EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE003-00611 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_late 
Coordinate
chrII:13287182-13288032 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrII:13287987-13288000TTTTATTAGTTAA+3.47
ceh-22MA0264.1chrII:13287763-13287773CTGAATTGGC-3.17
ceh-48MA0921.1chrII:13287303-13287311TATTGGGT-3.1
ceh-48MA0921.1chrII:13287850-13287858ATCAATAA+3.44
ces-2MA0922.1chrII:13287731-13287739TATATACT-3.19
ces-2MA0922.1chrII:13287672-13287680TCACATAA+3.55
dsc-1MA0919.1chrII:13287886-13287895TTAATTAAA+3.54
dsc-1MA0919.1chrII:13287886-13287895TTAATTAAA-3.54
elt-3MA0542.1chrII:13287408-13287415GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrII:13287342-13287349TTTAGCA+3.07
elt-3MA0542.1chrII:13287490-13287497TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrII:13287639-13287646TTGATCA+3.07
elt-3MA0542.1chrII:13287641-13287648GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrII:13287979-13287986GATAAAT-3.23
elt-3MA0542.1chrII:13287936-13287943GTTATCA+3.2
elt-3MA0542.1chrII:13287195-13287202GACAAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrII:13287429-13287436GACAAGA-3.45
eor-1MA0543.1chrII:13287824-13287838CTCTTCTTATTTGT-3.66
fkh-2MA0920.1chrII:13287709-13287716TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrII:13287278-13287285TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrII:13287552-13287559TTTTTAC-3.19
hlh-1MA0545.1chrII:13287865-13287875GACAATTGAT+3.59
lim-4MA0923.1chrII:13287886-13287894TTAATTAA+3.59
lim-4MA0923.1chrII:13287887-13287895TAATTAAA-3.59
pal-1MA0924.1chrII:13287975-13287982TTATGAT-3.29
pha-4MA0546.1chrII:13287978-13287987TGATAAATA+3.22
pha-4MA0546.1chrII:13287706-13287715AGATAAATA+3.36
sma-4MA0925.1chrII:13287521-13287531TAGTCTAGAG+3.02
sma-4MA0925.1chrII:13287563-13287573TGGTCTAGAA+3.02
sma-4MA0925.1chrII:13287250-13287260CCTAGAAATA-3.25
sma-4MA0925.1chrII:13287313-13287323CCTAGAAATA-3.25
sma-4MA0925.1chrII:13287439-13287449CCTAGAAATA-3.25
sma-4MA0925.1chrII:13287503-13287513CCTAGAAATC-3.31
sma-4MA0925.1chrII:13287209-13287219GACAGACATG-3.7
sma-4MA0925.1chrII:13287205-13287215CCTAGACAGA-3.94
sma-4MA0925.1chrII:13287578-13287588CGGTCTAGAT+3
snpc-4MA0544.1chrII:13287598-13287609GTAGCCTACAT-3.84
unc-62MA0918.1chrII:13287210-13287221ACAGACATGAC-3.01
unc-62MA0918.1chrII:13287426-13287437TATGACAAGAT-3.03
unc-62MA0918.1chrII:13287926-13287937AGCTGTAAAAG+3.2
unc-62MA0918.1chrII:13287215-13287226CATGACAAGGC-3.39
unc-62MA0918.1chrII:13287946-13287957AGTTGTCAACT+3.57
unc-86MA0926.1chrII:13287449-13287456TGACTAA-3.37
vab-7MA0927.1chrII:13287887-13287894TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrII:13287887-13287894TAATTAA-3.22
zfh-2MA0928.1chrII:13287644-13287654CAAATTAAAA-3.3
zfh-2MA0928.1chrII:13287885-13287895TTTAATTAAA+3.84
zfh-2MA0928.1chrII:13287886-13287896TTAATTAAAA-3.84
Enhancer Sequence
GGCCTAAAAT TTTGACAAGA TGACCTAGAC AGACATGACA AGGCACCCTA GAATTTTTGA 60
CATGGTAGCC TAGAAATATG GCTAGATAGG CTGGAATTTT TACAGGATGG CCTAGAAGTT 120
TTATTGGGTG GCCTAGAAAT ATGGCTAGAT AGCCTAGAAT TTTAGCAAGA TGGACTTGAA 180
TTTTCACTAG GAGGCCTAGA ATTTTGGCAA GATCACCTAG AATTTTGAGA AAATGGCCTA 240
CAAATATGAC AAGATGGCCT AGAAATATGA CTAAATGGCC AAGAATTTTG GCACAATGGC 300
CTAGAATTTT TGTCATGGTG GCCTAGAAAT CGGACTAGAT AGTCTAGAGT TTGGGCAAGG 360
TGGCCTAGAA TTTTTACAAG ATGGTCTAGA ATAAGTCGGT CTAGATTTCT GACAAAGTAG 420
CCTACATCAA CGTTTAAAAC GGCCTAGAAT TTCGAGTTTG ATCAAATTAA AACTGAAAAT 480
CCTTCACAAA TCACATAAAC TGTAGTACTC CTAGGCTACA ACACAGATAA ATAAAACGAA 540
TCAAAGGTTT ATATACTGCT GCTGATGCGG GAGACGACGG CCTGAATTGG CCGAATGTGT 600
GATTTCAAGT CTGTATCTTG ATTCTATCCA AACATTTAAG TTCTCTTCTT ATTTGTGGTG 660
TCTTAGATAT CAATAACACA GGCGACAATT GATATTTGAA CTTTTTAATT AAAAGTTCCA 720
ACTTACAAAA CGCTATATCT CTATAGCTGT AAAAGTTATC AAAAAGTTGT CAACTATCAA 780
GTTATAGCAA ATTTTATGAT AAATATTTTA TTAGTTAACA AGTTTTTGTT AGCTATTATG 840
ATTATTGAGA 850