EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00035 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:176220-176958 
TF binding sites/motifs
Number: 40             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:176942-176952CTTCGTTCTC-3.42
blmp-1MA0537.1chrI:176522-176532ATTCTTTTTT-3.53
blmp-1MA0537.1chrI:176576-176586TTTCAATTTC-3.83
blmp-1MA0537.1chrI:176272-176282TTTCCCCTTT-4.05
blmp-1MA0537.1chrI:176399-176409TTTCATTTTT-5.14
ceh-22MA0264.1chrI:176483-176493ACACTTAAAA+3.74
ceh-22MA0264.1chrI:176861-176871GCACTTGATA+3.8
ces-2MA0922.1chrI:176670-176678GTACACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:176708-176716TGCCTAAT-3.14
ces-2MA0922.1chrI:176333-176341TTACATAA+3.64
ces-2MA0922.1chrI:176334-176342TACATAAT-4.68
che-1MA0260.1chrI:176304-176309AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:176813-176818AAACC+3.36
dsc-1MA0919.1chrI:176711-176720CTAATTTGT+3.19
dsc-1MA0919.1chrI:176711-176720CTAATTTGT-3.19
efl-1MA0541.1chrI:176443-176457ATTTGCCGGAAGTG-3.24
efl-1MA0541.1chrI:176353-176367GTGGGCGGCAATTG+4.48
fkh-2MA0920.1chrI:176517-176524TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:176773-176780TGTTTTC-3.08
fkh-2MA0920.1chrI:176330-176337TTTTTAC-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:176469-176476TTTTTAC-3.09
hlh-1MA0545.1chrI:176838-176848ACAGGTGTCA-3.22
hlh-1MA0545.1chrI:176359-176369GGCAATTGCC+3.57
hlh-1MA0545.1chrI:176360-176370GCAATTGCCG-3.57
hlh-1MA0545.1chrI:176900-176910ACATGTGTTC-3.67
hlh-1MA0545.1chrI:176837-176847AACAGGTGTC+4.21
lim-4MA0923.1chrI:176752-176760GTAATCAA+3.27
lin-14MA0261.1chrI:176377-176382AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:176905-176910TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:176704-176716AGGTTGCCTAAT+3.96
pal-1MA0924.1chrI:176753-176760TAATCAA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:176718-176727GTTTGAACT-3.05
pha-4MA0546.1chrI:176331-176340TTTTACATA-3.08
sma-4MA0925.1chrI:176320-176330GCCAGAAAGC-3.64
unc-62MA0918.1chrI:176840-176851AGGTGTCACAT+3.29
unc-62MA0918.1chrI:176896-176907AGAGACATGTG-3.55
unc-86MA0926.1chrI:176641-176648TGCATAC-4.4
vab-7MA0927.1chrI:176925-176932CAATGAG-3.09
zfh-2MA0928.1chrI:176512-176522TTTAATTTTT+3.01
zfh-2MA0928.1chrI:176710-176720CCTAATTTGT+3.28
Enhancer Sequence
TTCAAACAAA GGAAAAAGTC GGAAGCTTTC CATACATTCA ACTCTATTAT ACTTTCCCCT 60
TTCCATGGAT GTGCTTTTTG TGTGAAACCA AAACTTAACC GCCAGAAAGC TTTTTACATA 120
ATCTATAACA GAGGTGGGCG GCAATTGCCG TTCGGCGAAC ATTCTGATTT TTTGGAAATT 180
TTCATTTTTG GCAAATTGCC GATCTGCCGT TTGCCGGATA TCAATTTGCC GGAAGTGTTT 240
AGAGGGTTCT TTTTACGACG GAAACACTTA AAACTGTGCC TTTTTGAAAA TATTTAATTT 300
TTATTCTTTT TTTCGGCAAA TTTGCCGGTT TGCCCAATTT GGCAATTCGC CGGAAATTTC 360
AATTTCGGCA GTCTGCCAAT TTGCCAATTT TCAGAAAAAA AATTTCGACG CCCATCCCTG 420
ATGCATACCG TTTTTGACTC AATTTAAATA GTACACAACC TTCCACATTA ATGTAGTAAC 480
GGTAAGGTTG CCTAATTTGT TTGAACTTTG AAAGCCGCGC ACAGCACCTA CAGTAATCAA 540
TCTCCTTAAA GAGTGTTTTC GCAATACCAA ACATAGGAGT TTGTAGAAAC ATGAAACCGA 600
AGGACAACAC ATTTTGAAAC AGGTGTCACA TTTATGTATC TGCACTTGAT AGCTATGCAG 660
TCAATGAAGC ATAACGAGAG ACATGTGTTC ATTCCCGAAT GGAGTCAATG AGTCATAAGG 720
TTCTTCGTTC TCATTTTA 738