGGCAGAG GAAT 954