EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE003-00880 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_late 
Coordinate
chrIII:8294870-8297213 
TF binding sites/motifs
Number: 121             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:8296682-8296692TTTCATCCCT-3.17
blmp-1MA0537.1chrIII:8296962-8296972TTTCACTCAC-3.21
blmp-1MA0537.1chrIII:8295253-8295263ATTCTCTTCT-3.31
blmp-1MA0537.1chrIII:8296796-8296806CCTCTTCTTT-3.32
blmp-1MA0537.1chrIII:8295181-8295191TATCTATTCC-3.34
blmp-1MA0537.1chrIII:8296759-8296769CCTCATCTTT-3.36
blmp-1MA0537.1chrIII:8296803-8296813TTTCTTCTCC-3.39
blmp-1MA0537.1chrIII:8296444-8296454GAAGAGAATG+3.3
blmp-1MA0537.1chrIII:8296075-8296085TTTCTTTTCT-3.45
blmp-1MA0537.1chrIII:8296448-8296458AGAATGAGGA+3.57
blmp-1MA0537.1chrIII:8296799-8296809CTTCTTTCTT-3.63
blmp-1MA0537.1chrIII:8294879-8294889TTTCATTCTT-3.64
blmp-1MA0537.1chrIII:8295578-8295588AAATGGAAAT+3.67
blmp-1MA0537.1chrIII:8295233-8295243TTTCATTCCT-3.69
blmp-1MA0537.1chrIII:8295255-8295265TCTCTTCTTC-3.76
blmp-1MA0537.1chrIII:8296852-8296862TCTCAATTTC-3.76
blmp-1MA0537.1chrIII:8296442-8296452AAGAAGAGAA+3.79
blmp-1MA0537.1chrIII:8295279-8295289ATTCACTTTT-3.81
blmp-1MA0537.1chrIII:8296434-8296444AGAACGAAAA+3.97
blmp-1MA0537.1chrIII:8296832-8296842TTTCATTTTC-4.06
blmp-1MA0537.1chrIII:8296332-8296342TCTCGCTCTT-4.15
blmp-1MA0537.1chrIII:8295499-8295509TTTCCATTTC-4.41
blmp-1MA0537.1chrIII:8296342-8296352TTTCACTTTT-6.34
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:8295181-8295194TATCTATTCCAAT-3.71
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:8294875-8294888TTAGTTTCATTCT+4.63
ceh-22MA0264.1chrIII:8295709-8295719ATACTTGAAT+3.23
ceh-22MA0264.1chrIII:8296888-8296898CTTCTTCAAA+3.24
ceh-22MA0264.1chrIII:8294949-8294959GCTCTCGAAA+3.37
ceh-22MA0264.1chrIII:8296642-8296652CTGAATTGGT-3.37
ceh-22MA0264.1chrIII:8297107-8297117ACTCTTGACA+3.53
ceh-48MA0921.1chrIII:8295199-8295207TTCGATAT+3.07
ces-2MA0922.1chrIII:8296657-8296665TAACGTAA+3.15
ces-2MA0922.1chrIII:8296615-8296623TTCATAAT-3.25
ces-2MA0922.1chrIII:8295955-8295963TTATTTAA+3.38
che-1MA0260.1chrIII:8295842-8295847AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIII:8296418-8296423AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIII:8296149-8296154GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrIII:8297059-8297073TATATGTGTGTTGA+3.11
daf-12MA0538.1chrIII:8296962-8296976TTTCACTCACACTC-3.31
daf-12MA0538.1chrIII:8295489-8295503TAGAAAACACTTTC-3.51
daf-12MA0538.1chrIII:8296964-8296978TCACTCACACTCTC-3.82
daf-12MA0538.1chrIII:8295585-8295599AATGTGTTTCCGTG+3.86
efl-1MA0541.1chrIII:8296940-8296954TGTTGGCGCTCCCA-3.27
efl-1MA0541.1chrIII:8295073-8295087ATTTTCCGCGCACT-4.77
elt-3MA0542.1chrIII:8295562-8295569GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrIII:8294886-8294893CTTTTCA+3.31
elt-3MA0542.1chrIII:8296199-8296206CTTCTCA+3.35
elt-3MA0542.1chrIII:8296612-8296619TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrIII:8296700-8296714CAAAAACACAAAAA+3.22
eor-1MA0543.1chrIII:8296957-8296971TTGTCTTTCACTCA-3.27
eor-1MA0543.1chrIII:8296312-8296326AAAAGTCAGCGAGA+3.31
eor-1MA0543.1chrIII:8296959-8296973GTCTTTCACTCACA-3.37
eor-1MA0543.1chrIII:8296333-8296347CTCGCTCTTTTTCA-3.44
eor-1MA0543.1chrIII:8296337-8296351CTCTTTTTCACTTT-3.64
eor-1MA0543.1chrIII:8296151-8296165TTCTTCCTATTTTC-3.71
eor-1MA0543.1chrIII:8296445-8296459AAGAGAATGAGGAG+3.79
eor-1MA0543.1chrIII:8295256-8295270CTCTTCTTCTGTTT-3.95
eor-1MA0543.1chrIII:8295248-8295262TTCTTATTCTCTTC-4.37
eor-1MA0543.1chrIII:8296437-8296451ACGAAAAGAAGAGA+4.45
eor-1MA0543.1chrIII:8296331-8296345CTCTCGCTCTTTTT-4.74
fkh-2MA0920.1chrIII:8296565-8296572AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:8294964-8294971TCTACAA+3.02
fkh-2MA0920.1chrIII:8297011-8297018TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:8295026-8295033TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:8295492-8295499AAAACAC+3.08
fkh-2MA0920.1chrIII:8295285-8295292TTTTTAC-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:8295700-8295707TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:8297057-8297064TGTATAT-3.16
fkh-2MA0920.1chrIII:8295016-8295023TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:8296503-8296510TGTTTAA-3.48
fkh-2MA0920.1chrIII:8295802-8295809TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrIII:8297067-8297074TGTTGAC-3.63
fkh-2MA0920.1chrIII:8296604-8296611TCAACAA+3.76
fkh-2MA0920.1chrIII:8295216-8295223TGTTGAC-3.76
hlh-1MA0545.1chrIII:8295333-8295343AGCACCTGTT+3.75
hlh-1MA0545.1chrIII:8295334-8295344GCACCTGTTC-3.98
hlh-1MA0545.1chrIII:8295220-8295230GACAGCTGTC+4.34
hlh-1MA0545.1chrIII:8295221-8295231ACAGCTGTCC-5.29
lim-4MA0923.1chrIII:8295380-8295388TTAATCAA+3.05
lim-4MA0923.1chrIII:8295036-8295044TCAATTAA+3.3
lin-14MA0261.1chrIII:8295339-8295344TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIII:8295727-8295732AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrIII:8295826-8295831AACAT+3.14
pal-1MA0924.1chrIII:8297146-8297153AAATTAA+3.07
pal-1MA0924.1chrIII:8296911-8296918TCATAAC+3.09
pal-1MA0924.1chrIII:8297121-8297128TTATGGT-3.21
pal-1MA0924.1chrIII:8297206-8297213TAATAAA+4.57
pha-4MA0546.1chrIII:8295279-8295288ATTCACTTT-3.08
pha-4MA0546.1chrIII:8295125-8295134TTTTGCTCA-3.12
pha-4MA0546.1chrIII:8296562-8296571GAGAAAACA+3.28
pha-4MA0546.1chrIII:8294932-8294941ATTTGCCAA-3.35
pha-4MA0546.1chrIII:8295697-8295706ATTTGTTTT-3.73
pha-4MA0546.1chrIII:8296601-8296610AGGTCAACA+3.81
pha-4MA0546.1chrIII:8297068-8297077GTTGACATA-4.06
pha-4MA0546.1chrIII:8296230-8296239ATGCAAATA+4.28
skn-1MA0547.1chrIII:8296904-8296918ATATTCATCATAAC-3.72
skn-1MA0547.1chrIII:8296440-8296454AAAAGAAGAGAATG+4
sma-4MA0925.1chrIII:8295100-8295110ACGTCTAGGC+3.12
sma-4MA0925.1chrIII:8295487-8295497TCTAGAAAAC-3.14
sma-4MA0925.1chrIII:8297186-8297196TCCAGACTTT-3.45
sma-4MA0925.1chrIII:8295639-8295649TTGACTGGAT+3.59
unc-62MA0918.1chrIII:8295415-8295426AGTGACAAATT-3.11
unc-62MA0918.1chrIII:8296062-8296073TAATGTCATTT+3.14
unc-62MA0918.1chrIII:8295223-8295234AGCTGTCCTTT+3.66
unc-62MA0918.1chrIII:8297110-8297121CTTGACATCTT-3.73
unc-62MA0918.1chrIII:8295217-8295228GTTGACAGCTG-4.39
unc-86MA0926.1chrIII:8296231-8296238TGCAAAT-3.09
unc-86MA0926.1chrIII:8295792-8295799AATGCAT+3.11
unc-86MA0926.1chrIII:8296229-8296236TATGCAA+3.11
unc-86MA0926.1chrIII:8295794-8295801TGCATAG-3.3
unc-86MA0926.1chrIII:8297149-8297156TTAATAT-3.47
unc-86MA0926.1chrIII:8296905-8296912TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrIII:8295924-8295931TCATTAT-3.35
zfh-2MA0928.1chrIII:8294892-8294902AAAATTAGTT-3.03
zfh-2MA0928.1chrIII:8295420-8295430CAAATTATTA-3.04
zfh-2MA0928.1chrIII:8295714-8295724TGAATTAGGA-3.05
zfh-2MA0928.1chrIII:8295951-8295961CAAATTATTT-3.09
zfh-2MA0928.1chrIII:8297145-8297155GAAATTAATA-3.13
zfh-2MA0928.1chrIII:8295036-8295046TCAATTAAAC-3.15
zfh-2MA0928.1chrIII:8297138-8297148CAAATTAGAA-3.15
zfh-2MA0928.1chrIII:8296496-8296506TTTAATTTGT+3.3
Enhancer Sequence
AAATATTAGT TTCATTCTTT TCAAAATTAG TTTGGAACTT TCTAAAAGAG CTGAAAGTTG 60
TTATTTGCCA AAAAAAATTG CTCTCGAAAA TTTGTCTACA AATCACAATT TTTGGCAGTT 120
TTCCAGAATC TTACGGAAGT TTTCAATAAA AAATTATTTT TATTTTTCAA TTAAACGACA 180
TGCCGAAGTG GACAGTTTTG TGGATTTTCC GCGCACTTAC AAAGCAAGTT ACGTCTAGGC 240
TCAGTTCAGA TCAATTTTTG CTCAGGCCAA ATTCCAAACC CAAAATGTCT CCACCTATTT 300
CTCCGCAAAC CTATCTATTC CAATTTCATT TCGATATATT CCCCCTTGTT GACAGCTGTC 360
CTTTTTCATT CCTTTACCTT CTTATTCTCT TCTTCTGTTT TTTCTTGGTA TTCACTTTTT 420
ACCCTCCAAA TTCAATTCTC TTTGACCTAG ATCATACTAA CAGAGCACCT GTTCCTATAT 480
TCCCCGAAAC AAAATTTATA GACGTCCCCC TTAATCAAAA CGCGCCGACG ACTTTAGCTA 540
TAAAAAGTGA CAAATTATTA TTGCAATCGT GTGGCACGAA TGTGAGCTTT TGGTGCACGT 600
TGAGTGAAAA CTAGGACTCT AGAAAACACT TTCCATTTCA CTCTGTTTTC ACCTAATTCT 660
AGTTTCTTTG ATAGATTACT TGTTATGCTA CTGAGAAAAA AATATAGAAA ATGGAAATGT 720
GTTTCCGTGT TTTTGAAAAC CTGGTAGTGT TTCTTGTGTT GGATTAAGCT TGACTGGATG 780
CTGAGTTTAC CTGAAACATA TAATCTAAAT AATACCAAAA ATCAGTTATT TGTTTTTCTA 840
TACTTGAATT AGGATTGAAC ATTTTCTTGA AGTGAAAAAT CACCAGTGCC CAATTTTGAA 900
TTTTTCAGGC AAAGCATAGG TAAATGCATA GGTAAAAAAA AAGCCAAATT TGTTTGAACA 960
TCTAGCTTTT TGAAACGTTT TAAAACTTTA AATTTTGAAA CTCGTAGGTT GAACTGTTAT 1020
TTTTCAAAAA AATTAAAAAC TTGTTTGGAA TTTTTCATTA TGACAATCGG CCTCTCCTGC 1080
TCAAATTATT TAAAGCTTTG AGCTTTGGAT TATTTTAAAT TTAAAAAAAA AAATCCAAAA 1140
GAAAACGGTT ACTTGTGATC CGTGTGATCC CTTTTGTTTG ATCCATTTTG ACTAATGTCA 1200
TTTGATTTCT TTTCTTATTC CCCCATTTTC GTCCACTTTT CGTTCCATTC CGATTCATTT 1260
CCAATTTAAC TCCTCGTCGG TTTCTTCCTA TTTTCCGTAG TGGTCATGCC AAAAGATTTC 1320
CGAATAGTTC TTCTCACACT ATCCTGTTTC TTTACCTGAT ATGCAAATAT ATATAGGATT 1380
GAATGGACAT TCCGAAATTT CGGAAAATAG TTGAGAATGG AACAATTGGA AAAACATGCA 1440
AAAAAAGTCA GCGAGAAAAA TCTCTCGCTC TTTTTCACTT TTGATCTATT TTTCTCGGCG 1500
CGTCGGTGTG ATTTATGAGA ATTGGATTCT GAGTAGTAGA ATAGTGCGAA ACGAGCAAGA 1560
AAAAAGAACG AAAAGAAGAG AATGAGGAGC TTTACGAATT TACGAACTCA TACTATACTA 1620
GCGATTTTTA ATTTGTTTAA AATAGGTTTT TTGGGTCAAG TTTTTAACTT ATTCGTTGAT 1680
CTATGAAATA TAGAGAAAAC ATTCTGAAAT CATTTTCTAT ATCTAAATTT TAGGTCAACA 1740
ATTTTTTCAT AATATCATCT GAATAGCAGA GTCTGAATTG GTCACTGTAA CGTAAGCGAT 1800
AACCGCGAGA GCTTTCATCC CTTTACTCTA CAAAAACACA AAAAACTTTC GAAATCCCAA 1860
CTCCCATCCT GACTAAACTC CGTTCCCATC CTCATCTTTA GACTTCTTAA TCCCTCTCTT 1920
AGTTGCCCTC TTCTTTCTTC TCCAATTTAG CTCCATTTTT AGTTTCATTT TCACGAAGTT 1980
CGTCTCAATT TCACTATATA TGGTTGAACC CCCCGATTCT TCTTCAAAAG TGTCATATTC 2040
ATCATAACTT TGCTTAGTAT TATCTCGGGT TGTTGGCGCT CCCAAATTTG TCTTTCACTC 2100
ACACTCTCTT TGAATTCCTG TACAGCTTAG GATGGGAAGC TTCAACAAAC AAGGCACGTT 2160
GTTCTCGAAC CTTATGTGTT GTACACGTGT ATATGTGTGT TGACATAACT GTTGGCCGGA 2220
AACAATAGAC TTTTCAAACT CTTGACATCT TTTATGGTAT TCTCATTTCA AATTAGAAAT 2280
TAATATTTCA TTTAGATTTT GCAAAAAATA ACCGAATCCA GACTTTAACC CAAGTGTAAT 2340
AAA 2343