EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00005 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:16770-17669 
TF binding sites/motifs
Number: 54             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:17493-17503TTTCGTTTAT-3.15
blmp-1MA0537.1chrI:16865-16875AAATAGAGGT+3.25
blmp-1MA0537.1chrI:17540-17550AAAATGAATA+3.57
blmp-1MA0537.1chrI:17122-17132TATCGATTTT-3.59
blmp-1MA0537.1chrI:17011-17021TCTCACCCTT-3.69
blmp-1MA0537.1chrI:17333-17343TTTCGTTTTT-4.55
blmp-1MA0537.1chrI:17282-17292AAATTGAAAA+4.82
blmp-1MA0537.1chrI:16896-16906AAAATGAAAA+5.14
ceh-22MA0264.1chrI:17406-17416CTACTCCACC+3.51
ceh-48MA0921.1chrI:17305-17313ACCGATTT+3.1
ceh-48MA0921.1chrI:17105-17113ATCAATAC+3.92
ceh-48MA0921.1chrI:16888-16896ATCAATAA+4.21
ceh-48MA0921.1chrI:17122-17130TATCGATT-5.22
ces-2MA0922.1chrI:16792-16800TATGTTAA-3.04
ces-2MA0922.1chrI:16791-16799TTATGTTA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:17114-17122TAAGTAAT-3.85
che-1MA0260.1chrI:16983-16988AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:17155-17160AAACG+3.06
daf-12MA0538.1chrI:17244-17258GAACAAACGCGCGG-3.11
dsc-1MA0919.1chrI:17117-17126GTAATTATC+3.4
dsc-1MA0919.1chrI:17117-17126GTAATTATC-3.4
efl-1MA0541.1chrI:16929-16943AATCGAGCAAAAAT+3.07
efl-1MA0541.1chrI:17603-17617GGGGGCGGACATTT+3.25
efl-1MA0541.1chrI:17062-17076TTCGGCGCGGAAAA+3.33
efl-1MA0541.1chrI:17061-17075ATTCGGCGCGGAAA-3.61
efl-1MA0541.1chrI:17064-17078CGGCGCGGAAAATC+4.07
elt-3MA0542.1chrI:16843-16850TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrI:16868-16882TAGAGGTAAAAAGA+3.34
eor-1MA0543.1chrI:17331-17345TTTTTCGTTTTTCT-3.47
eor-1MA0543.1chrI:16876-16890AAAAGACAGAAAAT+3.4
eor-1MA0543.1chrI:16874-16888TAAAAAGACAGAAA+3.91
eor-1MA0543.1chrI:17002-17016CTCTGCGTCTCTCA-7.93
fkh-2MA0920.1chrI:16874-16881TAAAAAG+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:17653-17660AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:16902-16909AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:16893-16900TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:17204-17211TAAAAAA+3.4
lim-4MA0923.1chrI:16970-16978TAATTGCG-3.17
lim-4MA0923.1chrI:17117-17125GTAATTAT+3.39
pal-1MA0924.1chrI:17118-17125TAATTAT-3.33
pha-4MA0546.1chrI:17636-17645ATGCAAAAA+3.03
pha-4MA0546.1chrI:16861-16870GTGAAAATA+3.11
pha-4MA0546.1chrI:16899-16908ATGAAAACA+3.24
pha-4MA0546.1chrI:16886-16895AAATCAATA+3.55
pha-4MA0546.1chrI:17103-17112AAATCAATA+3.55
skn-1MA0547.1chrI:16897-16911AAATGAAAACAAAA+3.03
skn-1MA0547.1chrI:16822-16836AAATTCAGCATGTT-3.82
sma-4MA0925.1chrI:17419-17429TCCAGACTGT-3.53
unc-86MA0926.1chrI:17635-17642TATGCAA+3.11
unc-86MA0926.1chrI:17544-17551TGAATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrI:17118-17125TAATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrI:17118-17125TAATTAT-3.6
zfh-2MA0928.1chrI:17117-17127GTAATTATCG-3.37
zfh-2MA0928.1chrI:17116-17126AGTAATTATC+3.4
Enhancer Sequence
GAAGACGGAT GTGATTTTAA ATTATGTTAA TGGACTATTT TACAAACTGA ATAAATTCAG 60
CATGTTGGCA GGTTTTTTCA GTAGTTTTTG AGTGAAAATA GAGGTAAAAA GACAGAAAAT 120
CAATAAAAAA TGAAAACAAA ACTATGAAAA ATGGTTGAAA ATCGAGCAAA AATCGTTCAA 180
AAAAAAATAA ATTCAAAAAA TAATTGCGTC GAGAAACGCG TCAGTAGCCG CTCTCTGCGT 240
CTCTCACCCT TCAGCACGCG GAGAGAGCCA CGAGAAATGC GCAAAGGCTA AATTCGGCGC 300
GGAAAATCAT TTTTCAAAAT AAATTCGACG AGAAAATCAA TACTTAAGTA ATTATCGATT 360
TTCAGCTCGT TCAAAAAATT TTCAGAAACG TTTTAGTCGT TTAAAGGTTT TTTTAAAATT 420
AAAATCGTCG GAAGTAAAAA AATAGCGCGG ATGGAAATCT ACGGAGTGCG GAGCGAACAA 480
ACGCGCGGTA ATTCAAATGG GTAGAATAGT CAAAATTGAA AATTAGCCAG CATCGACCGA 540
TTTTTTTAAA ACTTAATGGA TTTTTTCGTT TTTCTTTTGT GGTATTTCGG CATTTAGGAT 600
TAGATAGCAC ATTTTAAAGT AAAATTCCCA TCCAAGCTAC TCCACCTTCT CCAGACTGTA 660
CAGTTAAACC AATTTGAAAA GTGTATTGTA TCCCGTTTTT TTTTCTGAAC AATTTTGAAA 720
ATTTTTCGTT TATCCAGGAT ACGATAATCA TGATTCAAAT TCGTTAACAA AAAATGAATA 780
TATGAGAGCG ATTAAAGCAT TTGTGTCGGA AAATATGGGT TAAATGGGGA GAAGGGGGCG 840
GACATTTGGA TGGGGTACAA AAAAATATGC AAAAAATGGG CTAAAAACAA TATTTTCAA 899