EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE003-00259 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_late 
Coordinate
chrI:10069567-10070545 
TF binding sites/motifs
Number: 47             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:10070004-10070014CCTCTTTTCC-3.06
blmp-1MA0537.1chrI:10069836-10069846AAAATGATTA+3.12
blmp-1MA0537.1chrI:10070158-10070168TAAAAGAGAA+3.21
blmp-1MA0537.1chrI:10069887-10069897CCTCCTCTTT-3.23
blmp-1MA0537.1chrI:10070327-10070337TCTCGTCCTC-3.24
blmp-1MA0537.1chrI:10069905-10069915TTTCTCCCCC-3.29
blmp-1MA0537.1chrI:10069894-10069904TTTCTTCTCT-3.41
blmp-1MA0537.1chrI:10069890-10069900CCTCTTTCTT-3.55
blmp-1MA0537.1chrI:10069934-10069944TTTCCCTCTC-3.72
blmp-1MA0537.1chrI:10070160-10070170AAAGAGAATA+3.75
blmp-1MA0537.1chrI:10069897-10069907CTTCTCTTTT-4.43
blmp-1MA0537.1chrI:10069899-10069909TCTCTTTTTC-4.7
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:10069822-10069835AAACGAAACAAAC-3.56
che-1MA0260.1chrI:10069683-10069688AAGCC+3.7
dpy-27MA0540.1chrI:10070343-10070358TTTCGTGATGGGAAA-3.51
efl-1MA0541.1chrI:10069916-10069930TATTCCCGTTCAGT-3.2
elt-3MA0542.1chrI:10070213-10070220TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:10069819-10069826GATAAAC-3.21
eor-1MA0543.1chrI:10069895-10069909TTCTTCTCTTTTTC-3.26
eor-1MA0543.1chrI:10069892-10069906TCTTTCTTCTCTTT-3.36
eor-1MA0543.1chrI:10069848-10069862AGAAGACAAAGAGC+3.56
eor-1MA0543.1chrI:10069898-10069912TTCTCTTTTTCTCC-4.37
eor-1MA0543.1chrI:10069933-10069947GTTTCCCTCTCCCG-4.54
eor-1MA0543.1chrI:10069900-10069914CTCTTTTTCTCCCC-5.67
fkh-2MA0920.1chrI:10070267-10070274TATACAT+3.12
fkh-2MA0920.1chrI:10070059-10070066TGTATAT-3.12
fkh-2MA0920.1chrI:10069972-10069979TATACAC+3.16
fkh-2MA0920.1chrI:10069597-10069604TATACAA+3.35
fkh-2MA0920.1chrI:10069645-10069652TAAACAC+3.37
fkh-2MA0920.1chrI:10069630-10069637TGTTTAA-3.48
fkh-2MA0920.1chrI:10070474-10070481TAAACAG+3.89
hlh-1MA0545.1chrI:10069976-10069986CACAGATGGC+3.53
lin-14MA0261.1chrI:10070311-10070316TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:10070026-10070031CGTTC-3.36
mab-3MA0262.1chrI:10070279-10070291ATGTTGTGATTT+4.24
pal-1MA0924.1chrI:10069818-10069825TGATAAA+3.1
pal-1MA0924.1chrI:10069764-10069771TCATAAA+3.29
pha-4MA0546.1chrI:10069858-10069867GAGCAAACG+3.17
pha-4MA0546.1chrI:10070437-10070446AAGCAAAAA+3.23
pha-4MA0546.1chrI:10070471-10070480GCGTAAACA+3.24
pha-4MA0546.1chrI:10069950-10069959GAGCATATA+3
sma-4MA0925.1chrI:10070431-10070441GCTAGAAAGC-3.12
sma-4MA0925.1chrI:10069734-10069744TCTAGACAAC-3.95
unc-62MA0918.1chrI:10070364-10070375TATGACATGGA-3.21
unc-86MA0926.1chrI:10070267-10070274TATACAT+3.07
unc-86MA0926.1chrI:10070059-10070066TGTATAT-3.07
zfh-2MA0928.1chrI:10069699-10069709AAAATTAACA-3.07
Enhancer Sequence
ATATCGTTTA ATGTTTTTGT ACATTTTGAA TATACAAATT GAATTTATCC CCACTGGGAA 60
AGTTGTTTAA ATCACATTTA AACACGTCTA AAAAAAATCT TAAAAATTTG ACTATGAAGC 120
CCCAGAACTG GAAAAATTAA CATTATTTTC ACCCTGAAAT TTAAAAATCT AGACAACAAA 180
TCATTATTTT CAGAATATCA TAAAATTTCC AAAATTCATG AAAGTAAGTT GAATGGGTTT 240
AAGGCAATTC GTGATAAACG AAACAAACAA AAATGATTAT TAGAAGACAA AGAGCAAACG 300
GGAATGGGAG AATATTTGGC CCTCCTCTTT CTTCTCTTTT TCTCCCCCAT ATTCCCGTTC 360
AGTAATGTTT CCCTCTCCCG CAAGAGCATA TAGCACACAG CTACATATAC ACAGATGGCC 420
CCGTTCATTC GGGAGAGCCT CTTTTCCCGT TGCTCTCCGC GTTCCGCGTG CTCTCCGCCT 480
GTTTGTTTCC TATGTATATA TGATTGAACT CTCTCTGCTG CAACCTCTCC CAATAGTCAC 540
AAACCAAAAG CTCTGGCTCC AAACAAAACA GTTTCGGACC TGAATTTTGA GTAAAAGAGA 600
ATACATGGGA AATGTGCACT ATGTGGCTCG TGTAGTTTTG TGGTGTTTTA ACAGCTTCTG 660
TACGATTATG AGCCAATTCA TGAAACACAT TCAAAATTTA TATACATTTG AAATGTTGTG 720
ATTTGTGGGT TGAAGAATAA GGCATGTTCT GAAAGACCGT TCTCGTCCTC CTGATTTTTC 780
GTGATGGGAA AATGGATTAT GACATGGAGC ATTGATTGTA CGATTTCATA TTACTCGCCA 840
GGGAGTAACG TTAACCGGGA AATTGCTAGA AAGCAAAAAA AAGTTAAATC AAATACCAGA 900
TTATGCGTAA ACAGAAAAAG TACCACATTT TAAGACGCAA ACTTTCAGCT TTGGGACAAA 960
GCTTAGCAGG TTCCAAAA 978