EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE003-00042 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_late 
Coordinate
chrI:1558701-1559414 
TF binding sites/motifs
Number: 79             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:1559261-1559271CTTCTTCTCT-3.07
blmp-1MA0537.1chrI:1558786-1558796ATTCATTTTT-3.12
blmp-1MA0537.1chrI:1559284-1559294TCTCTCTCAC-3.13
blmp-1MA0537.1chrI:1559121-1559131TCTCCCCCCC-3.14
blmp-1MA0537.1chrI:1559256-1559266ACTCTCTTCT-3.23
blmp-1MA0537.1chrI:1559386-1559396TTTCGTTTCT-3.27
blmp-1MA0537.1chrI:1559276-1559286TCTCTTTCTC-3.46
blmp-1MA0537.1chrI:1559028-1559038CTTCGATTTT-3.65
blmp-1MA0537.1chrI:1559258-1559268TCTCTTCTTC-3.75
blmp-1MA0537.1chrI:1559380-1559390TTTCTATTTC-3.86
blmp-1MA0537.1chrI:1559282-1559292TCTCTCTCTC-4.46
blmp-1MA0537.1chrI:1559280-1559290TTTCTCTCTC-4.61
ceh-22MA0264.1chrI:1559154-1559164CCACTCCACT+3.98
ceh-48MA0921.1chrI:1558889-1558897TTCGATTA+3.09
ceh-48MA0921.1chrI:1559227-1559235CATCGGTT-3.24
che-1MA0260.1chrI:1559336-1559341GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:1559379-1559384GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:1559390-1559395GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:1559171-1559176AAGCG+3.2
daf-12MA0538.1chrI:1558949-1558963ACGCAGATGCGCAT-3.08
daf-12MA0538.1chrI:1559250-1559264ACACACACTCTCTT-3.46
daf-12MA0538.1chrI:1559248-1559262AGACACACACTCTC-3.71
daf-12MA0538.1chrI:1559246-1559260GAAGACACACACTC-4.14
dsc-1MA0919.1chrI:1558931-1558940TCAATTAAA+3.14
dsc-1MA0919.1chrI:1558931-1558940TCAATTAAA-3.14
dsc-1MA0919.1chrI:1559110-1559119CCAATTACT+3.36
dsc-1MA0919.1chrI:1559110-1559119CCAATTACT-3.36
dsc-1MA0919.1chrI:1559020-1559029TTAATTATC+3.67
dsc-1MA0919.1chrI:1559020-1559029TTAATTATC-3.67
dsc-1MA0919.1chrI:1558828-1558837TTAATTAGT+4.62
dsc-1MA0919.1chrI:1558828-1558837TTAATTAGT-4.62
efl-1MA0541.1chrI:1558921-1558935GTTTTGCGCGTCAA-3.31
efl-1MA0541.1chrI:1558961-1558975ATCGACGGAAAAAT+3.32
elt-3MA0542.1chrI:1558804-1558811TATATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:1558867-1558874GATAAAC-3.21
elt-3MA0542.1chrI:1558838-1558845GATCAGA-3.45
eor-1MA0543.1chrI:1559261-1559275CTTCTTCTCTCTGA-3.33
eor-1MA0543.1chrI:1558968-1558982GAAAAATGCACAGA+3.35
eor-1MA0543.1chrI:1559257-1559271CTCTCTTCTTCTCT-3.59
eor-1MA0543.1chrI:1559267-1559281CTCTCTGAATCTCT-3.82
eor-1MA0543.1chrI:1559275-1559289ATCTCTTTCTCTCT-4.15
eor-1MA0543.1chrI:1559195-1559209TTCTGCGTCTCGCC-4.55
eor-1MA0543.1chrI:1559283-1559297CTCTCTCTCACTGC-4.85
eor-1MA0543.1chrI:1559281-1559295TTCTCTCTCTCACT-4.93
eor-1MA0543.1chrI:1559279-1559293CTTTCTCTCTCTCA-5.16
eor-1MA0543.1chrI:1559269-1559283CTCTGAATCTCTTT-5.33
eor-1MA0543.1chrI:1559277-1559291CTCTTTCTCTCTCT-6.61
eor-1MA0543.1chrI:1559259-1559273CTCTTCTTCTCTCT-6.78
fkh-2MA0920.1chrI:1558822-1558829TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrI:1558996-1559003TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:1559014-1559021TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:1558792-1558799TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrI:1559140-1559147TCAACAA+3.66
hlh-1MA0545.1chrI:1559211-1559221TCATTTGCCC-3.33
lim-4MA0923.1chrI:1559020-1559028TTAATTAT+3.12
lim-4MA0923.1chrI:1559110-1559118CCAATTAC+3.19
lim-4MA0923.1chrI:1558931-1558939TCAATTAA+3.65
lim-4MA0923.1chrI:1558828-1558836TTAATTAG+3.67
lim-4MA0923.1chrI:1559021-1559029TAATTATC-3.71
lim-4MA0923.1chrI:1558829-1558837TAATTAGT-4.52
pal-1MA0924.1chrI:1559021-1559028TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:1558793-1558802TTTTACACT-3.22
pha-4MA0546.1chrI:1558823-1558832ATTTATTAA-3.3
skn-1MA0547.1chrI:1559033-1559047ATTTTCTTCAATTT-4.18
skn-1MA0547.1chrI:1559023-1559037ATTATCTTCGATTT-4.34
sma-4MA0925.1chrI:1558861-1558871CTGTCTGATA+3.11
sma-4MA0925.1chrI:1558755-1558765AGGTCTGGAA+3.45
unc-62MA0918.1chrI:1558851-1558862TTTGACAGCAC-3.65
unc-86MA0926.1chrI:1558826-1558833TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrI:1559018-1559025TATTAAT+3.32
vab-7MA0927.1chrI:1559111-1559118CAATTAC+3.43
vab-7MA0927.1chrI:1559021-1559028TAATTAT-4.09
vab-7MA0927.1chrI:1558829-1558836TAATTAG-4.57
zfh-2MA0928.1chrI:1558931-1558941TCAATTAAAA-3.07
zfh-2MA0928.1chrI:1559110-1559120CCAATTACTA-3.07
zfh-2MA0928.1chrI:1559020-1559030TTAATTATCT-3.53
zfh-2MA0928.1chrI:1559019-1559029ATTAATTATC+3.81
zfh-2MA0928.1chrI:1558828-1558838TTAATTAGTT-3.97
zfh-2MA0928.1chrI:1558827-1558837ATTAATTAGT+4.84
Enhancer Sequence
AGAGGGACGA ATCGAAAATT AAAATAAGAA GATCAAAAAG AAATTTTTTG TGGCAGGTCT 60
GGAATTGTTC GAATTTCCGT TTTAAATTCA TTTTTTACAC TTTTATATCA AAAAAAAAAG 120
TTATTTATTA ATTAGTTGAT CAGAATAAAA TTTGACAGCA CTGTCTGATA AACTGATTTA 180
ATATTTTATT CGATTATTCG CTGCTGCCGC TGAATTACTT GTTTTGCGCG TCAATTAAAA 240
TGCCTTGTAC GCAGATGCGC ATCGACGGAA AAATGCACAG ATTTTGGAAT TTTATTTTTT 300
ATTTAAATAT TATTTTTTAT TAATTATCTT CGATTTTCTT CAATTTAAAC TGCTTTTTTT 360
CGTAGAATTT CTGAAAAATG CAATTTTTTG CAACTTCCAA TTTTCCCTGC CAATTACTAC 420
TCTCCCCCCC GTCGACTCAT CAACAACAAG GGACCACTCC ACTCTGCACG AAGCGGGCTG 480
GCTGGAGGAC ACAGTTCTGC GTCTCGCCGG TCATTTGCCC TCTATTCATC GGTTTTGGAT 540
GTAAGGAAGA CACACACTCT CTTCTTCTCT CTGAATCTCT TTCTCTCTCT CACTGCAGCA 600
CCATCGGCCA AAACGACCTC CCCGCCGTTC GTCTCGTTTC GCTTGTTTCT TCGCACTGCC 660
CCCCGCAGCA ACAGAGTCGT TTCTATTTCG TTTCTGATTT GACGAAAAGA AGG 713