EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE003-00263 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_late 
Coordinate
chrI:10308226-10308913 
TF binding sites/motifs
Number: 60             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:10308523-10308533TTTCATTCAT-3.09
blmp-1MA0537.1chrI:10308557-10308567AGATAGATAA+3.47
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:10308723-10308736TTGATTAAATTAA+3.44
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:10308683-10308696TAAGTGAGCCATT-3.73
ceh-22MA0264.1chrI:10308311-10308321TAAAAGTGGA-3
ceh-48MA0921.1chrI:10308837-10308845TTCAATAA+3.49
ceh-48MA0921.1chrI:10308721-10308729TATTGATT-3.92
ces-2MA0922.1chrI:10308508-10308516TTATATTA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:10308801-10308809TTACTCAA+3.17
ces-2MA0922.1chrI:10308380-10308388TTCTATAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:10308758-10308766TTGTATAA+3.19
dsc-1MA0919.1chrI:10308881-10308890CTAATTTAT+3.13
dsc-1MA0919.1chrI:10308881-10308890CTAATTTAT-3.13
elt-3MA0542.1chrI:10308874-10308881GGTAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:10308640-10308647GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:10308725-10308732GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:10308790-10308797GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:10308267-10308274GATAAAA-4.31
eor-1MA0543.1chrI:10308238-10308252AAATGAATAAGAAA+3.13
eor-1MA0543.1chrI:10308560-10308574TAGATAAACAAAGA+3.59
fkh-2MA0920.1chrI:10308703-10308710TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:10308763-10308770TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:10308709-10308716TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:10308519-10308526TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:10308576-10308583TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrI:10308480-10308487TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:10308564-10308571TAAACAA+4.31
lim-4MA0923.1chrI:10308823-10308831TCATTACT-3.03
lim-4MA0923.1chrI:10308696-10308704TAATGAAT-3.07
lim-4MA0923.1chrI:10308890-10308898TAATGAAT-3.07
lim-4MA0923.1chrI:10308733-10308741TAATTGTA-3.14
lim-4MA0923.1chrI:10308755-10308763TAATTGTA-3.14
pal-1MA0924.1chrI:10308233-10308240AAATAAA+3.12
pal-1MA0924.1chrI:10308823-10308830TCATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrI:10308746-10308753TCATTAA+3.26
pal-1MA0924.1chrI:10308444-10308451TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrI:10308733-10308740TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrI:10308755-10308762TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrI:10308483-10308490TTATTAT-3.63
pha-4MA0546.1chrI:10308283-10308292AAGCTAATA+3.02
pha-4MA0546.1chrI:10308896-10308905ATTTACTTT-3.02
pha-4MA0546.1chrI:10308577-10308586TTTTACTCA-3.17
pha-4MA0546.1chrI:10308561-10308570AGATAAACA+3.55
skn-1MA0547.1chrI:10308260-10308274ATCTGATGATAAAA+3.05
sma-4MA0925.1chrI:10308862-10308872AAGTCTGGAT+3.45
unc-62MA0918.1chrI:10308424-10308435TATTACATGTA-3.08
unc-86MA0926.1chrI:10308887-10308894TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrI:10308241-10308248TGAATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrI:10308528-10308535TTCATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrI:10308699-10308706TGAATAA-3.58
vab-7MA0927.1chrI:10308733-10308740TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrI:10308755-10308762TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrI:10308823-10308830TCATTAC-3.29
vab-7MA0927.1chrI:10308746-10308753TCATTAA+3.43
zfh-2MA0928.1chrI:10308832-10308842CCTAATTCAA+3.08
zfh-2MA0928.1chrI:10308880-10308890ACTAATTTAT+3.12
zfh-2MA0928.1chrI:10308731-10308741ATTAATTGTA+3.19
zfh-2MA0928.1chrI:10308753-10308763ATTAATTGTA+3.19
zfh-2MA0928.1chrI:10308728-10308738TAAATTAATT-3.28
zfh-2MA0928.1chrI:10308750-10308760TAAATTAATT-3.28
Enhancer Sequence
GATCTGGAAA TAAAATGAAT AAGAAATCTA AAAAATCTGA TGATAAAAAG ATATCAAAAG 60
CTAATAATAA TTTCTTAAAA GTTCTTAAAA GTGGATCAGG TTTTAAGAGA ATTTAGATGA 120
TATGTAACTC AATTTCAATA TCACATTTAT TTGATTCTAT AAGATTATTT GAATCATCTA 180
CAAGTCTCAA AGTTATGGTA TTACATGTAT TAACTATTTT ATGATATATC AAATTTATAG 240
GTTCATATTT TACTTTTTTA TTATTTGAAT AGAATTTACA AATTATATTA CTTTGTTTTT 300
CATTCATAAA AGAATCACAA ATAAGACTAC AAGATAGATA AACAAAGATA TTTTTACTCA 360
TATCTATAGT TCCATCAACT TTTACAACTG CAATAGATGT AGCATTAAAG TTTTGATTAA 420
AGTTAAATTG TGTATTATTT GACTTAAGAT TAAGGAATAA GTGAGCCATT TAATGAATAA 480
AAATTTTTAT TAACATATTG ATTAAATTAA TTGTATTAAA TCATTAAATT AATTGTATAA 540
AAATCTGACT TCACTGATTA TTCTGTTAAA AATTATTACT CAAATAGAAA CAATAATTCA 600
TTACTGCCTA ATTCAATAAG AGCATGTATT ATAGGAAAGT CTGGATGTGG TAAAACTAAT 660
TTATTAATGA ATTTACTTTT GGATAAA 687