EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-00001 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:5-1649 
TF binding sites/motifs
Number: 46             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:433-443AAATTGAGAT+3.72
ceh-22MA0264.1chrI:1449-1459CCACTTTAGT+3.36
ceh-48MA0921.1chrI:1379-1387ATCAATAA+3.36
ces-2MA0922.1chrI:1275-1283TCTGTAAT-3.55
ces-2MA0922.1chrI:1358-1366TTACGTAA+3.73
ces-2MA0922.1chrI:1359-1367TACGTAAT-5.22
che-1MA0260.1chrI:1037-1042AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:865-870AAACG+3.06
dpy-27MA0540.1chrI:1622-1637CTACCTTCGCTTAAA+3.98
efl-1MA0541.1chrI:519-533ATTTGGCGGGTACC-3.25
elt-3MA0542.1chrI:1560-1567GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:440-447GATAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrI:990-997GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:438-452GAGATAAGAAAACA+3.47
eor-1MA0543.1chrI:1069-1083TTCTTGTTTTCTTG-3.59
eor-1MA0543.1chrI:1533-1547TTCTTGGTCTTTTC-4.27
fkh-2MA0920.1chrI:446-453AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrI:1310-1317TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:906-913TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:1507-1514TGTTTTC-3.08
fkh-2MA0920.1chrI:1064-1071TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:1464-1471TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:1355-1362TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrI:1073-1080TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrI:469-476TGTTTTC-3.23
lim-4MA0923.1chrI:956-964TAATTGCC-3.26
lin-14MA0261.1chrI:1160-1165TGTTC-3.01
mab-3MA0262.1chrI:1134-1146ATTCGCAAGAAA-3.59
mab-3MA0262.1chrI:978-990TTGTTGCATATT+4.52
pal-1MA0924.1chrI:971-978TAATGAT-3.26
pal-1MA0924.1chrI:1307-1314CAATAAA+4.12
pha-4MA0546.1chrI:443-452AAGAAAACA+3.21
pha-4MA0546.1chrI:1389-1398ATTTGCCTA-3.9
skn-1MA0547.1chrI:1432-1446AATTTCATGATATC-3.69
skn-1MA0547.1chrI:1520-1534TTTTTCATGGTTTT-4.65
sma-4MA0925.1chrI:1488-1498TTGTCTAAAC+3.06
sma-4MA0925.1chrI:1032-1042TACAGAAACG-3.12
sma-4MA0925.1chrI:860-870TACAGAAACG-3.12
sma-4MA0925.1chrI:927-937TTGTCTGCCC+3.34
sma-4MA0925.1chrI:1272-1282ATTTCTGTAA+3
unc-62MA0918.1chrI:1373-1384TTTGACATCAA-3.01
unc-86MA0926.1chrI:982-989TGCATAT-3.11
unc-86MA0926.1chrI:1236-1243TAGGAAT+3.37
unc-86MA0926.1chrI:1019-1026TGAATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrI:971-978TAATGAT-3.43
zfh-2MA0928.1chrI:1175-1185GAAATTAGTT-3.01
Enhancer Sequence
AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA 60
AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA 120
AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA 180
AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA 240
AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA 300
AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA 360
AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA AGCCTAAGCC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA 420
AGCCTAAAAA ATTGAGATAA GAAAACATTT TACTTTTTCA AAATTGTTTT CATGCTAAAT 480
TCAAAACGTT TTTTTTTTAG TGAAGCTTCT AGATATTTGG CGGGTACCTC TAATTTTGCC 540
TGCCTGCCAA CCTATATGCT CCTGTGTTTA GGCCTAATAC TAAGCCTAAG CCTAAGCCTA 600
ATACTAAGCC TAAGCCTAAG ACTAAGCCTA ATACTAAGCC TAAGCCTAAG ACTAAGCCTA 660
AGACTAAGCC TAAGACTAAG CCTAATACTA AGCCTAAGCC TAAGACTAAG CCTAAGCCTA 720
ATACTAAGCC TAAGCCTAAG ACTAAGCCTA ATACTAAGCC TAAGCCTAAG ACTAAGCCTA 780
AGACTAAGCC TAAGACTAAG CCTAATACTA AGCCTAAGCC TAAGACTAAG CCTAAGCCTA 840
AAAGAATATG GTAGCTACAG AAACGGTAGT ACACTCTTCT GAAAATACAA AAAATTTGCA 900
ATTTTTATAG CTAGGGCACT TTTTGTCTGC CCAAATATAG GCAACCAAAA ATAATTGCCA 960
AGTTTTTAAT GATTTGTTGC ATATTGAAAA AAACATTTTT CGGGTTTTTT GAAATGAATA 1020
TCGTAGCTAC AGAAACGGTT GTGCACTCAT CTGAAAGTTT GTTTTTCTTG TTTTCTTGCA 1080
CTTTGTGCAG AATTCTTGAT TCTTGATTCT TGCAGAAATT TGCAAGAAAA TTCGCAAGAA 1140
ATTTGTATTA AAAACTGTTC AAAATTTTTG GAAATTAGTT TAAAAATCTC ACATTTTTTT 1200
TAGAAAAATT ATTTTTAAGA ATTTTTCATT TTAGGAATAT TGTTATTTCA GAAAATAGCT 1260
AAATGTGATT TCTGTAATTT TGCCTGCCAA ATTCGTGAAA TGCAATAAAA ATCTAATATC 1320
CCTCATCAGT GCGATTTCCG AATCAGTATA TTTTTACGTA ATAGCTTCTT TGACATCAAT 1380
AAGTATTTGC CTATATGACT TTAGACTTGA AATTGGCTAT TAATGCCAAT TTCATGATAT 1440
CTAGCCACTT TAGTATAATT GTTTTTAGTT TTTGGCAAAA CTATTGTCTA AACAGATATT 1500
CGTGTTTTCA AGAAATTTTT CATGGTTTTT CTTGGTCTTT TCTTGGTATT TTTTTGACAA 1560
AAATTTTTGT TTCTTGATTC TTGCAAAAAT TTTTCCGTTT GACGGCCTTG ATGTGCACTA 1620
CCTTCGCTTA AATACTACAT TTTC 1644