EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE003-00978 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_late 
Coordinate
chrIII:12611322-12611810 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:12611594-12611604AAATTGAGGT+3.27
blmp-1MA0537.1chrIII:12611351-12611361TTTCATTTCC-3.47
blmp-1MA0537.1chrIII:12611385-12611395TCTCATTTTT-3.97
ceh-22MA0264.1chrIII:12611734-12611744CTTCTTGAAA+3.57
ceh-22MA0264.1chrIII:12611324-12611334CCACTCAAAA+3.86
ceh-48MA0921.1chrIII:12611370-12611378TATTGGCT-3.03
ces-2MA0922.1chrIII:12611661-12611669GGTGTAAT-3.01
ces-2MA0922.1chrIII:12611722-12611730TTCATAAT-3.25
ces-2MA0922.1chrIII:12611721-12611729TTTCATAA+3.43
efl-1MA0541.1chrIII:12611585-12611599AAAGGCGGAAAATT+4.02
elt-3MA0542.1chrIII:12611392-12611399TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:12611520-12611527AATAAGA-3.25
eor-1MA0543.1chrIII:12611384-12611398GTCTCATTTTTCTC-3.32
fkh-2MA0920.1chrIII:12611710-12611717AAAACAC+3.08
hlh-1MA0545.1chrIII:12611497-12611507CCATCTGCTA-3.32
hlh-1MA0545.1chrIII:12611526-12611536AACATCTGGC+3.85
hlh-1MA0545.1chrIII:12611464-12611474AACAACTGAG+4.02
lim-4MA0923.1chrIII:12611649-12611657TCAATTAA+3.3
lin-14MA0261.1chrIII:12611526-12611531AACAT+3.14
pal-1MA0924.1chrIII:12611519-12611526TAATAAG+3.11
pal-1MA0924.1chrIII:12611760-12611767TTATGGC-3.32
pal-1MA0924.1chrIII:12611421-12611428TTATGAC-3.79
pal-1MA0924.1chrIII:12611487-12611494TTAGTAC-3
sma-4MA0925.1chrIII:12611703-12611713TTGTCTGAAA+3.2
sma-4MA0925.1chrIII:12611639-12611649TCCAGAAATT-3.71
vab-7MA0927.1chrIII:12611396-12611403TCATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrIII:12611726-12611733TAATGAA+3.35
zfh-2MA0928.1chrIII:12611649-12611659TCAATTAAAG-3.15
Enhancer Sequence
TTCCACTCAA AACATCAATT TTTCGGTTAT TTCATTTCCA CTATATACTA TTGGCTGTAA 60
ATGTCTCATT TTTCTCATGA AAAAGACCGA AATTATGGTT TATGACATAC TACCACAGAT 120
GTACACAAGT TGACCCCCTT CCAACAACTG AGCTCTGCAC ATTTTTTAGT ACGTACCATC 180
TGCTACTATG ACCTCTGTAA TAAGAACATC TGGCAGTGTG GTACTGCTGC TGCTGCGTCA 240
TATACTAATC CTGCTAACCT ATGAAAGGCG GAAAATTGAG GTCTCGGGTG GAATTAGCAA 300
GAAAATGGCC TAAATTTTCC AGAAATTTCA ATTAAAGGTG GTGTAATGGA ATTTTTTAAA 360
TTGCCTTATT AGACTCAAAA CTTGTCTGAA AACACCGAAT TTCATAATGA AACTTCTTGA 420
AAACTTTTCA GAAAAAAGTT ATGGCGGCTC AAAAATGGCC TAAAACTAGT TAAAATTGGA 480
TATTTGAC 488