EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00038 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:213682-214818 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:214343-214353TTTCGTTTTT-3.7
blmp-1MA0537.1chrI:214369-214379TTTCAATTTT-3.85
blmp-1MA0537.1chrI:214332-214342AAATCGAAAA+4.3
blmp-1MA0537.1chrI:214590-214600AAAGTGAAAC+4.43
ceh-22MA0264.1chrI:214473-214483TTTAAGTAGT-3.44
ceh-48MA0921.1chrI:214745-214753TATCGAAG-3.01
ceh-48MA0921.1chrI:214757-214765ATCAATTT+3.03
ceh-48MA0921.1chrI:214522-214530AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrI:214351-214359TTCGATAT+3.07
ceh-48MA0921.1chrI:213820-213828TATTGGAT-3.12
ceh-48MA0921.1chrI:214599-214607CATCGATT-3.19
ceh-48MA0921.1chrI:213950-213958TATCGATG-3.41
ceh-48MA0921.1chrI:213767-213775TATCGATG-3.86
ceh-48MA0921.1chrI:214201-214209TATTGATT-4.21
daf-12MA0538.1chrI:213690-213704AAACAAGAACGCTC-3.33
dsc-1MA0919.1chrI:214400-214409TTAATTATT+3.48
dsc-1MA0919.1chrI:214400-214409TTAATTATT-3.48
efl-1MA0541.1chrI:214714-214728TTCGGCGGAAAAAT+4.13
efl-1MA0541.1chrI:214120-214134CATTGCCGCCAGGT-4.31
elt-3MA0542.1chrI:214098-214105TTGATCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:214675-214682TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:214694-214701GATGAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:214435-214442TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrI:214571-214585TAGAAAAAAACAGA+3.28
eor-1MA0543.1chrI:214573-214587GAAAAAAACAGAAG+3.69
lim-4MA0923.1chrI:213864-213872GCAATTAC+3.01
lim-4MA0923.1chrI:214400-214408TTAATTAT+3.15
lim-4MA0923.1chrI:214401-214409TAATTATT-3.57
lin-14MA0261.1chrI:213697-213702AACGC+3.36
mab-3MA0262.1chrI:214503-214515TTGCTGCGGAAT+3.73
mab-3MA0262.1chrI:214725-214737AATCGCAAAATT-4.24
mab-3MA0262.1chrI:213892-213904GAATGCAACAAT-4.8
pal-1MA0924.1chrI:214189-214196AAATTAA+3.07
pal-1MA0924.1chrI:214401-214408TAATTAT-3.54
pal-1MA0924.1chrI:213865-213872CAATTAC+3.59
pal-1MA0924.1chrI:214624-214631CAATGAA+3
pal-1MA0924.1chrI:214500-214507TCATTGC-3
pal-1MA0924.1chrI:214208-214215TTATTAC-4.57
pha-4MA0546.1chrI:213686-213695GTGCAAACA+3.23
pha-4MA0546.1chrI:214202-214211ATTGATTTA-3.48
skn-1MA0547.1chrI:213809-213823ATTTGATGACGTAT+4.1
unc-62MA0918.1chrI:213850-213861GAAGACAGCCG-3.19
vab-7MA0927.1chrI:214401-214408TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:214196-214206CAAATTATTG-3.06
zfh-2MA0928.1chrI:214269-214279ATTAATTTTT+3.13
zfh-2MA0928.1chrI:214188-214198GAAATTAACA-3.1
zfh-2MA0928.1chrI:214400-214410TTAATTATTT-3.59
zfh-2MA0928.1chrI:214399-214409CTTAATTATT+3.95
Enhancer Sequence
GGCGGTGCAA ACAAGAACGC TCCCTCGATG ACGTGCGACG CATACTTGTC CTGTGACATT 60
GAGAGCAAGT TACGGAGCAG GCATTTATCG ATGATAGTGT CTCTGTACAT TTCCATGATA 120
CCCGACGATT TGATGACGTA TTGGATGACG TAGTTGGCGA ACTCGTTGGA AGACAGCCGG 180
TAGCAATTAC GGACGATACA CGTCATCAGA GAATGCAACA ATTGAATACG GAATTTGAAA 240
CACGGGAGCT TGGGATTCTC GGCGAGTCTA TCGATGACCT GTTGCACGAG ACGACATCCA 300
TACTTGTCCT GGCACACGGC CATCAGTGAA TCTCCTGACG AGAGGAAATG CACGAAAAAG 360
GTCCACATGT CGACTGGAAG TTGCTTGACG ACACGTTGAA TCACGTGGAT CGAGATTTGA 420
TCATCCAAGA GCTCAGCACA TTGCCGCCAG GTCGAATGTG CTGAGCTCTT GGATGAGCTG 480
GAAGACGTTG GAATGGTCGA ATTTCTGAAA TTAACAAATT ATTGATTTAT TACACCTGGA 540
AAGGCCTAAA AAGACCAAAA ATAGCCCTAA AAATTTCGAA GAAATGGATT AATTTTTAGC 600
TAAAACGTAA TTTTTTGCCA ACTTTTCTGT GTCGCGATTT TTTTAAACCA AAATCGAAAA 660
ATTTCGTTTT TCGATATTTT GAACAAATTT CAATTTTTTC GGGAGAATAT CTTAAAACTT 720
AATTATTTTC CTCTAGGAGC CATTTTGTAT GTTTTTTTCA TCGACAAAAA ATTTTCGTTA 780
ATGTGTGCAC CTTTAAGTAG TACTGTAACT TTAAACTTTC ATTGCTGCGG AATTTTTTAA 840
AATTGATTTT CAATGTTTTT CTACAGTTGT CGTCCAATTT CATGCAATTT AGAAAAAAAC 900
AGAAGGAAAA AGTGAAACAT CGATTTTAAA AAAATTCCGG AGCAATGAAA GTTCGGAGTT 960
ACAGTACTCT TTGAAGGCGC ACACCTTTTT TGTTTTAACA AAAATTTGTC GTGATGAGAC 1020
TGGGGACAGT TTTTCGGCGG AAAAATCGCA AAATTTCGGC TAATATCGAA GAAAAATCAA 1080
TTTCCGACCG CTGCGACACT TTAGCAAAAA ATTGTGATTT TAGCCAAAAT TCAGTT 1136