EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00029 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:130173-130939 
TF binding sites/motifs
Number: 66             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:130862-130872CCTCCTTCCT-3.09
blmp-1MA0537.1chrI:130338-130348CTTCTTCTTC-3.39
blmp-1MA0537.1chrI:130859-130869TTTCCTCCTT-3.42
ceh-22MA0264.1chrI:130683-130693GTACTTCAAA+3.82
ceh-48MA0921.1chrI:130316-130324ACCGATTA+3.31
ces-2MA0922.1chrI:130768-130776TTATGTAA+3.39
ces-2MA0922.1chrI:130769-130777TATGTAAT-4.87
che-1MA0260.1chrI:130211-130216GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:130729-130734GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrI:130502-130516ACACACGCACCAAC-3.12
daf-12MA0538.1chrI:130506-130520ACGCACCAACTCTT-3.17
daf-12MA0538.1chrI:130494-130508GTCCACATACACAC-3.22
daf-12MA0538.1chrI:130818-130832TGTGTGTGTGGCGA+3.42
daf-12MA0538.1chrI:130498-130512ACATACACACGCAC-3.87
daf-12MA0538.1chrI:130500-130514ATACACACGCACCA-4.03
daf-12MA0538.1chrI:130808-130822CGTGTGTGTGTGTG+4.07
daf-12MA0538.1chrI:130804-130818GATGCGTGTGTGTG+4.74
daf-12MA0538.1chrI:130806-130820TGCGTGTGTGTGTG+6.41
daf-12MA0538.1chrI:130816-130830TGTGTGTGTGTGGC+6.97
daf-12MA0538.1chrI:130810-130824TGTGTGTGTGTGTG+8.26
daf-12MA0538.1chrI:130812-130826TGTGTGTGTGTGTG+8.26
daf-12MA0538.1chrI:130814-130828TGTGTGTGTGTGTG+8.26
dpy-27MA0540.1chrI:130643-130658GTTGGCTCAGGGAGA-4.43
dsc-1MA0919.1chrI:130582-130591TCAATTAAT+3.27
dsc-1MA0919.1chrI:130582-130591TCAATTAAT-3.27
dsc-1MA0919.1chrI:130879-130888GTAATTATC+3.44
dsc-1MA0919.1chrI:130879-130888GTAATTATC-3.44
dsc-1MA0919.1chrI:130586-130595TTAATTAAA+3.84
dsc-1MA0919.1chrI:130586-130595TTAATTAAA-3.84
efl-1MA0541.1chrI:130603-130617GCGGGCGCCAAATT+5.91
elt-3MA0542.1chrI:130230-130237GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:130370-130377GATGAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:130277-130284GATTAGA-3.58
eor-1MA0543.1chrI:130339-130353TTCTTCTTCTTGGC-3.4
eor-1MA0543.1chrI:130333-130347GTCGTCTTCTTCTT-3.54
eor-1MA0543.1chrI:130567-130581CGATGACAAAGAGA+3.56
eor-1MA0543.1chrI:130336-130350GTCTTCTTCTTCTT-4.04
fkh-2MA0920.1chrI:130927-130934TGTTGAC-3.63
fkh-2MA0920.1chrI:130366-130373TGTTGAT-3.66
lim-4MA0923.1chrI:130748-130756GTAATCAG+3.19
lim-4MA0923.1chrI:130582-130590TCAATTAA+3.52
lim-4MA0923.1chrI:130879-130887GTAATTAT+3.55
lim-4MA0923.1chrI:130587-130595TAATTAAA-3.59
lim-4MA0923.1chrI:130586-130594TTAATTAA+3.75
lin-14MA0261.1chrI:130744-130749AACAG+3.01
mab-3MA0262.1chrI:130324-130336ATGTTGCATGTC+4.54
pal-1MA0924.1chrI:130880-130887TAATTAT-3.33
pal-1MA0924.1chrI:130633-130640TTATTGC-4.12
skn-1MA0547.1chrI:130564-130578TCGCGATGACAAAG+3.82
skn-1MA0547.1chrI:130270-130284AGATGATGATTAGA+4.49
sma-4MA0925.1chrI:130795-130805GTGTCTATAG+3.36
snpc-4MA0544.1chrI:130332-130343TGTCGTCTTCT+3.74
unc-62MA0918.1chrI:130928-130939GTTGACAGTGC-3.19
unc-86MA0926.1chrI:130622-130629TATGCTT+3.09
vab-7MA0927.1chrI:130773-130780TAATTGA+3.09
vab-7MA0927.1chrI:130880-130887TAATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrI:130587-130594TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:130587-130594TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrI:130880-130887TAATTAT-3.6
zfh-2MA0928.1chrI:130435-130445CGAATTACCG-3.12
zfh-2MA0928.1chrI:130878-130888GGTAATTATC+3.29
zfh-2MA0928.1chrI:130879-130889GTAATTATCA-3.29
zfh-2MA0928.1chrI:130288-130298TTTAATTTGG+3.34
zfh-2MA0928.1chrI:130582-130592TCAATTAATT-3.36
zfh-2MA0928.1chrI:130586-130596TTAATTAAAT-4.04
zfh-2MA0928.1chrI:130585-130595ATTAATTAAA+4.38
Enhancer Sequence
CGGAAGGGCT TGTGACCTCT TGGTGTGAAT TTTAAACGGT TTCCTTCCAT CCGAAATGCT 60
AAAAATTCCT CGGGAGCCGT TTAGGGTCTT CACTGAGAGA TGATGATTAG AATCTTTTAA 120
TTTGGTAGAA TTCCCCCCGC GGGACCGATT AATGTTGCAT GTCGTCTTCT TCTTCTTGGC 180
AGCAAAATAT CATTGTTGAT GAGATATCTC AGTTTGATGC TCAATGACGC CTTGAGAAAC 240
ATCCAGCACA CAGTAGATTA GTCGAATTAC CGATGGATGG GGCCGCCCGG GTTTTTGGAG 300
CCAAGAGTCA CGCGATGGGG AGTCCACATA CACACGCACC AACTCTTTCA TTCCATCTAA 360
CAGGGTAGTA GGGTGAAGAA AAGGGGGGGG ATCGCGATGA CAAAGAGACT CAATTAATTA 420
AATGACCGGG GCGGGCGCCA AATTGCACAT ATGCTTGGTT TTATTGCACC GTTGGCTCAG 480
GGAGAGCAAC ATTTTGTGGC AGCACCAGGG GTACTTCAAA ATGACGAACA AAGGTCGTTG 540
TTGTTTCTAT AGGAAGGCTT CCGAACTTTT GAACAGTAAT CAGATCATAT TAGGGTTATG 600
TAATTGACGG TTTTGACCGT ATGTGTCTAT AGATGCGTGT GTGTGTGTGT GTGTGGCGAC 660
ATAAATTACC GTATCCGCAT GGCCTTTTTC CTCCTTCCTC ACAATGGTAA TTATCATCCC 720
CCACTACTCT GGGTCGCCGG ACGAACTGTG AATGTGTTGA CAGTGC 766