EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00033 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:166899-168304 
TF binding sites/motifs
Number: 65             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:166981-166991GGAGGGAGGG+3.21
blmp-1MA0537.1chrI:167804-167814AAATCGAAAT+3.57
blmp-1MA0537.1chrI:166973-166983GAAGTGAGGG+3.69
blmp-1MA0537.1chrI:166902-166912AAATTGAAAT+3.85
blmp-1MA0537.1chrI:167769-167779TCTCAATTTT-4.6
blmp-1MA0537.1chrI:168292-168302AAAAGGAAAA+4.7
blmp-1MA0537.1chrI:167932-167942AAAATGAGAA+4.88
blmp-1MA0537.1chrI:168102-168112AAAAAGAAAA+4.91
ceh-22MA0264.1chrI:167520-167530TTCAAGTGGT-6.25
ces-2MA0922.1chrI:167923-167931TAAGGTAA+3.08
che-1MA0260.1chrI:168200-168205GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:167013-167018GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:167019-167024GTTTC-3.36
efl-1MA0541.1chrI:168012-168026GGGGACGGCAAAAG+3.52
efl-1MA0541.1chrI:167563-167577ATTTGGCGTCTGGA-3.62
elt-3MA0542.1chrI:167767-167774TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:167937-167944GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:168087-168094GATAATA-3.81
elt-3MA0542.1chrI:167777-167784TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrI:167768-167782TTCTCAATTTTTTT-3.16
eor-1MA0543.1chrI:167821-167835TAGAACTGCAGAGA+3.23
eor-1MA0543.1chrI:168290-168304AAAAAAGGAAAAAA+3.23
eor-1MA0543.1chrI:168289-168303AAAAAAAGGAAAAA+3.36
eor-1MA0543.1chrI:167929-167943AAAAAAATGAGAAA+3.3
eor-1MA0543.1chrI:167090-167104TAGAGAATTAGGGA+3.51
eor-1MA0543.1chrI:168099-168113AAGAAAAAGAAAAA+3.57
eor-1MA0543.1chrI:168097-168111ATAAGAAAAAGAAA+3.69
eor-1MA0543.1chrI:168103-168117AAAAGAAAAAGGCA+3.96
eor-1MA0543.1chrI:167074-167088GAGAGTGTAAGAGA+4.12
eor-1MA0543.1chrI:166925-166939ACGTGAAGCAGAGA+4.32
eor-1MA0543.1chrI:166974-166988AAGTGAGGGAGGGA+4.53
eor-1MA0543.1chrI:167082-167096AAGAGAATTAGAGA+4.63
fkh-2MA0920.1chrI:167726-167733TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:167836-167843AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:166945-166952AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:167928-167935TAAAAAA+3.4
hlh-1MA0545.1chrI:167987-167997GGCAGGTGTT+3.21
hlh-1MA0545.1chrI:167988-167998GCAGGTGTTT-4.05
lim-4MA0923.1chrI:167388-167396TGATTGCC-3.16
lim-4MA0923.1chrI:167790-167798TGATTAGT-3.38
lin-14MA0261.1chrI:168185-168190AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:167422-167427TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:167951-167956AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrI:167339-167346AAATTAA+3.07
pal-1MA0924.1chrI:167723-167730AAATAAA+3.12
pal-1MA0924.1chrI:167388-167395TGATTGC-3
pha-4MA0546.1chrI:167765-167774ATTTTCTCA-3.06
pha-4MA0546.1chrI:167441-167450ATTTACTTG-3.99
skn-1MA0547.1chrI:167777-167791TTTTTCAGGTTTTT-3.83
skn-1MA0547.1chrI:168080-168094TTTTGATGATAATA+4.32
sma-4MA0925.1chrI:167738-167748GGGTCTAGAT+3.11
sma-4MA0925.1chrI:167254-167264CCTAGAAATG-3.13
sma-4MA0925.1chrI:167532-167542CCTAGAAATT-3.18
sma-4MA0925.1chrI:167591-167601CCTAGAAATT-3.18
sma-4MA0925.1chrI:167314-167324CCTAGAAATG-3.31
sma-4MA0925.1chrI:167158-167168CCTAGAAATT-3.37
sma-4MA0925.1chrI:167294-167304CCTAGAAATT-3.37
sma-4MA0925.1chrI:167334-167344CCTAGAAATT-3.37
sma-4MA0925.1chrI:167568-167578GCGTCTGGAA+3.55
sma-4MA0925.1chrI:167214-167224TCCAGAAAAT-3.86
sma-4MA0925.1chrI:167374-167384CCCAGAAATT-3.93
unc-62MA0918.1chrI:166955-166966CACTGTCACAA+3.19
vab-7MA0927.1chrI:167790-167797TGATTAG-3.13
vab-7MA0927.1chrI:167056-167063TCATTAT-3
zfh-2MA0928.1chrI:167338-167348GAAATTAACC-3.15
Enhancer Sequence
AAAAAATTGA AATTCAAAAC ACAAGCACGT GAAGCAGAGA ATGCAGAAAA CAAGACCACT 60
GTCACAAAAT TGTAGAAGTG AGGGAGGGAG GGCTATTGCA GAGGTGACCA ACGGGTTTCG 120
GTTTCCAATT TTTCGGACAC GGCGCAGAGG ATTTGAGTCA TTATTATTGT GTTTAGAGAG 180
TGTAAGAGAA TTAGAGAATT AGGGATAGAT GGGAAACTGT ACGTACTTCT GCGAAATGGT 240
GCACTTTTAG GATCGGCGGC CTAGAAATTT ACATGGTGCT CTAGAAGTCT AATAGATAGC 300
CTAGATCTTT TTAAGTCCAG AAAATTACTT GGTGGTCTAG AAGTTTTTTT TGTGACCTAG 360
AAATGCAGTT GGTGGACTAT AAATTCACTT GGTGGCCTAG AAATTCATTT GGTAGCCTAG 420
AAATGTACTT GGTGGCCTAG AAATTAACCT TGAAGCTTAG AAGTTTGTTT GAAAGCCCAG 480
AAATTCACTT GATTGCCTAT GAATTCACTT GGTGGTCGAG AAATGTTCGT GAAAGCCCAG 540
ATATTTACTT GGTGGTCTAA AACATTTTTC AGTTCAGAAA TACATTGGAA AAAATTTCGA 600
TTGAGAATTA TGGCGTGGGA TTTCAAGTGG TGACCTAGAA ATTTGTCAAG GGACTGAGGA 660
ATTCATTTGG CGTCTGGAAA TTTTTTTGGT GACCTAGAAA TTTATTTGGT GACCTGAAAA 720
TTCATTTCAT GACCAGTGAA TTTACTTGGT GGTCTAAAAA GTCTCATGGT GCCGGTCTTA 780
AAGTCTCATG TGTTGCAAAA ATTATACTAC AATATTTAAC TTTGAAATAA AAATTCAGCG 840
GGTCTAGATT TGCAAGAAAA ATCTGTATTT TCTCAATTTT TTTCAGGTTT TTGATTAGTT 900
AAAAAAAATC GAAATGATTG TTTAGAACTG CAGAGAAAAA ACAATTTTGT ATCTCCGGAA 960
TGCGCTATTC TGGGGAGTCA GATTTACTGG ATTTTACTTT TTTTCCTGCA ATTCCAATGC 1020
AAAATAAGGT AAAAAAATGA GAAAACTGGC GGAACACGGC GGTACACACA GGGGCAACTT 1080
GAATGTAAGG CAGGTGTTTA GTAAGTGGAC CGAGGGGACG GCAAAAGCTG GTATTTTTCC 1140
TGTGTCGATG GGGGACAGTA GTAGCACACA AGAAACAAGT ATTTTGATGA TAATACGAAT 1200
AAGAAAAAGA AAAAGGCAGC AAAAAAGTGT GTGGCAGACC ACCACCGTCC ATCGGATTAG 1260
GGAGCGGAGG CAAACTCGCT CTACCGAACA GAGGGGTGTC CGTTTCCCCC AAAATCCTCT 1320
GAATGTGACG TCATTGTTGG GGCGGCGGGG CGGCGTCCAA AAATTAGTGA TTTTTTTTTT 1380
GGTATTTTGG AAAAAAAGGA AAAAA 1405